Table 2 Clonal Complexes, MLST, spa types and SE gene profiles of the enterotoxin-positive S. aureus isolates

CC7 (42)

ST7 (39)

t091 (32)

sep (28) sep-sey (2) sec-sel-sep-tsst (4)

t1943 (4)

sep (4)

t796 (1)

sep (1)

t867 (1)

sep (1)

t20241 (1)

sep (1)

ST943 (1)

t091 (1)

sep (1)

ST4367 (1)

t236 (1)

sec-sel-sep-tsst (1)

ST7063(1)

t091 (1)

sec-sel-sep-tsst (1)

CC1 (21)

ST1 (12)

t127 (6)

seh (2) sec-sel-seh (3) sec-sel-seh-sek-seq (1)

t114 (3)

sec-sel-sek-seq-seh-tsst (3)

SCCmec V (3)

t1381 (1)

seh (1)

t1508 (1)

sea-seb-sek-seq (1)

t3324 (1)

sea-sec-sel-seh-sek-seq-tsst (1)

SCCmec V (1)

ST2990 (3)

t091 (3)

sec-sel-sey (3)

ST1920 (2)

t7589 (1)

seh (1)

t2457 (1)

seh (1)

ST493 (1)

t091 (1)

sep (1)

ST573 (1)

t4938 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST848 (1)

t409 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu -tsst (1)

ST5881 (1)

t1407 (1)

seh (1)

CC5 (17)

ST5 (8)

t548 (4)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-seh (1)

t002 (2)

sec-sel-sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (2)

t311 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

SCCmec V (1)

t20441 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST965 (5)

t062 (5)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sea-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (2)

ST950 (1)

t895 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST6427 (1)

t954 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST7563 (1)

t954 (1)

sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST2144 (1)

t1107 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

CC59 (14)

ST59 (14)

t437 (10)

seb-sek-seq-sey (9) sea-seb-sek-seq-sey (1)

SCCmec IVa (7)

t3523 (1)

seb-sek-seq-sey (1)

SCCmec IVa (1)

t3527 (1)

seb-sek-seq-sey (1)

SCCmec IVa (1)

t3590 (1)

seb-sek-seq-sey (1)

SCCmec IVa (1)

t16156 (1)

sea-seb-sek-seq (1)

SCCmec IVa (1)

CC20 (13)

ST2631 (7)

t164 (7)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (7)

ST1281 (4)

t164 (3)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (3)

t996 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1)

ST1921 (1)

t164 (1)

sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey-tsst (1)

ST20 (1)

t3277 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1)

CC6 (13)

ST6 (12)

t701 (11)

sea (10) sea-seb (1)

t20424 (1)

sea (1)

ST1551 (1)

t304 (1)

sea (1)

CC25 (9)

ST25 (8)

t078 (5)

sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (4) sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

t353 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-seh (1)

t1102 (1)

seb-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

t20426 (1)

seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

ST2797 (1)

t081 (1)

seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

CC72 (8)

ST72 (7)

t148 (4)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sec-sel- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-tsst (1)

t901 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

t3092 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

t3169 (1)

sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-tsst (1)

ST544 (1)

t126 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1)

CC88 (7)

ST88 (7)

t2592 (4)

sep (4)

t3622 (1)

sep (1)

SCCmec II (1)

t10777 (1)

sep (1)

t20425 (1)

sep (1)

CC188 (5)

ST188 (4)

t189 (3)

seb (3)

t2883 (1)

seb (1)

ST7562 (1)

t189 (1)

seb (1)

CC8 (3)

ST630 (2)

t377 (1)

sec-sel (1)

t4047 (1)

sey (1)

ST2416 (1)

t024 (1)

sek-seq-sep (1)

CC9 (3)

ST9 (2)

t899 (2)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu -sep-sey (1)

SCCmec IVb (2)

ST2423 (1)

t15045 (1)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1)

CC1148 (3)

ST1148 (3)

t16825 (3)

sep (3)

CC22 (2)

ST22 (2)

t309 (2)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (2)

CC12 (1)

ST12 (1)

t213 (1)

sep (1)

CC15 (1)

ST15 (1)

t2413 (1)

sec-sel-tsst (1)

CC101 (1)

ST101 (1)

t2078 (1)

sep (1)

CC121 (1)

ST946 (1)

t20422 (1)

seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1)

CC398 (1)

ST398 (1)

t1928 (1)

sec-sel (1)

CC522 (1)

ST522 (1)

t5428 (1)

sec-sel-y-tsst (1)

Singletons (3)

ST672 (3)

t4336 (3)

sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3)