Skip to main content

Table 2 In silico comparison of SaQuant to non - S. aureus genomes within the genus Staphylococcus

From: SaQuant: a real-time PCR assay for quantitative assessment of Staphylococcus aureus

Species #Genomes %Negative
S. lentus 8 100
S. fleurettii 5 100
S. vitulinus 9 100
S. felis 22 100
S. hyicus 3 100
S. agnetis 16 100
S. chromogenes 59 100
S. schleiferi 9 100
S. intermedius 4 100
S. delphini 13 100
S. pseudintermedius 130 99
S. massiliensis 2 100
S. carnosus 5 100
S. condimenti 5 100
S. simulans 49 100
S. argensis 3 100
S. pettenkoferi 14 100
S. auricularis 4 100
S. kloosii 3 100
S. arlettae 23 100
S. nepalensis 8 100
S. cohnii 50 100
S. succinus 21 100
S. equorum 44 100
S. xylosus 53 100
S. gallinarum 17 100
S. saprophyticus 88 100
S. hominis 113 100
S. epidermidis 530 100
S. lugdunensis 13 100
S. caprae 11 100
S. capitis 48 100
S. psasteuri 23 100
S. warneri 57 100
S. devriesei 8 100
S. petrasii 5 100
S. haemolyticus 219 100
S. schweitzeri 6 100
S. argenteus 20 100
Othera 114 100
  1. aGenomes did not cluster with other members with the same species designation, suggesting an unreliable species designation