Skip to main content

Table 2 In silico comparison of SaQuant to non - S. aureus genomes within the genus Staphylococcus

From: SaQuant: a real-time PCR assay for quantitative assessment of Staphylococcus aureus

Species

#Genomes

%Negative

S. lentus

8

100

S. fleurettii

5

100

S. vitulinus

9

100

S. felis

22

100

S. hyicus

3

100

S. agnetis

16

100

S. chromogenes

59

100

S. schleiferi

9

100

S. intermedius

4

100

S. delphini

13

100

S. pseudintermedius

130

99

S. massiliensis

2

100

S. carnosus

5

100

S. condimenti

5

100

S. simulans

49

100

S. argensis

3

100

S. pettenkoferi

14

100

S. auricularis

4

100

S. kloosii

3

100

S. arlettae

23

100

S. nepalensis

8

100

S. cohnii

50

100

S. succinus

21

100

S. equorum

44

100

S. xylosus

53

100

S. gallinarum

17

100

S. saprophyticus

88

100

S. hominis

113

100

S. epidermidis

530

100

S. lugdunensis

13

100

S. caprae

11

100

S. capitis

48

100

S. psasteuri

23

100

S. warneri

57

100

S. devriesei

8

100

S. petrasii

5

100

S. haemolyticus

219

100

S. schweitzeri

6

100

S. argenteus

20

100

Othera

114

100

  1. aGenomes did not cluster with other members with the same species designation, suggesting an unreliable species designation