Skip to main content

Table 1 Nitrogen assimilation and tolerance per strain

From: Niche differentiation in nitrogen metabolism among methanotrophs within an operational taxonomic unit

  Methylomonas methanica strains Methylomonas koyamae strains Methylomonas lenta Type Ib Type II
  NCIMB 11130T R-45362 R-45363 R-45364 R-45371 R-45372 R-45374 NCIMB 14606T R-45378 R-45383 R-49799 R-49807 R-45370 R-45377 R-49797 R-45379
NaCl (+NO3 ) 100 mM 100 mM 100 mM 40 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 200 mM 200 mM 100 mM 40 mM
NaCl (+NH4 +) 40 mM 100 mM 100 mM 40 mM 100 mM 40 mM 100 mM 100 mM 100 mM 100 mM 150 mM 100 mM 200 mM 200 mM 100 mM 40 mM
NaNO3 & KNO3 a 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 100 mM 100 mM 40 mM 20 mM
NH4Clb 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 100 mM 40 mM 40 mM 100 mM 40 mM 40 mM 40 mM 100 mM 40 mM
(NH4)2SO4-Nb 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40 mM 40-100 mMc 40 mM 40 mM 100 mM 40 mM 40 mM 40 mM 100 mM 40 mM
NaNO2 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 2 mM 5 mM -
Hydroxylamined 1 mM - 1 mM 1 mM 1 mM 1 mM - 1 mM - - 1 mM - - - - 1 mM
nifH presence + + + + + + + + + + + + + + - +
N2 fixatione + + + + + + + + + + + - - - - +
  1. Values represent maximum concentration supporting growth of the culture (n = 2).
  2. aFor nitrate as sole nitrogen source, 2, 10, 20, 40, 150 and 200 mM with NaNO3 and KNO3 were tested. Due to a technical error, strains R-49799, R-49807, R-45370, R-45377, R-49797 and R-45379 were not tested with KNO3 concentrations above 10 mM.
  3. bFor ammonium as sole nitrogen source, 2, 10, 20, 40, 150 and 200 mM NH4Cl and (NH4)2SO4-N were tested.
  4. cDifferent outcome for duplicates;
  5. dHydroxylamine tolerance was evaluated in dAMS supplemented with 0.01, 1 and 2 mM hydroxylamine;
  6. eUnder low O2 tension only: +, positive and -, negative for growth based on OD600nm values in nitrogen-free medium.