Table 2 PCR programs for detecting quorum-sensing genes in P. aeruginosa clinical isolates
Target gene | Initial denaturation (Temperature /time) | Denaturation (Temperature /time) | Annealing (Temperature /time) | Extension (Temperature /time) | Final extension (Temperature /time) | Cycle |
|---|---|---|---|---|---|---|
rhlI | 96 °C/3 min | 96 °C/40 s | 55 °C/1 min | 72 °C/90 s | 72 °C/10 min | 35 |
rhlR | 96 °C/3 min | 96 °C/45 s | 55 °C/55 s | 72 °C/85 s | 72 °C/10 min | 35 |
lasI | 94 °C/5 min | 94 °C/1 min | 56 °C/1 min | 72 °C/1 min | 72 °C/8 min | 32 |
lasR | 94 °C/5 min | 95 °C/1 min | 56 °C/50 s | 72 °C/1 min | 72 °C/8 min | 32 |