Table 1 Detected species and their frequency during the first 2 years of the infant

Family/Species

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

T

Clostridiaceae

Clostridium baratii

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2

2

Clostridium butyricum

8

-

-

3

14

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2

-

28

Clostridium disporicum

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

4

-

-

-

-

-

-

-

-

5

Clostridium jeddahense

-

-

5

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

5

Clostridium paraputrificum

-

-

1

1

-

10

17

15

10

-

8

3

-

-

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

66

Clostridium perfringens

26

19

-

-

11

-

-

2

-

-

-

-

11

10

2

-

-

9

-

-

8

-

12

3

113

Clostridium ramosum

-

-

-

-

-

3

-

3

-

10

3

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2

21

Clostridium tertium

-

3

1

18

-

12

4

-

13

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

52

Paraclostridium bifermentans

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

2

3

Lachnospiraceae

Clostridium symbiosum

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

4

5

3

6

6

2

1

6

5

2

40

Eisenbergiella tayi

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

-

3

-

4

Enterocloster aldenensis

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

Enterocloster bolteae

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

Ruminococcus gnavus

-

-

-

-

-

-

-

6

-

-

-

5

-

-

-

8

1

-

1

-

-

-

1

-

22

Oscillospiraceae

Flavonifractor plautii

-

2

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

3

Peptostreptococcaceae

Clostridioides difficile

-

4

7

2

-

3

3

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

19

Eubacterium tenue

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

3

8

11

10

7

5

3

-

47

Intestinibacter bartlettii

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

1

2

-

-

-

-

-

-

-

-

-

4

Paeniclostridium sordellii

-

-

-

-

1

-

-

-

-

-

-

-

-

-

1

-

-

-

-

-

-

2

1

-

5

Other detected taxa*

-

2

5

4

-

-

3

1

-

-

1

3

3

2

8

2

9

-

-

7

1

3

-

2

56

Co-cultures

-

5

13

7

1

6

3

3

6

9

14

9

5

9

12

7

9

3

3

8

5

4

4

7

152

Unidentified^‡

1

1

2

2

-

1

1

1

-

9

16

14

7

3

2

15

3

5

23

14

11

9

6

14

160

Total isolates

35

36

35

37

27

33

31

34

29

29

42

34

30

25

32

41

28

31

45

41

33

29

37

35

809