Table 2 Different virulence gene combinations detected in isolates

Vibrio cholerae

Brackish Water

hyla,rtxA,rtxC

3

SKR (2), PA7 (1)

ompU,hylA,rtxA,rtxC

2

SKR

toxR,hylA,rtxA,rtxC

5

PA7 (3), SKR (2)

toxR,ompU,hylA,rtxA,rtxC

2

SKR

toxR,ompU,rtxA,rtxC

1

SKR

toxR,rtxA,rtxC

2

EL5

vpi,toxR,ompU,hylA,rtxA,rtxC

2

SKR

vpi,toxR,tcp,hylA,rtxA,rtxC

2

SR

Zot,vpi,toxR,ompU,hylA,rtxA,rtxC

1

SR

Freshwater

hylA

1

EL3

hylA,rtxA,rtxC

5

PA6

ompU,hylA,rtxA,rtxC

5

PA5 (2), PA6 (3)

ompU,rtxA,rtxC

1

PA4(1)

toxR

3

PA2 (1), PA3 (2)

toxR,hylA,rtxA,rtxC

8

PA5 (6), PA6 (2)

toxR,ompU,hylA,rtxA,rtxC

27

EL4 (3), PA1 (1), PA3 (1), PA4 (2), PA5 (5), PA6 (15)

toxR,rtxA,rtxC

2

PA5

vpi,hylA,rtxA,rtxC

2

PA2 (1), PA4 (1)

vpi,ompU,hylA,rtxA,rtxC

1

PA6

vpi,rtxA,rtxC

1

PA4

vpi,tcp,hylA,rtxA,rtxC

2

PA5

vpi,toxR,hylA,rtxA,rtxC

7

PA5 (2), PA6 (5)

vpi,toxR,ompU,hylA,rtxA,rtxC

4

PA2 (2), PA4 (1), PA6 (1)

vpi,toxR,ompU,tcp,hylA,rtxA,rtxC

1

PA5

vpi,toxR,tcp,hylA,rtxA,rtxC

4

PA5

Vibrio mimicus

Brackish Water

vpi,rtxA,rtxC

2

EL5 (1), EL6 (1)

toxR,rtxA,rtxC

1

EL6 (1)

Freshwater

ompU

2

EL2

ToxR

1

PA3

vpi,hylA,rtxA,rtxC

2

PA4

vpi,ompU

2

PA2 (1), EL2 (1)

vpi,ompU,rtxA,rtxC

3

PA3 (1), PA5 (2)

vpi,toxR

1

EL1

vpi,toxR,hylA,rtxA,rtxC

2

PA4

Vibrio alginolyticus

Brackish

tdh,vgrg,hcp

1

EL6

tlh,tdh,trh

1

SKR

tlh,tdh,vpc,vgrg,hcp

6

EL5(4),EL6(1),SKR(1)

tlh,trh,vgrg,hcp

2

EL6

tlh,vgrg,hcp

11

EL5(3), EL6(7),PA7(1)

tlh,vgrg,hcp,vpi

5

EL6

tlh,vpc

1

SKR

tlh,vpc,vgrg,hcp

16

PA7 (1), SR (8), SKR (7)

tlh,vpc,vgrg,hcp,vpi

10

SKR (1), SR (10)

vgrg,hcp

2

EL6

vpc,vgrg,hcp

2

SKR

Freshwater

tlh,trh

1

PA4

Vibrio parahaemolyticus

Brackish

tlh

2

SKR

tlh,vgrg,hcp

1

EL5

tlh,vgrg,hcp,vpi

3

EL6 (2),PA7 (1)

tlh,vpc,vgrg,hcp

5

SKR (1), SR (4)

tlh,vpc,vgrg,hcp,vpi

1

SKR

tlh,vpc,vpi

3

SKR

vop,vgrg,hcp

1

PA7

Freshwater

tdh

1

ALD2