Table 3 Assembled table of notable pathogenic species and their prevalence in early and late timepoints

Pseudomonas aeruginosa

37

0

Y

Y

Mycoplasma lipophilium

7

23

Mycoplasma hyorhinisis

202

1

Y

Streptococcus agalactiae

21

0

Y

Y

Streptococcus dysgalactiae

4137

2

Y

Y

Streptococcus bovis

13,431

125

Y

Streptococcus sanguinis

0

77

Y

Streptococcus suis

6585

1

Y

Actinobacillus pleuropheumoniae

15,208

78

Y

Leptospira licerisiae

186

9

Y

Parachlamydia acanthamoebae

24

0

Y

Y

Bacillus anthracis

69

12

Y

Y

Bacillus cereus

1559

6

Y

Bacillus subtilis

92

0

Y

Clostridium botulinum

304

831

Y

Y

Clostridium perfringens

71,053

26,675

Y

Salmonella enterica

352

0

Y

Y

Francisella hispaniensis

23

42

Y

Moraxella catarrhalis

40

2

Y

Acinetobacter baumannii

38,699

87

Y

Actinomyces hyovaginalis

3033

16

Y

Serratia marcescens

117

20

Y

Enterococcus faecium

101

5

Y