Skip to main content

Table 2 Identification results with percent probability or confidence factor of single wrong identification or multiple identifications in three phenotypic systems

From: Comparison of the MicroScan, VITEK 2, and Crystal GP with 16S rRNA sequencing and MicroSeq 500 v2.0 analysis for coagulase-negative Staphylococci

 

MicroSeq 500

MicroScan

VITEK2

Cystal GP

M102

S. epidermidis

S. epidermidis 91.36%

S. epidermidis 97.10%

S. intermedius

M104

S. epidermidis

S. xylosus 95.12%

S. epidermidis 99.00%

S. epidermidis

M106

S. epidermidis

S. aureus 87.13%

S. epidermidis 99.00%

S. epidermidis

M107

S. capitis

S. simulans 88.95%

S. capitis 98.78%

S. capitis

M112

S. epidermidis

S. epidermidis 99.99%

S. epidermidis 99.00%

K. sedentarius

M117

S. lugdunensis

S. haemolyticus 90.39%

S. lugdunensis 99.00%

Nonidentification

M118

S. lugdunensis

S. haemolyticus 96.86%

S. lugdunensis 90.37%

S. haemolyticus

M120

S. hominis

S. hominis 94.57%

S. hominis 95.00%

Nonidentification

M123

S. epidermidis

S. epidermidis 98.20%

S. hominis, S. epidermidis, A. viridans 33.82%, 33.09%, 33.09%

S. epidermidis

M124

S. epidermidis

S. epidermidis 99.25%

S. hominis, S. epidermidis 50.27%, 49.73%

Nonidentification

M125

S. epidermidis

S. epidermidis 98.20%

S. hominis, S. epidermidis 50.27%, 49.73%

S. epidermidis

M126

S. epidermidis

S. epidermidis 99.99%

S. hominis, S. epidermidis, A. viridans 33.71%, 33.33%, 32.96%

S. epidermidis

M127

S. epidermidis

S. epidermidis 99.99%

S. hominis, S. epidermidis 50.28%, 47.92%

S. epidermidis

M128

S. hominis

S. hominis 94.58%

S. hominis 94.86%

S. saprophyticus

M130

S. capitis

S. epidermidis 90.20%

S. capitis 92.00%

S. capitis

M137

S. epidermidis

S. epidermidis 95.28%

S. hominis, S. epidermidis 50.56%, 49.44%

S. epidermidis

M138

S. capitis

S. capitis 95.28%

S. capitis 98.86%

S. auricularis

M139

S. capitis

S. capitis 99.60%

S. capitis 98.86%

S. hominis

M141

S. epidermidis

S. epidermidis 99.99%

S. epidermidis 98.16%

S. hominis

M149

S. capitis

S. epidermidis 90.20%

S. capitis 92.00%

S. capitis

M153

S. hominis

S. hominis 97.44%

S. hominis 99.00%

Nonidentification

M154

S. hominis

S. hominis 94.62%

S. hominis 98.35%

Nonidentification

M155

S. hominis

S. hominis 97.44%

S. hominis 97.21%

S. warneri, S. saprophyticus 0.5574, 0.4415

M156

S. hominis

S. hominis 95.00%

S. hominis 97.00%

S. saprophyticus

M157

S. warneri

S. warneri, S. cohnii, S. capitis, etc. 60.92%, 15.78%, 12.67%.

S. cohnii, S. vitulinus 50.54%, 49.46%

S. warneri

M158

S. warneri

S. warneri 90.92%

S. cohnii 90.54%

S. warneri

M160

S. hominis

S. hominis, S. capitis, S. warneri, etc. 37.58%, 24.33%, 20.21%.

S. hominis 93.79%

Nonidentification

M161

S. hominis

S. hominis 94.57%

S. hominis 96.98%

S. saprophyticus

M162

S. caprae

S. hominis 92.35%

S. auricularis 90.40%

S. saprophyticus

M163

S. hominis

S. hominis 98.82%

S. hominis 98.50%

Nonidentification

M166

S. hominis

S. hominis 85.00%

S. hominis 98.82%

Nonidentification

M167

S. hominis

S. hominis 93.05%

S. caprae 96.97%

S. caprae

M176

S. simulans

S. simulans 96.77%

S. simulans, S. warneri 50.28%, 49.72%

S. simulans

M17

S. hominis

S. simulans 99.09%

S. haemolyticus 96.74%

S. haemolyticus

M179

S. hominis

S. epidermidis, S. hominis 68.34%, 31.66%

S. hominis 94.88%

Nonidentification

M180

S. hominis

S. hominis 92.77%

S. hominis 93.56%

S. warneri

M181

S. hominis

S. hominis 92.77%

S. hominis, S. warneri 50.27%, 49.73%

S. warneri

M182

S. hominis

S. hominis 94.57%

S. hominis 95.00%

Nonidentification

M183

S. hominis

S. hominis 88.68%

S. hominis 91.00%

S. saprophyticus

M184

S. hominis

S. hominis 92.13%

S. hominis 99.00%

S. intermedius

M185

S. hominis

S. hominis 96.01%

S. hominis 96.81%

S. capitis

M186

S. hominis

S. hominis 98.50%

S. hominis 95.00%

S. aureus, S. intermedius

M187

S. hominis

S. hominis 98.50%

S. hominis 99.00%

Nonidentification

M203

S. hominis

S. hominis 97.44%

S. hominis 97.27%

S. cohnii

M205

S. warneri

S. warneri, S. capitis, S. hominis 86.37%, 7.96%, 5.67%

S. saphrophyticus 98.03%

S. warneri

M207

S. lugdunensis

S. haemolyticus 98.08%

S. lugdunensis 99.00%

S. lugdunensis

M208

S. haemolyticus

S. haemolyticus, S. simulans, S. warneri 54.38%, 41.97%, 3.66%

S. haemolyticus 94.74%

S. haemolyticus

M209

S. hominis

S. hominis 97.44%

S. hominis 97.76%

S. cohnii

M210

S. cohnii

S. cohnii, S. xylosus 67.28%, 29.12%

S. cohnii 99.00%

S. cohnii

M211

S. caprae

S. aureus, S. capitis 69.87%, 29.25%

S. caprae 98.60%

S. intermidius

M212

S. capitis

S. capitis 99.11%

S. capitis 98.56%

S. vitulus

M213

S. warneri

S. auricularis, S. hominis, S. warneri 45.13%, 27.55%, 24.55%

S. warneri 95.00%

S. warneri

M214

S. lugdunensis

S. lugdunensis 98.81%

S. lugdunensis 95.00%

S. simulans

M215

S. caprae

S. capitis, S. aureus 62.82%, 35.76%

S. caprae 99.00%

S. cohnii

M216

S. hominis

S. hominis 97.44%

S. hominis 97.76%

M. kristinae

M221

S. lugdunensis

S. lugdunensis, S. haemoiyticus, S. hominis 62.62%, 28.34%, 9.04%

S. lugdunensis, S. warneri 50.00%, 50.00%

S. lugdunensis

M222

S. lugdunensis

S. lugdunensis 96.30%

S. lugdunensis 91.26%

S. simulans

M224

S. cohnii

S. xylosus 91.70%

S. cohnii 99.00%

S. cohnii

M225

S. caprae

S. warneri, S. simulans, S. epidermidis 70.19%, 13.84%, 12.32%

S. caprae 99.00%

S. capitis