Table 3 Results of the Lac663 and Gard162 probes specificity test in artificial mixed samples
Species in the artificial mixed samples | Bacteria strain collection codes | Multiplex PNA-FISH assay | |
|---|---|---|---|
Lac663 Probe efficiency | Gard162 Probe efficiency | ||
L. pentosus; | CECT 4023T; - | ++++ | ++++ |
G. vaginalis 51 | |||
L. casei; | CECT 5275T; - | ++++ | ++++ |
G. vaginalis 101 | |||
L. rhamnosus; | CECT 288T; - | ++++ | ++++ |
G. vaginalis AMD | |||
L. crispatus; | ATCC 33820T; - | ++++ | ++++ |
G. vaginalis ATCC | |||
L. delbrueckii sub. delbrueckii; Atopobium vaginae | ATCC 9649T; CCUG 38953T | +++ | - |
L. acidophilus; | ATCC 4356T; CCUG 42099T | ++++ | - |
A. vaginae | |||
L. gasseri; | ATCC 9857T; CCUG 44116T | ++++ | - |
A. vaginae | |||
L. paracasei sub. paracasei; | CCUG 27320T; - | +++ | −/+ |
L. lactis 53 | |||
L. rhamnosus; | ATCC 7469T; CECT 410T | ++++ | - |
E. faecium | |||
L. reuteri; | NCFB 2656T; | +++ | - |
E. coli O157:H7 | NCTC 12900T | ||
S. aureus; | CECT 976T; - | - | ++++ |
G. vaginalis 51 | |||
Shigella; | ATCC 12022T; - | - | ++++ |
G. vaginalis 101 | |||
L. seeligeri; | CECT 917T; - | - | ++++ |
G. vaginalis AMD | |||
E. aerogenes; | CECT 684T; - | - | ++++ |
G. vaginalis ATCC | |||
L. pentosus; | CECT 4023T; | ++++ | ++++ |
G. vaginalis ATCC; | -; | ||
E. faecalis | CECT 184T | ||
L. casei; | CECT 5275T; | ++++ | ++++ |
G. vaginalis AMD; | -; | ||
A. vaginae | CCUG 38953T | ||
L. rhamnosus; | CECT 288T; | ++++ | ++++ |
G. vaginalis 101; | -; | ||
A. vaginae | CCUG 42099T | ||
L. crispatus; | ATCC 33820T; | ++++ | ++++ |
G. vaginalis 51; | -; | ||
A. vaginae | CCUG 44116T | ||
L. casei; | CECT 5275T; | ++++ | - |
L. mesenteroides; | -; | ||
A. vaginae | CCUG 38953T | ||