Bacterial species/group (accession) | Air | MAP | |||||||||||||||||||
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d0 | d6 | d13 | d15 | d7 | d13 | d21 | d28 | ||||||||||||||
- | 0°C | -2°C | -2°C | 0°C | -2°C | -4°C | -2°C | -4°C | 0°C | -2°C | -4°C | -4°C | -2°C | 0°C | -4°C | -2°C | -2°C | -4°C | |||
- | LS | LS | HS | LS | LS | LS | HS | HS | LS | LS | LS | HS | HS | LS | LS | HS | LS | HS | |||
Photobacterium phosphoreum (DQ099331) | - | 91 | 61 | 60 | 95 | 93 | 83 | 88 | 7 | 97 | 100 | 100 | 53 | 100 | 100 | 100 | 95 | 100 | 91 | ||
Photobacterium indicum (AY771742) | - | - | - | - | - | - | - | - | 79 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Photobacterium profundum (CR378665) | - | - | - | - | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Sphingomonas spp. (EF462462) | 42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Bradyrhizobium spp. (AB291825) | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Pseudomonas spp. (various accession)1 | 2 | 2 | - | - | 5 | - | 10 | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | ||
Pseudomonas fluorescens (EF424136) | 36 | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Pseudomonas tolaasii (EF111117) | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Acinetobacter spp. (AF500327) | - | 2 | 2 | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | ||
Variovorax sp. (EF471221) | 11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||
Janthinobacterium lividum (EF204211) | - | - | 11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | ||
Psychrobacter spp. (AM491457) | - | - | 20 | 2 | - | - | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Psychrobacter arcticus (CP000082) | - | - | - | - | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Vibrio logei (AY771721) | - | - | - | 18 | - | - | 2 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | - | - | ||
Moritella spp. (various accession)2 | - | - | - | 2 | - | - | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Moritella marina (AB038033) | - | - | - | 11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Shewanella spp. (AB183502) | - | - | - | 4 | - | 2 | - | - | 2 | - | - | - | 3 | - | - | - | 2 | - | - | ||
Shewanella benthica (AB008796) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | ||
Pseudoalteromonas spp. (EF156750) | - | - | - | 2 | - | 2 | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Uncultured bacterium (EF378155) | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||
Chryseobacterium spp. (AY536547) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 20 | - | - | - | - | - | - | ||
Flavobacterium sp. (various accession)3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 10 | - | - | - | - | - | 2 | ||
Acidovorax spp. (AM286541) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | ||
Uncultured alpha proteobacterium (AB074649) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | ||
Massilia aurea (AM231588) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | ||
Total sequences analysed | 45 | 46 | 44 | 45 | 42 | 45 | 42 | 41 | 42 | 39 | 42 | 47 | 40 | 37 | 46 | 42 | 42 | 48 | 46 | ||
Coverage (C) | 98 | 91 | 98 | 93 | 100 | 93 | 93 | 100 | 95 | 97 | 100 | 100 | 88 | 100 | 100 | 100 | 95 | 100 | 96 |