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Table 2 Amino acid changes in the QRDRs, MICs and PMQR determinants of 43 fluoroquinolone-resistance E. coli isolates

From: Molecular characteristics of fluoroquinolone-resistant Escherichia coli isolated from suckling piglets with colibacillosis

O Serogroupa

PMQR genesb

QRDR mutations

 

MICs (mg/mL)

gyrA

parC

CIP

ENR

NOR

O2

qnrS

S83L

WT

 

4

8

8

O8

-

S83L/D87E

WT

8

16

16

O8

-

S83L/D87N

S80I

16

32

32

O9

-

S83L

S80W

16

64

32

O11

-

S83L/D87N

S80I/E84A

64

256

256

O11

-

S83L/D87N

S80I

16

64

256

O14

qnrS

S83L

WT

8

16

16

O27

-

S83L/D87N

S80I

16

64

256

O27

qepA

S83L

S80N

16

64

32

O78

-

S83L, D87N

S80I

8

16

32

O101

-

S83L, D87N

S80I

8

16

16

O101

-

S83L, D87N

S80I

16

64

128

O101

-

S83L, D87N

S80I, E84A

64

128

256

O116

-

S83L

S80I

4

16

8

O119

-

S83L

S80I

8

32

32

O127

-

S83L, D87N

S80I, E84A

64

256

256

O127

-

S83L, D87N

S80I

16

64

32

O127

aac(6’)-Ib-cr

S83L, D87N

S80I

32

128

256

O147

-

S83L, D87N

S80K

16

32

32

O149

aac(6’)-Ib-cr

S83L

A56C, S57Q, S80R

32

64

64

O149

-

S83L, D87G

S80K

8

32

16

O149

aac(6’)-Ib-cr

S83L, D87E

WT

16

32

32

O149

-

S83L

E84G

16

64

128

O149

aac(6’)-Ib-cr

S83L

S80R

8

16

32

O149

aac(6’)-Ib-cr

S83L

S80R

8

32

32

O149

-

S83L, D87N

S80I

16

32

32

O149

-

S83L

S80R

8

32

16

O149

aac(6’)-Ib-cr

S83L, D87N

S80I, E84A

256

512

512

O149

qnrS

S83L

S80R

4

16

16

O149

-

S83L

S80R

4

16

8

O149

-

S83L, D87N

S80I

8

16

8

O157

-

S83L, D87N

S80K

8

16

16

O159

qepA

S83L, D87N

S80I

16

128

256

O167

-

S83L, D87N

S80I

16

64

16

O167

-

S83L

S80I

4

8

8

O182

-

S83L, D87G

S80R

8

32

16

ONT

-

S83L, D87N

S80I

16

32

16

ONT

-

S83L, D87N

S80I

16

64

128

ONT

aac(6’)-Ib-cr

S83L, D87N

S80I

32

128

256

ONT

-

S83L, D87G

S80I

8

16

16

ONT

-

S83L, D87N

S80R

8

8

16

ONT

-

S83L, D87G

S80R

8

16

16

ONT

-

S83L, D87G

S80I, E84A

64

128

256

  1. PMQR Plasmid-mediated quinolone resistance, QRDR Quinolone-resistance determining region, WT Wild type, MICs Minimum inhibitory concentrations, CIP Ciprofloxacin, ENR Enrofloxacin, NOR Norfloxacin
  2. aONT, not detected
  3. b-, not detected