Skip to main content

Table 2 Discriminant peak list derived from 130 pneumococcal isolates, comprising 16 serotypes + non-typeable (NT) isolates

From: MALDI-TOF mass spectrometry for sub-typing of Streptococcus pneumoniae

Peak (m/z) FDRa q-value Serotype
1 6A 6B 11A 13 14 15A 15B 15C 18C 19F 19A 23F 23A 34 35B NT
3384.45 0.02093 1.00 0.00 0.14 0.14 0.29 0.29 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.08 0.00 0.20 0.20 0.00
3529.99 0.00714 0.40 0.33 0.14 0.71 0.00 0.14 0.20 0.80 0.80 0.00 0.20 0.71 0.08 0.60 0.40 0.00 0.64
3538.70 0.03434 0.20 0.11 0.05 0.00 0.57 0.43 0.20 0.00 0.00 0.80 0.00 0.14 0.08 0.00 0.00 0.00 0.14
4018.95 0.00000 0.00 0.11 0.09 0.14 0.00 0.57 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00
4198.34 0.00714 1.00 0.44 0.64 0.86 0.57 0.14 0.20 0.20 0.00 0.00 0.20 0.29 0.58 1.00 0.00 0.60 0.50
4212.94 0.00000 0.00 0.00 0.05 0.14 0.14 0.43 0.20 0.60 0.80 0.60 0.80 0.71 0.17 0.00 1.00 0.20 0.21
4774.71 0.00000 0.00 0.11 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
4973.01 0.00000 1.00 0.11 0.09 0.14 0.71 0.29 0.40 0.40 0.00 0.00 1.00 0.71 0.75 0.60 0.00 0.20 0.43
5062.44 0.02093 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.57 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
6509.37 0.00000 1.00 0.33 0.14 0.14 0.57 0.43 0.60 0.00 0.00 0.00 0.40 0.86 0.17 0.20 0.40 0.00 0.07
7061.16 0.00000 1.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07
8039.25 0.01963 0.00 0.11 0.00 0.14 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.60 0.00 0.20 0.00
8396.71 0.00000 1.00 0.67 0.55 0.71 0.71 0.14 0.40 0.40 0.00 0.00 0.20 0.14 0.67 1.00 0.00 0.60 0.71
8426.29 0.00000 0.00 0.00 0.05 0.00 0.14 0.57 0.40 0.40 0.80 1.00 0.80 0.71 0.25 0.00 1.00 0.20 0.21
9548.41 0.00000 0.00 0.11 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.07
10,121.74 0.02093 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.57 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
  1. The number in each cell summarises the proportion of isolates of the serotype with the corresponding mass peak. aFalse discovery rate.