Skip to main content

Table 2 Discriminant peak list derived from 130 pneumococcal isolates, comprising 16 serotypes + non-typeable (NT) isolates

From: MALDI-TOF mass spectrometry for sub-typing of Streptococcus pneumoniae

Peak (m/z)

FDRa q-value

Serotype

1

6A

6B

11A

13

14

15A

15B

15C

18C

19F

19A

23F

23A

34

35B

NT

3384.45

0.02093

1.00

0.00

0.14

0.14

0.29

0.29

0.00

0.00

0.00

0.20

0.00

0.00

0.08

0.00

0.20

0.20

0.00

3529.99

0.00714

0.40

0.33

0.14

0.71

0.00

0.14

0.20

0.80

0.80

0.00

0.20

0.71

0.08

0.60

0.40

0.00

0.64

3538.70

0.03434

0.20

0.11

0.05

0.00

0.57

0.43

0.20

0.00

0.00

0.80

0.00

0.14

0.08

0.00

0.00

0.00

0.14

4018.95

0.00000

0.00

0.11

0.09

0.14

0.00

0.57

0.20

0.00

0.00

0.00

0.00

0.14

0.00

0.80

0.00

0.60

0.00

4198.34

0.00714

1.00

0.44

0.64

0.86

0.57

0.14

0.20

0.20

0.00

0.00

0.20

0.29

0.58

1.00

0.00

0.60

0.50

4212.94

0.00000

0.00

0.00

0.05

0.14

0.14

0.43

0.20

0.60

0.80

0.60

0.80

0.71

0.17

0.00

1.00

0.20

0.21

4774.71

0.00000

0.00

0.11

0.05

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

4973.01

0.00000

1.00

0.11

0.09

0.14

0.71

0.29

0.40

0.40

0.00

0.00

1.00

0.71

0.75

0.60

0.00

0.20

0.43

5062.44

0.02093

0.00

0.00

0.05

0.00

0.00

0.57

0.20

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

6509.37

0.00000

1.00

0.33

0.14

0.14

0.57

0.43

0.60

0.00

0.00

0.00

0.40

0.86

0.17

0.20

0.40

0.00

0.07

7061.16

0.00000

1.00

0.00

0.00

0.00

0.14

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.14

0.00

0.00

0.00

0.00

0.07

8039.25

0.01963

0.00

0.11

0.00

0.14

0.00

0.57

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.14

0.00

0.60

0.00

0.20

0.00

8396.71

0.00000

1.00

0.67

0.55

0.71

0.71

0.14

0.40

0.40

0.00

0.00

0.20

0.14

0.67

1.00

0.00

0.60

0.71

8426.29

0.00000

0.00

0.00

0.05

0.00

0.14

0.57

0.40

0.40

0.80

1.00

0.80

0.71

0.25

0.00

1.00

0.20

0.21

9548.41

0.00000

0.00

0.11

0.05

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.07

10,121.74

0.02093

0.00

0.00

0.05

0.00

0.00

0.57

0.20

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

  1. The number in each cell summarises the proportion of isolates of the serotype with the corresponding mass peak. aFalse discovery rate.