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Table 1 Characteristics of 130 pneumococcal isolates used to determine overall serotype discriminatory ability of MALDI-TOF

From: MALDI-TOF mass spectrometry for sub-typing of Streptococcus pneumoniae

Serotype Isolates GPSC (n) MLST (n)a
1 5 2 (5) 217 (5)
6A 9 6 (1), 23 (1) 47 (1), 87 (1), 623 (3), 625 (2) 27 ~ (1), 95 (1), 166 (1), 315 (1), 5421 (1), 5421 ~ (1), 5963 (1), 6334 ~ (1)
6B 22 9 (1), 23 (7), 37 (1), 40 (1), 47 (3), 87 (1), 180 (5), 623 (1), 625 (1), 796 (1) 27 ~ (1), 63 (1), 90 (1), 90 ~ (1), 95 (1), 95 ~ (1), 101 ~ (1), 292 ~ (1), 315 (1), 357 ~ (1), 2528 ~ (1), 2642 ~ (1), 2782 ~ (1), 3234 ~ (1), 3246 (1), 3815 ~ (1), 4966 (1), 5421 ~ (1), 5456 ~ (1), 6046 (1), 6917 (1), 10,060 (1)
11A 7 6 (2), 9 (1), 22 (1), 23 (1), 73 (1), 626 (1) 95 (1), 99 (1), 166 (1), 166 ~ (1), 782 (1), 4440 ~ (1), 5681 ~ (1)
13 7 134 (3), 320 (2), 295 (1), 637 (1) 734 ~ (1), 1260 (1), 4389 ~ (1), 5210 ~ (1), 7539 ~ (1), 10,374 (1), 10,374 ~ (1)
14 7 9 (6), 28 (1) 63 (1), 63 ~ (1), 782 (1), 782 ~ (2), 1914 ~ (1), 4396 (1)
15A 5 9 (2), 69 (2), 222 (1) 3058 ~ (2), 3130 ~ (1), 4561 (1), 8152 (1)
15B 5 10 (1), 48 (3), 230 (1) 230 ~ (1), 1961 (1), 1961 ~ (2), 10,086 ~ (1)
15C 5 48 (5) 1961 (2), 1961 ~ (3)
18C 5 16 (3), 142 (2) 3180 ~ (3), 3594 (2)
19A 7 1 (4), 10 (1), 23 (1), 798 (1) 95 (1), 230 (1), 236 ~ (1), 320 (1), 320 ~ (1), 2267 (1), 4927 (1)
19F 5 1 (4), 624 (1) 236 (1), 236 ~ (1), 2694 ~ (1),7758 ~ (1), 9050 (1)
23A 5 5 (1), 40 (1), 626 (3) 388 ~ (1), 5681 (1), 5681 ~ (1), 8011 ~ (2)
23F 12 1 (1), 10 (1), 14 (1), 16 (1), 20 (1), 222 (2), 624 (4), 626 (1) 81 (1), 230 (1), 243 ~ (1), 271 ~ (1), 4639 (1), 5681 ~ (1), 8152 (1), 8152 ~ (1), 9050 (1), 9050 ~ (1), 10,637 (1), 10,637 ~ (1)
34 5 45 (5) 1439 (4), 1439 ~ (1)
35B 5 13 (2), 59 (1), 147 (1), 671 (1) 473 (1), 473 ~ (1), 558 (1), 12,641 ~ (1), 5532 ~ (1)
NT 14 60 (2), 319 (1), 397 (1), 628 (4), 795 (1), 800 (1), 805 (1), NAb (3) 41 ~ (1), 448 (1), 725 ~ (1), 954 ~ (1), 1993 ~ (1), 2337 ~ (1), 6666 ~ (1), 7022 ~ (1), 8966 (1), 10,383 ~ (1), 10,500 (1), NAb (3)
  1. a "~" following a ST denotes a single-locus variant of that ST (i.e. 6/7 loci match). b Not available