Table 2 Sequences of capsular primers
Primer | Sequence | Amplicon size (bp) | Reference |
|---|---|---|---|
23 F | 5′-GTAACAGTTGCTGTAGAGGGAATTGGCTTTTC-3′ 5′-CACAACACCTAACACACGATGGCTATATGATTC-3’ | 384 | [44] |
19F | 5’-GTTAAGATTGCTGATCGATTAATTGATATCC-3′ 5′-GTAATATGTCTTTAGGGCGTTTATGGCGATAG-3’ | 304 | |
4 | 5’-CTGTTACTTGTTCTGGACTCTCGATAATTGG-3′ 5′-GCCCACTCCTGTTAAAATCCTACCCGCATTG-3’ | 430 | |
6A/B | 5’-AATTTGTATTTTATTCATGCCTATATCTGG-3′ 5′-TTAGCGGAGATAATTTAAAATGATGACTA-3’ | 250 | |
14 | 5’-CTTGGCGCAGGTGTCAGAATTCCCTCTAC-3′ 5′-GCCAAAATACTGACAAAGCTAGAATATAGCC-3’ | 208 | |
19A | 5’-GTTAGTCCTGTTTTAGATTTATTTGGTGATGT-3′ 5′-GAGCAGTCAATAAGATGAGACGATAGTTAG-3’ | 478 | |
3 | 5’-ATGGTGTGATTTCTCCTAGATTGGAAAGTAG-3′ 5′-CTTCTCCAATTGCTTACCAAGTGCAATAACG-3’ | 371 | |
15A | 5’-ATTAGTACAGCTGCTGGAATATCTCTTC-3′ 5′-GATCTAGTGAACGTACTATTCCAAAC-3’ | 434 | |
15B/C | 5’-TTGGAATTTTTTAATTAGTGGCTTACCTA-3′ 5′-CATCCGCTTATTAATTGAAGTAATCTGAACC-3’ | 496 | |
1 | 5’-CTCTATAGAATGGAGTATATAAACTATGGTTA-3′ 5′-CCAAAGAAAATACTAACATTATCACAATATTGGC-3’ | 280 | |
11A | 5’-GGACATGTTCAGGTGATTTCCCAATATAGTG-3′ 5′-GATTATGAGTGTAATTTATTCCAACTTCTCCC-3’ | 463 | |
9 V | 5’-CTTCGTTAGTTAAAATTCTAAATTTTTCTAAG-3′ 5′-GTCCCAATACCAGTCCTTGCAACACAAG-3’ | 753 | |
7F | 5’-CCTACGGGAGGATATAAAATTATTTTTGAG-3′ 5′-CAAATACACCACTATAGGCTGTTGAGACTAAC-3’ | 826 |