Skip to main content

Table 3 The BLASTN results of unique genes

From: Design of PCR assays to specifically detect and identify 37 Lactobacillus species in a single 96 well plate

Species

Description

Identity (%)

Target species match

Non-target species match

Species

No. of strains

Identify (%)

Species

No. of strains

Identity (%)

L. sanfranciscensis

L. sanfranciscensis TMW 1.1304

99

L. sanfranciscensis

20/20

100 ~ 98.94

–

–

–

L. acidipiscis

L. acidipiscis strain ACA-DC 1533

99.58

L. acidipiscis

5/5

100 ~ 99.17

–

–

–

L. fermentum

L. fermentum strain B1 28

100

L. fermentum

63/63

100 ~ 98.57

–

–

–

L. amylovorus

L. amylovorus DSM 20531

100

L. amylovorus

14/15

100 ~ 98.84

–

–

–

L. pentosus

L. pentosus strain DSM 20314

100

L. pentosus

22/22

100 ~ 98.35

–

–

–

L. plantarum

L. plantarum strain IDCC3501

100

L. plantarum

449/453

100 ~ 97.14

–

–

–

L. helveticus

L. helveticus isolate NWC_2_3

100

L. helveticus

56/57

100 ~ 98.70

L. gallinarum

1/7

99.64

L. farciminis

L. farciminis KCTC 3681

100

L. farciminis

7/7

100

–

–

–

L. parabuchneri

L. parabuchneri strain FAM21731

99.97

L. parabuchneri

25/25

100 ~ 96.57

–

–

–

L. paraplantarum

L. paraplantarum strain DSM 10667

100

L. paraplantarum

10/11

100 ~ 98.78

–

–

–

L. gallinarum

L. gallinarum DSM 10532

100

L. gallinarum

6/7

100 ~ 99.39

–

–

–

L. casei

L. casei subsp. casei ATCC 393

100

L. casei

14/25

100 ~ 96.41

–

–

–

L. paracasei

L. paracasei ATCC 334

100

L. paracasei

109/164

100 ~ 98.51

L. casei

3/25

98.39 ~ 98.14

L. lindneri

L. lindneri strain TMW 1.481

100

L. lindneri

12/12

100

–

–

–