TY - JOUR AU - Filoche, S. AU - Wong, L. AU - Sissons, C. H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Oral biofilms: emerging concepts in microbial ecology JO - J Dent Res VL - 89 ID - Filoche2010 ER - TY - JOUR AU - Socransky, S. S. AU - Haffajee, A. D. PY - 1992 DA - 1992// TI - The bacterial etiology of destructive periodontal disease: current concepts JO - J Periodontol VL - 63 ID - Socransky1992 ER - TY - JOUR AU - Holt, S. C. AU - Ebersole, J. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, and Tannerella forsythia: the "red complex", a prototype polybacterial pathogenic consortium in periodontitis JO - Periodontology 2000 VL - 38 ID - Holt2005 ER - TY - JOUR AU - Kolenbrander, P. E. AU - Palmer, R. J. AU - Periasamy, S. AU - Jakubovics, N. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Oral multispecies biofilm development and the key role of cell-cell distance JO - Nat Rev Microbiol VL - 8 ID - Kolenbrander2010 ER - TY - JOUR AU - Donlan, R. M. AU - Costerton, J. W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Biofilms: survival mechanisms of clinically relevant microorganisms JO - Clin Microbiol Rev VL - 15 ID - Donlan2002 ER - TY - JOUR AU - Davies, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Understanding biofilm resistance to antibacterial agents JO - Nat Rev Drug Discov VL - 2 ID - Davies2003 ER - TY - JOUR AU - Costerton, J. W. AU - Stewart, P. S. AU - Greenberg, E. P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections JO - Science (New York, NY) VL - 284 ID - Costerton1999 ER - TY - JOUR AU - Hoiby, N. AU - Ciofu, O. AU - Johansen, H. K. AU - Song, Z. J. AU - Moser, C. AU - Jensen, P. O. AU - Molin, S. AU - Givskov, M. AU - Tolker-Nielsen, T. AU - Bjarnsholt, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - The clinical impact of bacterial biofilms JO - International journal of oral science VL - 3 ID - Hoiby2011 ER - TY - JOUR AU - Whiteley, M. AU - Bangera, M. G. AU - Bumgarner, R. E. AU - Parsek, M. R. AU - Teitzel, G. M. AU - Lory, S. AU - Greenberg, E. P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Gene expression in Pseudomonas aeruginosa biofilms JO - Nature VL - 413 ID - Whiteley2001 ER - TY - JOUR AU - Schembri, M. A. AU - Kjaergaard, K. AU - Klemm, P. PY - 2003 DA - 2003// TI - Global gene expression in Escherichia coli biofilms JO - Mol Microbiol VL - 48 ID - Schembri2003 ER - TY - JOUR AU - Beenken, K. E. AU - Dunman, P. M. AU - McAleese, F. AU - Macapagal, D. AU - Murphy, E. AU - Projan, S. J. AU - Blevins, J. S. AU - Smeltzer, M. S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Global gene expression in Staphylococcus aureus biofilms JO - J Bacteriol VL - 186 ID - Beenken2004 ER - TY - JOUR AU - Dotsch, A. AU - Eckweiler, D. AU - Schniederjans, M. AU - Zimmermann, A. AU - Jensen, V. AU - Scharfe, M. AU - Geffers, R. AU - Haussler, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - The Pseudomonas aeruginosa transcriptome in planktonic cultures and static biofilms using RNA sequencing JO - PLoS One VL - 7 ID - Dotsch2012 ER - TY - JOUR AU - Romero-Lastra, P. AU - Sanchez, M. C. AU - Ribeiro-Vidal, H. AU - Llama-Palacios, A. AU - Figuero, E. AU - Herrera, D. AU - Sanz, M. PY - 2017 DA - 2017// TI - Comparative gene expression analysis of Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 in planktonic and biofilms states JO - PLoS One VL - 12 ID - Romero-Lastra2017 ER - TY - JOUR AU - Lo, A. W. AU - Seers, C. A. AU - Boyce, J. D. AU - Dashper, S. G. AU - Slakeski, N. AU - Lissel, J. P. AU - Reynolds, E. C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparative transcriptomic analysis of Porphyromonas gingivalis biofilm and planktonic cells JO - BMC Microbiol VL - 9 ID - Lo2009 ER - TY - STD TI - Kuboniwa M, Houser JR, Hendrickson EL, Wang Q, Alghamdi SA, Sakanaka A: Metabolic crosstalk regulates Porphyromonas gingivalis colonization and virulence during oral polymicrobial infection 2017, 2(11):1493–1499. ID - ref15 ER - TY - JOUR AU - Bao, K. AU - Belibasakis, G. N. AU - Thurnheer, T. AU - Aduse-Opoku, J. AU - Curtis, M. A. AU - Bostanci, N. PY - 2014 DA - 2014// TI - Role of Porphyromonas gingivalis gingipains in multi-species biofilm formation JO - BMC Microbiol VL - 14 ID - Bao2014 ER - TY - JOUR AU - Kuboniwa, M. AU - Hendrickson, E. L. AU - Xia, Q. AU - Wang, T. AU - Xie, H. AU - Hackett, M. AU - Lamont, R. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Proteomics of Porphyromonas gingivalis within a model oral microbial community JO - BMC Microbiol VL - 9 ID - Kuboniwa2009 ER - TY - JOUR AU - Yamamoto, R. AU - Noiri, Y. AU - Yamaguchi, M. AU - Asahi, Y. AU - Maezono, H. AU - Ebisu, S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Time course of gene expression during Porphyromonas gingivalis strain ATCC 33277 biofilm formation JO - Appl Environ Microbiol VL - 77 ID - Yamamoto2011 ER - TY - JOUR AU - Redanz, S. AU - Standar, K. AU - Podbielski, A. AU - Kreikemeyer, B. PY - 2011 DA - 2011// TI - A five-species transcriptome array for oral mixed-biofilm studies JO - PLoS One VL - 6 ID - Redanz2011 ER - TY - JOUR AU - Ang, C. S. AU - Veith, P. D. AU - Dashper, S. G. AU - Reynolds, E. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Application of 16O/18O reverse proteolytic labeling to determine the effect of biofilm culture on the cell envelope proteome of Porphyromonas gingivalis W50 JO - Proteomics VL - 8 ID - Ang2008 ER - TY - JOUR AU - Xie, H. AU - Chung, W. O. AU - Park, Y. AU - Lamont, R. J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Regulation of the Porphyromonas gingivalis fimA (Fimbrillin) gene JO - Infect Immun VL - 68 ID - Xie2000 ER - TY - JOUR AU - Dashper, S. G. AU - Ang, C. S. AU - Veith, P. D. AU - Mitchell, H. L. AU - Lo, A. W. AU - Seers, C. A. AU - Walsh, K. A. AU - Slakeski, N. AU - Chen, D. AU - Lissel, J. P. PY - 2009 DA - 2009// TI - Response of Porphyromonas gingivalis to heme limitation in continuous culture JO - J Bacteriol VL - 191 ID - Dashper2009 ER - TY - JOUR AU - Yamaguchi, M. AU - Sato, K. AU - Yukitake, H. AU - Noiri, Y. AU - Ebisu, S. AU - Nakayama, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - A Porphyromonas gingivalis mutant defective in a putative glycosyltransferase exhibits defective biosynthesis of the polysaccharide portions of lipopolysaccharide, decreased gingipain activities, strong autoaggregation, and increased biofilm formation JO - Infect Immun VL - 78 ID - Yamaguchi2010 ER - TY - JOUR AU - Shrout, J. D. AU - Tolker-Nielsen, T. AU - Givskov, M. AU - Parsek, M. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - The contribution of cell-cell signaling and motility to bacterial biofilm formation JO - MRS Bull VL - 36 ID - Shrout2011 ER - TY - JOUR AU - Burgess, N. A. AU - Kirke, D. F. AU - Williams, P. AU - Winzer, K. AU - Hardie, K. R. AU - Meyers, N. L. AU - Aduse-Opoku, J. AU - Curtis, M. A. AU - Camara, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - LuxS-dependent quorum sensing in Porphyromonas gingivalis modulates protease and haemagglutinin activities but is not essential for virulence JO - Microbiology (Reading, England) VL - 148 ID - Burgess2002 ER - TY - JOUR AU - Yuan, L. AU - Hillman, J. D. AU - Progulske-Fox, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Microarray analysis of quorum-sensing-regulated genes in Porphyromonas gingivalis JO - Infect Immun VL - 73 ID - Yuan2005 ER - TY - JOUR AU - Chung, W. O. AU - Park, Y. AU - Lamont, R. J. AU - McNab, R. AU - Barbieri, B. AU - Demuth, D. R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Signaling system in Porphyromonas gingivalis based on a LuxS protein JO - J Bacteriol VL - 183 ID - Chung2001 ER - TY - JOUR AU - Marsh, P. D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Are dental diseases examples of ecological catastrophes? JO - Microbiology (Reading, England) VL - 149 ID - Marsh2003 ER - TY - JOUR AU - Stanley, N. R. AU - Lazazzera, B. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Environmental signals and regulatory pathways that influence biofilm formation JO - Mol Microbiol VL - 52 ID - Stanley2004 ER - TY - JOUR AU - Stoodley, P. AU - Sauer, K. AU - Davies, D. G. AU - Costerton, J. W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Biofilms as complex differentiated communities JO - Annu Rev Microbiol VL - 56 ID - Stoodley2002 ER - TY - JOUR AU - Smyth, G. K. AU - Speed, T. PY - 2003 DA - 2003// TI - Normalization of cDNA microarray data JO - Methods (San Diego, Calif) VL - 31 ID - Smyth2003 ER - TY - STD TI - Smyth GK: Linear models and empirical bayes methods for assessing differential expression in microarray experiments. Statistical applications in genetics and molecular biology 2004, 3:Article3. ID - ref32 ER - TY - JOUR AU - Schmittgen, T. D. AU - Livak, K. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Analyzing real-time PCR data by the comparative C(T) method JO - Nat Protoc VL - 3 ID - Schmittgen2008 ER - TY - JOUR AU - Hagan, E. C. AU - Mobley, H. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Haem acquisition is facilitated by a novel receptor Hma and required by uropathogenic Escherichia coli for kidney infection JO - Mol Microbiol VL - 71 ID - Hagan2009 ER - TY - JOUR AU - Fuqua, W. C. AU - Winans, S. C. AU - Greenberg, E. P. PY - 1994 DA - 1994// TI - Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators JO - J Bacteriol VL - 176 ID - Fuqua1994 ER - TY - JOUR AU - Josts, I. AU - Grinter, R. AU - Kelly, S. M. AU - Mosbahi, K. AU - Roszak, A. AU - Cogdell, R. AU - Smith, B. O. AU - Byron, O. AU - Walker, D. PY - 2014 DA - 2014// TI - Recombinant expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the C-terminal DUF490(963-1138) domain of TamB from Escherichia coli JO - Acta crystallographica Section F, Structural biology communications VL - 70 ID - Josts2014 ER - TY - JOUR AU - Selkrig, J. AU - Mosbahi, K. AU - Webb, C. T. AU - Belousoff, M. J. AU - Perry, A. J. AU - Wells, T. J. AU - Morris, F. AU - Leyton, D. L. AU - Totsika, M. AU - Phan, M. D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Discovery of an archetypal protein transport system in bacterial outer membranes JO - Nat Struct Mol Biol VL - 19 ID - Selkrig2012 ER - TY - JOUR AU - McNab, R. AU - Ford, S. K. AU - El-Sabaeny, A. AU - Barbieri, B. AU - Cook, G. S. AU - Lamont, R. J. PY - 2003 DA - 2003// TI - LuxS-based signaling in Streptococcus gordonii: autoinducer 2 controls carbohydrate metabolism and biofilm formation with Porphyromonas gingivalis JO - J Bacteriol VL - 185 ID - McNab2003 ER - TY - JOUR AU - Hirano, T. AU - Beck, D. A. AU - Demuth, D. R. AU - Hackett, M. AU - Lamont, R. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Deep sequencing of Porphyromonas gingivalis and comparative transcriptome analysis of a LuxS mutant JO - Front Cell Infect Microbiol VL - 2 ID - Hirano2012 ER - TY - JOUR AU - James, C. E. AU - Hasegawa, Y. AU - Park, Y. AU - Yeung, V. AU - Tribble, G. D. AU - Kuboniwa, M. AU - Demuth, D. R. AU - Lamont, R. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - LuxS involvement in the regulation of genes coding for hemin and iron acquisition systems in Porphyromonas gingivalis JO - Infect Immun VL - 74 ID - James2006 ER - TY - JOUR AU - McNab, R. AU - Lamont, R. J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Microbial dinner-party conversations: the role of LuxS in interspecies communication JO - J Med Microbiol VL - 52 ID - McNab2003 ER - TY - JOUR AU - Butler, C. AU - Mitchell, H. AU - Dashper, S. AU - Reynolds, E. PY - 2015 DA - 2015// TI - The Porphyromonas gingivalis ferric uptake regulator orthologue does not regulate iron homeostasis JO - Genomics data VL - 5 ID - Butler2015 ER - TY - JOUR AU - Califano, J. V. AU - Kitten, T. AU - Lewis, J. P. AU - Macrina, F. L. AU - Fleischmann, R. D. AU - Fraser, C. M. AU - Duncan, M. J. AU - Dewhirst, F. E. PY - 2000 DA - 2000// TI - Characterization of Porphyromonas gingivalis insertion sequence-like element ISPg5 JO - Infect Immun VL - 68 ID - Califano2000 ER - TY - JOUR AU - Haft, D. H. AU - Paulsen, I. T. AU - Ward, N. AU - Selengut, J. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Exopolysaccharide-associated protein sorting in environmental organisms: the PEP-CTERM/EpsH system. Application of a novel phylogenetic profiling heuristic JO - BMC biology VL - 4 ID - Haft2006 ER - TY - JOUR AU - Kato, T. AU - Takahashi, N. AU - Kuramitsu, H. K. PY - 1992 DA - 1992// TI - Sequence analysis and characterization of the Porphyromonas gingivalis prtC gene, which expresses a novel collagenase activity JO - J Bacteriol VL - 174 ID - Kato1992 ER - TY - JOUR AU - Brunner, J. AU - Wittink, F. R. AU - Jonker, M. J. AU - Jong, M. AU - Breit, T. M. AU - Laine, M. L. AU - Soet, J. J. AU - Crielaard, W. PY - 2010 DA - 2010// TI - The core genome of the anaerobic oral pathogenic bacterium Porphyromonas gingivalis JO - BMC Microbiol VL - 10 ID - Brunner2010 ER - TY - JOUR AU - Lamont, R. J. AU - Jenkinson, H. F. PY - 1998 DA - 1998// TI - Life below the gum line: pathogenic mechanisms of Porphyromonas gingivalis JO - Microbiology and molecular biology reviews : MMBR VL - 62 ID - Lamont1998 ER - TY - JOUR AU - Kolenbrander, P. E. AU - Andersen, R. N. AU - Blehert, D. S. AU - Egland, P. G. AU - Foster, J. S. AU - Palmer, R. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Communication among oral bacteria JO - Microbiology and molecular biology reviews : MMBR VL - 66 ID - Kolenbrander2002 ER - TY - JOUR AU - Jenkinson, H. F. AU - Lamont, R. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Oral microbial communities in sickness and in health JO - Trends Microbiol VL - 13 ID - Jenkinson2005 ER - TY - JOUR AU - Andrian, E. AU - Grenier, D. AU - Rouabhia, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Porphyromonas gingivalis-epithelial cell interactions in periodontitis JO - J Dent Res VL - 85 ID - Andrian2006 ER - TY - JOUR AU - Hasegawa, Y. AU - Iwami, J. AU - Sato, K. AU - Park, Y. AU - Nishikawa, K. AU - Atsumi, T. AU - Moriguchi, K. AU - Murakami, Y. AU - Lamont, R. J. AU - Nakamura, H. PY - 2009 DA - 2009// TI - Anchoring and length regulation of Porphyromonas gingivalis Mfa1 fimbriae by the downstream gene product Mfa2 JO - Microbiology (Reading, England) VL - 155 ID - Hasegawa2009 ER - TY - JOUR AU - Yoshimura, F. AU - Murakami, Y. AU - Nishikawa, K. AU - Hasegawa, Y. AU - Kawaminami, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Surface components of Porphyromonas gingivalis JO - J Periodontal Res VL - 44 ID - Yoshimura2009 ER - TY - JOUR AU - Nagano, K. AU - Abiko, Y. AU - Yoshida, Y. AU - Yoshimura, F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Porphyromonas gingivalis FimA fimbriae: roles of the fim gene cluster in the fimbrial assembly and antigenic heterogeneity among fimA genotypes JO - Journal of Oral Biosciences VL - 54 ID - Nagano2012 ER - TY - JOUR AU - Krogfelt, K. A. AU - Klemm, P. PY - 1988 DA - 1988// TI - Investigation of minor components of Escherichia coli type 1 fimbriae: protein chemical and immunological aspects JO - Microb Pathog VL - 4 ID - Krogfelt1988 ER - TY - JOUR AU - Nishiyama, S. AU - Murakami, Y. AU - Nagata, H. AU - Shizukuishi, S. AU - Kawagishi, I. AU - Yoshimura, F. PY - 2007 DA - 2007// TI - Involvement of minor components associated with the FimA fimbriae of Porphyromonas gingivalis in adhesive functions JO - Microbiology (Reading, England) VL - 153 ID - Nishiyama2007 ER - TY - JOUR AU - Kuramitsu, H. AU - Tokuda, M. AU - Yoneda, M. AU - Duncan, M. AU - Cho, M. I. PY - 1997 DA - 1997// TI - Multiple colonization defects in a cysteine protease mutant of Porphyromonas gingivalis JO - J Periodontal Res VL - 32 ID - Kuramitsu1997 ER - TY - JOUR AU - Umemoto, T. AU - Hamada, N. PY - 2003 DA - 2003// TI - Characterization of biologically active cell surface components of a periodontal pathogen. The roles of major and minor fimbriae of Porphyromonas gingivalis JO - J Periodontol VL - 74 ID - Umemoto2003 ER - TY - JOUR AU - Lin, X. AU - Wu, J. AU - Xie, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Porphyromonas gingivalis minor fimbriae are required for cell-cell interactions JO - Infect Immun VL - 74 ID - Lin2006 ER - TY - JOUR AU - Rangarajan, M. AU - Aduse-Opoku, J. AU - Hashim, A. AU - Paramonov, N. AU - Curtis, M. A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Characterization of the alpha- and beta-mannosidases of Porphyromonas gingivalis JO - J Bacteriol VL - 195 ID - Rangarajan2013 ER -