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Table 1 Results of E. coli O157:H7 and non-O157 STEC strains detected by the multiplex real-time PCR assay

From: Multiplex real-time PCR assay for detection of Escherichia coli O157:H7 and screening for non-O157 Shiga toxin-producing E. coli

Strain Serotype Source Target gene
Z3276 stx1 stx2
EC1275 O157:H7 CDC EDL933, hamburger meat + + +
EC1225 O157:H7 WA, 1993 + + +
EC1759 O157:H7 USA (MI), 2003 + + +
EC1429 O157:H7 Denmark, 1987 + - +
EC4420 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4421 O157:H7 White Onions, NY, 12/2006 + + +
EC4422 O157:H7 White Onions, NY, 12/2006 + + +
EC4504 O157:H7 MN, 12/2006 + + +
EC1428 O157:H7 Argentina, 1977 + - +
EC1738 O157:H7 Food isolate + - +
EC1530 O157:H7 Thailand, 1994 + - +
EC4440 O157:H7 CDC + + +
EC4163 O157:H7 USA (IL) + - +
EC4438 O157:H7 CDC + - +
EC4431 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4452 O157:H7 USA (NJ), 2006 + - +
EC1709 O157:H7 USA (MI), 2002 + - +
EC1760 O157:H7 USA (MI), 2004 + - +
EC1431 O157:H7 Japan, 1987 + - +
EC4115 O157:H7 Sep-06 + - +
EC1734 O157:H7 MA, 2009 + - +
EC4302 O157:H7 NY, 12/2006 + + +
EC4301 O157:H7 NY, 12/2006 + + +
EC4429 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4428 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4437 O157:H7 NJ, 12/2006 + - +
EC4436 O157:H7 NJ, 12/2006 + - +
EC4434 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4433 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4432 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4449 O157:H7 NJ, 12/2006 + - +
EC4448 O157:H7 WI, 12/2006 + - +
EC4447 O157:H7 CA, 12/2006 + + +
EC4201 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC4456 O157:H7 USA (NJ),2006 + - +
EC4461 O157:H7 USA (NJ),2006 + - +
EC4502 O157:H7 USA (NJ),2006 + + +
EC4503 O157:H7 USA (NJ),2006 + + +
EC4505 O157:H7 USA (NJ),2006 + + +
EC4511 O157:H7 USA (NJ),2006 + + +
EC4200 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC1267 O157:H7 USA, (NH), 1991 + + +
EC1268 O157:H7 USA (MT), 1991 + + +
EC4194 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC1590 O157:H7 USA (WA) + + +
EC4458 O157:H7 USA (NJ),2006 + - +
EC4197 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC1231 O157:H7 USA (WA), 1995 + + +
EC4470 O157:H7 USA (NJ),2006 + - +
EC4471 O157:H7 USA (NJ),2006 + - +
EC1244 O157:H7 USA (GA), 1992 + + +
EC4199 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC1260 O157:H7 USA (GA),1993 + - +
EC4167 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4168 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4193 O157:H7 USA (OH), 2006 + - +
EC1265 O157:H7 USA (CA), 1993 + + +
EC4184 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4204 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC4171 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4205 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC4206 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC1593 O157:H7 USA (MI), 2003 + + +
EC1239 O157:H7 USA (NE), 1993 + - +
EC4174 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4187 O157:H7 USA (CT), 2006 + - +
EC4188 O157:H7 USA (CT), 2006 + - +
EC4191 O157:H7 Spinach, USA (IL), 2006 + - +
EC1276 O157:H7 Japan, 1996 + + +
EC4501 O157:H7 MN, 12/2006 + + +
EC558 O157:H7 Patient raw milk + + +
EC867 O157:H7 USDA-FSIS-380-94 + + +
EC874 O157:H7 Apple cider + + +
EC4162 O157:H7 Feces (New Jersey) + - +
EC506 O157:H7 Feces + - +
EC507 O157:H7 Feces + + +
EC4443 O157:H7 CDC + + +
EC4442 O157:H7 CDC + + +
EC4441 O157:H7 CDC + + +
EC4451 O157:H7 NJ, 12/2006 + - +
EC4445 O157:H7 NJ, 12/2006 + + +
EC4446 O157:H7 NJ, 12/2006 + + +
EC1601 O157:H7 USA (MI), 2002 + + +
EC1727 O157:H7 MI, 2002 + + +
EC1426 O157:H7 Canada, 1988 + - +
EC4419 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4418 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4417 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4416 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4423 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4424 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4427 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4426 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4435 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4425 O157:H7 NY, 12/2006 + - +
EC4164 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4439 O157:H7 MS, 12/2006 + - +
EC4450 O157:H7 NJ, 12/2006 + - +
EC1217 O157:H7 2003 + + +
EC1577 O157:H7 USA (WA), 1995 + + +
EC4201 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC4207 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4208 O157:H7 Spinach, USA (IL), 2006 + - +
EC1245 O157:H7 USA (GA), 1995 + + +
EC4506 O157:H7 USA (MN), 2006 + + +
EC4507 O157:H7 USA (MN), 2006 + + +
EC4508 O157:H7 USA (MN), 2006 + + +
EC4509 O157:H7 USA (MN), 2006 + + +
EC4510 O157:H7 USA (MN), 2006 + + +
EC1590 O157:H7 USA (WA) + + +
EC1597 O157:H7 USA (CT), 1996 + + +
EC1225 O157:H7 USA (WA), 1993 + + +
EC1236 O157:H7 Food, USA (CA), 1993 + + +
EC1240 O157:H7 USA (OH), 1993 + + +
EC1241 O157:H7 Food, USA (OR), 1995 + + +
EC4472 O157:H7 USA, (NJ), 2006 + - +
EC1242 O157:H7 USA (GA), 1992 + - +
EC1243 O157:H7 USA (GA), 1992 + + +
EC4463 O157:H7 USA (NJ), 2006 + - +
EC4165 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4166 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4195 O157:H7 Spinach, USA (OH), 2006 + - +
EC4192 O157:H7 USA (CA), 2006 + - +
EC4182 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4469 O157:H7 USA (NJ), 2006 + - +
EC4465 O157:H7 USA (NJ), 2006 + - +
EC4170 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4183 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4186 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
Ec4169 O157:H7 USA (WI), 2006 + - +
EC4189 O157:H7 USA (CT), 2006 + - +
EC4175 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4176 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC4444 O157:H7 USA, NJ, 2006 + + +
EC4173 O157:H7 USA (IL), 2006 + - +
EC1892 O104:H4 STEC, Republic of Georgia, 2011 - - +
EC1893 O104:H4 STEC, Republic of Georgia, 2011 - - +
EC1891 O104:H4 STEC, Germany, 2011 - - +
EC1894 O104:H4 STEC, Germany, 2011 - - +
EC1769 O26 STEC - + -
EC1770 O26 STEC - + +
EC1771 O26 STEC - + -
EC1773 O26:H11 STEC - + -
EC1775 O26:H11 STEC - + -
EC1768 O26:H2 STEC - + -
EC1786 O111:NM STEC - + +
EC1787 O111:H8 STEC - + +
EC1788 O111:NM STEC - + -
EC1791 O145:H25 STEC - - +
EC1794 O145:NM STEC - + +
EC1801 O103:H2 STEC - + -
EC1802 O103:H25 STEC - + -
EC1803 O103:H11 STEC - + +
EC1806 O121:H19 STEC - - +
EC1807 O121:H19 STEC - - +
EC1808 O121:H19 STEC - + +
EC331 O26 STEC - + +
EC400 O26:H11 STEC - + +
EC521 O26:H11 STEC - + +
EC540 O26:H- STEC - + +
EC550 O26:H- STEC - + +
EC1232 O55:H7 STEC - + +
EC1235 O55:H7 STEC - + +
EC1668 O111:H8 STEC - + -
EC1669 O118:H16 STEC - - +
EC1631 O111:H8 STEC - + -
EC1655 O111:H8 STEC - + -
K12   Negative E. coli strain control - - -
NTC    - - -