TY - JOUR AU - Kamoun, S. AU - Furzer, O. AU - Jones, J. D. AU - Judelson, H. S. AU - Ali, G. S. AU - Dalio, R. J. AU - Roy, S. G. AU - Schena, L. AU - Zambounis, A. AU - Panabières, F. PY - 2015 DA - 2015// TI - The Top 10 oomycete pathogens in molecular plant pathology JO - Mol Plant Pathol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1111/mpp.12190 DO - 10.1111/mpp.12190 ID - Kamoun2015 ER - TY - JOUR AU - Beakes, G. W. AU - Glockling, S. L. AU - Sekimoto, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - The evolutionary phylogeny of the oomycete “fungi” JO - Protoplasma VL - 249 UR - https://doi.org/10.1007/s00709-011-0269-2 DO - 10.1007/s00709-011-0269-2 ID - Beakes2012 ER - TY - JOUR AU - Thines, M. AU - Kamoun, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Oomycete–plant coevolution: recent advances and future prospects JO - Curr Opin Plant Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.pbi.2010.04.001 DO - 10.1016/j.pbi.2010.04.001 ID - Thines2010 ER - TY - JOUR AU - Schornack, S. AU - Damme, M. AU - Bozkurt, T. O. AU - Cano, L. M. AU - Smoker, M. AU - Thines, M. AU - Gaulin, E. AU - Kamoun, S. AU - Huitema, E. PY - 2010 DA - 2010// TI - Ancient class of translocated oomycete effectors targets the host nucleus JO - Proc Natl Acad Sci VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1008491107 DO - 10.1073/pnas.1008491107 ID - Schornack2010 ER - TY - JOUR AU - Misner, I. AU - Blouin, N. AU - Leonard, G. AU - Richards, T. A. AU - Lane, C. E. PY - 2015 DA - 2015// TI - The secreted proteins of Achlya hypogyna and Thraustotheca clavata identify the ancestral oomycete secretome and reveal gene acquisitions by horizontal gene transfer JO - Genome Biol Evol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1093/gbe/evu276 DO - 10.1093/gbe/evu276 ID - Misner2015 ER - TY - JOUR AU - Quiroz Velasquez, P. F. AU - Abiff, S. K. AU - Fins, K. C. AU - Conway, Q. B. AU - Salazar, N. C. AU - Delgado, A. P. AU - Dawes, J. K. AU - Douma, L. G. AU - Tartar, A. PY - 2014 DA - 2014// TI - Transcriptome analysis of the entomopathogenic oomycete lagenidium giganteum reveals putative virulence factors JO - Appl Environ Microbiol VL - 80 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02060-14 DO - 10.1128/AEM.02060-14 ID - Quiroz Velasquez2014 ER - TY - JOUR AU - Vilela, R. AU - Taylor, J. W. AU - Walker, E. D. AU - Mendoza, L. PY - 2015 DA - 2015// TI - Lagenidium giganteum Pathogenicity in Mammals JO - Emerg Infect Dis VL - 21 UR - https://doi.org/10.3201/eid2102.141091 DO - 10.3201/eid2102.141091 ID - Vilela2015 ER - TY - JOUR AU - Umphlett, C. J. AU - Huang, C. S. PY - 1972 DA - 1972// TI - Experimental infection of mosquito larvae by a species of the aquatic fungus Lagenidium JO - J Invertebr Pathol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/0022-2011(72)90164-4 DO - 10.1016/0022-2011(72)90164-4 ID - Umphlett1972 ER - TY - JOUR AU - Rosenblum, E. B. AU - Poorten, T. J. AU - Joneson, S. AU - Settles, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Substrate-specific gene expression in Batrachochytrium dendrobatidis, the chytrid pathogen of amphibians JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0049924 DO - 10.1371/journal.pone.0049924 ID - Rosenblum2012 ER - TY - STD TI - Ramirez‐Garcés D, Camborde L, Pel MJ, Jauneau A, Martinez Y, Néant I, Leclerc C, Moreau M, Dumas B, Gaulin E. CRN13 candidate effectors from plant and animal eukaryotic pathogens are DNA‐binding proteins which trigger host DNA damage response. New Phytol. 2016;210(2):602-17. doi: 10.1111/nph.13774. Epub 2015 Dec 24. ID - ref10 ER - TY - JOUR AU - McInnis, T. AU - Domnas, A. PY - 1973 DA - 1973// TI - The properties of trehalase from the mosquito-parasitizing water mold, Lagenidium sp JO - J Invertebr Pathol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/0022-2011(73)90157-2 DO - 10.1016/0022-2011(73)90157-2 ID - McInnis1973 ER - TY - JOUR AU - Scholte, E. J. AU - Knols, B. G. AU - Samson, R. A. AU - Takken, W. PY - 2004 DA - 2004// TI - Entomopathogenic fungi for mosquito control: a review JO - J Insect Sci VL - 4 UR - https://doi.org/10.1093/jis/4.1.19 DO - 10.1093/jis/4.1.19 ID - Scholte2004 ER - TY - JOUR AU - Haas, B. J. AU - Kamoun, S. AU - Zody, M. C. AU - Jiang, R. H. AU - Handsaker, R. E. AU - Cano, L. M. AU - Grabherr, M. AU - Kodira, C. D. AU - Raffaele, S. AU - Torto-Alalibo, T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans JO - Nature VL - 461 UR - https://doi.org/10.1038/nature08358 DO - 10.1038/nature08358 ID - Haas2009 ER - TY - JOUR AU - Sun, G. AU - Yang, Z. AU - Kosch, T. AU - Summers, K. AU - Huang, J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Evidence for acquisition of virulence effectors in pathogenic chytrids JO - BMC Evol Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2148-11-195 DO - 10.1186/1471-2148-11-195 ID - Sun2011 ER - TY - JOUR AU - Bendtsen, J. D. AU - Jensen, L. J. AU - Blom, N. AU - Heijne, G. AU - Brunak, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Feature-based prediction of non-classical and leaderless protein secretion JO - Protein Eng Des Sel VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/protein/gzh037 DO - 10.1093/protein/gzh037 ID - Bendtsen2004 ER - TY - JOUR AU - Intra, J. AU - Pavesi, G. AU - Horner, D. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Phylogenetic analyses suggest multiple changes of substrate specificity within the glycosyl hydrolase 20 family JO - BMC Evol Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2148-8-214 DO - 10.1186/1471-2148-8-214 ID - Intra2008 ER - TY - JOUR AU - Alfaro, M. E. AU - Zoller, S. AU - Lutzoni, F. PY - 2003 DA - 2003// TI - Bayes or bootstrap? A simulation study comparing the performance of Bayesian Markov chain Monte Carlo sampling and bootstrapping in assessing phylogenetic confidence JO - Mol Biol Evol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msg028 DO - 10.1093/molbev/msg028 ID - Alfaro2003 ER - TY - JOUR AU - Strasser, R. AU - Bondili, J. S. AU - Schoberer, J. AU - Svoboda, B. AU - Liebminger, E. AU - Glössl, J. AU - Altmann, F. AU - Steinkellner, H. AU - Mach, L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Enzymatic properties and subcellular localization of Arabidopsis β-N-acetylhexosaminidases JO - Plant Physiol VL - 145 UR - https://doi.org/10.1104/pp.107.101162 DO - 10.1104/pp.107.101162 ID - Strasser2007 ER - TY - JOUR AU - Dowd, P. F. AU - Johnson, E. T. AU - Pinkerton, T. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Oral toxicity of β-N-acetyl hexosaminidase to insects JO - J Agric Food Chem VL - 55 UR - https://doi.org/10.1021/jf063562w DO - 10.1021/jf063562w ID - Dowd2007 ER - TY - JOUR AU - Rodríguez-Ezpeleta, N. AU - Brinkmann, H. AU - Burger, G. AU - Roger, A. J. AU - Gray, M. W. AU - Philippe, H. AU - Lang, B. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - Toward resolving the eukaryotic tree: the phylogenetic positions of jakobids and cercozoans JO - Curr Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2007.07.036 DO - 10.1016/j.cub.2007.07.036 ID - Rodríguez-Ezpeleta2007 ER - TY - JOUR AU - Pawlowski, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - The new micro-kingdoms of eukaryotes JO - BMC Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1741-7007-11-1 DO - 10.1186/1741-7007-11-1 ID - Pawlowski2013 ER - TY - JOUR AU - Jaramillo, V. D. A. AU - Vargas, W. A. AU - Sukno, S. A. AU - Thon, M. R. PY - 2013 DA - 2013// TI - Horizontal transfer of a subtilisin gene from plants into an ancestor of the plant pathogenic fungal genus Colletotrichum JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0059078 DO - 10.1371/journal.pone.0059078 ID - Jaramillo2013 ER - TY - JOUR AU - Zhao, H. AU - Xu, C. AU - Lu, H. -. L. AU - Chen, X. AU - Leger, R. J. S. AU - Fang, W. PY - 2014 DA - 2014// TI - Host-to-pathogen gene transfer facilitated infection of insects by a pathogenic fungus JO - PLoS Pathog VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1004009 DO - 10.1371/journal.ppat.1004009 ID - Zhao2014 ER - TY - JOUR AU - Blum, M. AU - Gamper, H. A. AU - Waldner, M. AU - Sierotzki, H. AU - Gisi, U. PY - 2012 DA - 2012// TI - The cellulose synthase 3 (CesA3) gene of oomycetes: structure, phylogeny and influence on sensitivity to carboxylic acid amide (CAA) fungicides JO - Fungal Biol VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/j.funbio.2012.02.003 DO - 10.1016/j.funbio.2012.02.003 ID - Blum2012 ER - TY - JOUR AU - Kamoun, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - A catalogue of the effector secretome of plant pathogenic oomycetes JO - Annu Rev Phytopathol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.phyto.44.070505.143436 DO - 10.1146/annurev.phyto.44.070505.143436 ID - Kamoun2006 ER - TY - JOUR AU - Valero-Jiménez, C. A. AU - Wiegers, H. AU - Zwaan, B. J. AU - Koenraadt, C. J. AU - Kan, J. A. PY - 2016 DA - 2016// TI - Genes involved in virulence of the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana JO - J Invertebr Pathol VL - 133 UR - https://doi.org/10.1016/j.jip.2015.11.011 DO - 10.1016/j.jip.2015.11.011 ID - Valero-Jiménez2016 ER - TY - JOUR AU - Lombard, V. AU - Ramulu, H. G. AU - Drula, E. AU - Coutinho, P. M. AU - Henrissat, B. PY - 2014 DA - 2014// TI - The carbohydrate-active enzymes database (CAZy) in 2013 JO - Nucleic Acids Res VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt1178 DO - 10.1093/nar/gkt1178 ID - Lombard2014 ER - TY - JOUR AU - Carneiro, L. A. AU - Travassos, L. H. PY - 2016 DA - 2016// TI - Autophagy and viral diseases transmitted by Aedes aegypti and Aedes albopictus JO - Microbes Infect VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.micinf.2015.12.006 DO - 10.1016/j.micinf.2015.12.006 ID - Carneiro2016 ER - TY - JOUR AU - Agrawal, Y. AU - Khatri, I. AU - Subramanian, S. AU - Shenoy, B. D. PY - 2015 DA - 2015// TI - Genome sequence, comparative analysis, and evolutionary insights into chitinases of entomopathogenic fungus hirsutella thompsonii JO - Genome Biol Evol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1093/gbe/evv037 DO - 10.1093/gbe/evv037 ID - Agrawal2015 ER - TY - JOUR AU - Xiao, G. AU - Ying, S. -. H. AU - Zheng, P. AU - Wang, Z. -. L. AU - Zhang, S. AU - Xie, X. -. Q. AU - Shang, Y. AU - Leger, R. J. S. AU - Zhao, G. -. P. AU - Wang, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genomic perspectives on the evolution of fungal entomopathogenicity in Beauveria bassiana JO - Sci Rep VL - 2 ID - Xiao2012 ER - TY - JOUR AU - Limón, M. C. AU - Margolles-Clark, E. AU - Benítez, T. AU - Penttilä, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Addition of substrate-binding domains increases substrate-binding capacity and specific activity of a chitinase from Trichoderma harzianum JO - FEMS Microbiol Lett VL - 198 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1097(01)00124-0 DO - 10.1016/S0378-1097(01)00124-0 ID - Limón2001 ER - TY - JOUR AU - Limón, M. AU - Chacón, M. AU - Mejías, R. AU - Delgado-Jarana, J. AU - Rincón, A. AU - Codón, A. AU - Benítez, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Increased antifungal and chitinase specific activities of Trichoderma harzianum CECT 2413 by addition of a cellulose binding domain JO - Appl Microbiol Biotechnol VL - 64 UR - https://doi.org/10.1007/s00253-003-1538-6 DO - 10.1007/s00253-003-1538-6 ID - Limón2004 ER - TY - JOUR AU - Xia, Y. AU - Gao, M. AU - Clarkson, J. M. AU - Charnley, A. K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular cloning, characterisation, and expression of a neutral trehalase from the insect pathogenic fungus Metarhizium anisopliae JO - J Invertebr Pathol VL - 80 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2011(02)00124-6 DO - 10.1016/S0022-2011(02)00124-6 ID - Xia2002 ER - TY - JOUR AU - Vyas, N. AU - Dua, K. AU - Prakash, S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Efficacy of Lagenidium giganteum metabolites on mosquito larvae with reference to nontarget organisms JO - Parasitol Res VL - 101 UR - https://doi.org/10.1007/s00436-007-0496-9 DO - 10.1007/s00436-007-0496-9 ID - Vyas2007 ER - TY - JOUR AU - Phillips, A. J. AU - Anderson, V. L. AU - Robertson, E. J. AU - Secombes, C. J. AU - West, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - New insights into animal pathogenic oomycetes JO - Trends Microbiol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/j.tim.2007.10.013 DO - 10.1016/j.tim.2007.10.013 ID - Phillips2008 ER - TY - JOUR AU - Käll, L. AU - Krogh, A. AU - Sonnhammer, E. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Advantages of combined transmembrane topology and signal peptide prediction—the Phobius web server JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm256 DO - 10.1093/nar/gkm256 ID - Käll2007 ER - TY - JOUR AU - Liu, T. AU - Song, T. AU - Zhang, X. AU - Yuan, H. AU - Su, L. AU - Li, W. AU - Xu, J. AU - Liu, S. AU - Chen, L. AU - Chen, T. PY - 2014 DA - 2014// TI - Unconventionally secreted effectors of two filamentous pathogens target plant salicylate biosynthesis JO - Nat Commun VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/ncomms5686 DO - 10.1038/ncomms5686 ID - Liu2014 ER - TY - JOUR AU - Stajich, J. E. AU - Harris, T. AU - Brunk, B. P. AU - Brestelli, J. AU - Fischer, S. AU - Harb, O. S. AU - Kissinger, J. C. AU - Li, W. AU - Nayak, V. AU - Pinney, D. F. PY - 2012 DA - 2012// TI - FungiDB: an integrated functional genomics database for fungi JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr918 DO - 10.1093/nar/gkr918 ID - Stajich2012 ER - TY - JOUR AU - Dereeper, A. AU - Guignon, V. AU - Blanc, G. AU - Audic, S. AU - Buffet, S. AU - Chevenet, F. AU - Dufayard, J. F. AU - Guindon, S. AU - Lefort, V. AU - Lescot, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn180 DO - 10.1093/nar/gkn180 ID - Dereeper2008 ER - TY - JOUR AU - Abascal, F. AU - Zardoya, R. AU - Posada, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - ProtTest: selection of best-fit models of protein evolution JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti263 DO - 10.1093/bioinformatics/bti263 ID - Abascal2005 ER - TY - JOUR AU - Le, S. Q. AU - Gascuel, O. PY - 2008 DA - 2008// TI - An improved general amino acid replacement matrix JO - Mol Biol Evol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msn067 DO - 10.1093/molbev/msn067 ID - Le2008 ER - TY - JOUR AU - Mantilla, J. G. AU - Galeano, N. F. AU - Gaitan, A. L. AU - Cristancho, M. A. AU - Keyhani, N. O. AU - Gongora, C. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Transcriptome analysis of the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana grown on cuticular extracts of the coffee berry borer (Hypothenemus hampei) JO - Microbiology VL - 158 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.051664-0 DO - 10.1099/mic.0.051664-0 ID - Mantilla2012 ER - TY - JOUR AU - Pfaffl, M. W. PY - 2001 DA - 2001// TI - A new mathematical model for relative quantification in real-time RT–PCR JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.9.e45 DO - 10.1093/nar/29.9.e45 ID - Pfaffl2001 ER -