16S-ARDRA and MALDI-TOF mass spectrometry as tools for identification of Lactobacillus bacteria isolated from poultry

Dec, Marta; Puchalski, Andrzej; Urban-Chmiel, Renata; Wernicki, Andrzej

doi:10.1186/s12866-016-0732-5

Table 3 Genotypes of reference Lactobacillus strains obtained via digestion of 16S rDNA amplicons using different restriction endonucleases; reference numbers of strains as shown in Table 1

From: 16S-ARDRA and MALDI-TOF mass spectrometry as tools for identification of Lactobacillus bacteria isolated from poultry

No. of genotypes	MseI	MboI	HinfI	AluI	HaeIII	MspI	TaqI
1	L. salivarius A1	L. salivarius A1	L. salivarius A1	L. salivarius A1	L. salivarius A1	L. salivarius A1	L. salivarius A1
	L. salivarius A2	L. salivarius A2	L. salivarius A2	L. salivarius A2	L. salivarius A2	L. salivarius A2	L. salivarius A2
	L. agilis	L. salivarius A2	L. agilis	L. salivarius A2	L. agilis	L. salivarius A2	L. salivarius A2
2	L. saerimneri	L. saerimneri	L. saerimneri	L. agilis	L. saerimneri	L. oris	L. farciminis
3	L. plantarum	L.agilis	L. ingluviei R1	L. saerimneri	L. plantarum	L. plantarum	L. ingluviei R1
			L. ingluviei R2		L. farciminis	L. farciminis	L. ingluviei R2
			L. reuteri T1			L. mucosae	L. oris
							L. acidophilus
							L. crispatus
							L. kitasatonis
							L. amylovorus
							L. gallinarum
4	L. farciminis	L. farciminis	L. farciminis	L. plantarum	L. johnsonii	L. reuteri T1	L. reuteri T1 L. reuteri T2
5	L. zeae	L. zeae	L. zeae	L. zeae	L. zeae	L. zeae	L. zeae
	L. rhamnosus	L. rhamnosus	L. casei	L. rhamnosus	L. rhamnosus	L. rhamnosus	L. rhamnosus
	L. casei	L. casei	L. paracasei	L. casei	L. casei	L. casei	L. casei
	L. paracasei			L. paracasei	L. paracasei	L. paracasei L. agilis	L. paracasei
						L. saerimneri	L. agilis
							L. saerimneri
							L. plantarum
6	L. johnsonii	L. gasseri	L. gasseri	L. gasseri	L. gasseri	L. gasseri	L. gasseri
6	L. johnsonii	L. johnsonii	L. johnsonii	L. johnsonii	L. gasseri	L. johnsonii	L. johnsonii
7	L. ingluviei R1	L. paracasei	L. mucosae	L. farciminis	L. mucosae	L. reuteri T2	L.mucosae
	L. ingluviei R2
	L. mucosae
8	L. acidophilus	L. acidophilus	L. acidophilus	L. acidophilus	L. acidophilus	L. acidophilus
		L. crispatus			L. crispatus	L. crispatus
		L. kitasatonis			L. kitasatonis	L. kitasatonis
		L. amylovorus			L. amylovorus	L. amylovorus
		L. gallinarum			L. gallinarum	L. gallinarum
9	L. reuteri T2	L. reuteri T1	L. oris	L. ingluviei R1	L. ingluviei R1	L. ingluviei R1
9	L. reuteri T2	L. reuteri T1	L. oris	L. ingluviei R2	L. ingluviei R2	L. ingluviei R2
10	L. reuteri T1	L. reuteri T2	L. gallinarum	L. reuteri T1	L. reuteri T1
	L. oris			L. reuteri T2	L. reuteri T2
	L. oris			L. mucosae	L. reuteri T2
11	L. gasseri	L. plantarum	L. rhamnosus	L. oris	L. oris
12	L. amylovorus	L. ingluviei R1	L. crispatus	L. crispatus
	L. gallinarum	L. ingluviei R2	L. kitasatonis	L. kitasatonis
		L.mucosae	L. amylovorus	L. amylovorus
		L. oris	L. amylovorus	L. gallinarum
13	L. crispatus		L. reuteri T2
14	L. kitasatonis		L. plantarum

Back to article page

ISSN: 1471-2180

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com

BMC Microbiology

Contact us