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Table 2 Results of identification by 16S rDNA sequencing of presumptive Brucella cultures

From: Persistence of bacterial indicators and zoonotic pathogens in contaminated cattle wastes

Number

Source

Closest relative

% similarity

A11

A

B. microti (NR.042549.1); B. ceti (NR.042463.1); B. pinnipedialis (NR.042462.1); B. suis (NR.042461.1); B. abortus (NR.042460.1); B. neotomae (NR.043004.1); B. melitensis biovar melitensis (NR.043003.1); B. canis (NR.044652.1); Och. intermedium (NR.042447.1); Och. cytisi (NR.043184.1); Och. lupini (NR.042911.1); Och. anthropi (NR.026039.1); B. ovis (NR.036772.1); Och. tritici (NR.028902.1)

99

A11p

Microbacterium xylanilyticum (NR.042350.1)

97

A11g

Microbacterium xylanilyticum (NR.042350.1)

98

B11

B1

Och. intermedium (NR.042447.1); Och. anthropi (NR.026039.1); B. microti (NR.042549.1); B. ceti (NR.042463.1); B. pinnipedialis (NR.042462.1); B. suis (NR.042461.1); B. abortus (NR.042460.1); B. neotomae (NR.043004.1); B. melitensis biovar melitensis (NR.043003.1); B. canis (NR.044652.1); B. ovis (NR.036772.1); Och. tritici (NR.028902.1)

99

B12

B. microti (NR.042549.1); B. ceti (NR.042463.1); B. pinnipedialis (NR.042462.1); B. suis (NR.042461.1); B. abortus (NR.042460.1); B. neotomae (NR.043004.1); B. melitensis biovar melitensis (NR.043003.1); B. canis (NR.044652.1); B. ovis (NR.036772.1); Och. cytisi (NR.043184.1); Ochcpo lupini (NR.042911.1)

99

B31

B3

Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1); Providencia rettgeri (NR.042413.1)

99

B32

Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1); Providencia rettgeri (NR.042413.1)

99

C11

C

Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia rettgeri (NR.042413.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1)

99

C12

Providencia rettgeri (NR.042413.1); Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1)

99

D11

D

Providencia rettgeri (NR.042413.1); Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1)

99

D12

 

Providencia rustigianii (NR.042411.1); Providencia rettgeri (NR.042413.1); Providencia alcalifaciens (NR.042053.1)

99

D13

Providencia rettgeri (NR.042413.1); Providencia rustigianii (NR.042411.1)

98

D14

Myroides odoratus (NR.044698.1)

96

E12

E

Proteus myxofaciens (NR.043999.1); Proteus vulgaris (NR.025336.1)

99

E13

Proteus mirabilis (NR.043997.1)

99

E14

Providencia rettgeri (NR.042413.1)

98

E15

Proteus mirabilis (NR.043997.1)

100

F11

F

Proteus mirabilis (NR.043997.1)

99

F12

Proteus mirabilis (NR.043997.1)

100

F13

Proteus mirabilis (NR.043997.1)

98

F15

Providencia rustigianii (NR.042411.1)

99