Skip to main content

Table 2 Primer pairs designed for amplifying tufB, groEL and inmp gene nucleotide sequences in direct (d) and nested (n) PCR reactions

From: Candidatus Phytoplasma phoenicium’ associated with almond witches’-broom disease: from draft genome to genetic diversity among strain populations

Gene

Primer

Sequence (5′-3′)

Amplicon size (nt)

tufB

fusAF1 (d)

ATCGTGGTAATGCGATTGTGG

1431

 

tufBR1 (d)

ACAGAACCAGCTCCAACAGTACGTCC

 
 

fusAF2 (n)

TGGTTATGCAACCACTTTACGTTC

1320

 

tufBR2 (n)

TAGTGCAATAGGATGAATTAAAGTCAC

 

groEL

groELF1 (d)

TGATAATGCAGGCGACGGAACTAC

1336

 

groELR1 (d)

TCACAGCCACTACGGCAGCACCAGCTG

 
 

groELF2 (n)

ACTACTACAGCTACTGTATTAGCAC

1284

 

groELR2 (n)

TAGATGCTGCAATAGAAGAAGCATTG

 

inmp

inmpF1 (d)

AGTAATTAATTTTCAATATTGGACTG

668

 

inmpR1 (d)

TCACATCATCCTCATTCATTTTTGAAGC

 
 

inmpF2 (n)

AGAAATCTTATCAGTGGTATCAGTC

413

 

inmpR2 (n)

TCTTTATCTATTGTTTTATATGCCAC