Investigating the host specificity of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli by sequencing gyrase subunit A

Table 1 Distribution of C. jejuni gyrA alleles by source and conserved nucleotide

Peptide group	Allele no.*	Nucleotide position									Distribution by source**			No. of ST
Peptide group	Allele no.*	64	111	210	257	276	324	408	438	486	SW	DM	P	No. of ST
	1	A	G	C	C	G	A	G	C	A	26	27	22	26
	4	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2	14	6	6
	5	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3	12	10	11
	7	.	.	.	.	.	.	.	.	.	45	8	16	11
	11	.	.	.	.	.	.	A	.	.	26	10		22
	12	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	13	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3		4	5
	16	.	.	.	.	.	.	.	.	.			4	2
	18	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	19	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6			1
	31	.	.	.	.	.	.	.	.	.	22	1		11
1	36	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5			5
	39	.	.	.	.	.	.	A	.	.	1			1
	40	.	.	.	.	.	.	A	.	.	13			8
	41	.	.	.	.	.	.	A	.	.	3			3
	56	.	.	.	.	.	.	A	.	.	3			2
	66	.	.	.	.	.	.	A	.	.	1			1
	73	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
	74	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
	75	.	.	T	.	.	.	.	.	.	1			1
	76	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2			1
	79	.	.	.	.	.	.	A	.	.	1			1
	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
	2	.	.	.	T	.	.	.	.	.			3	3
	3	.	.	.	T	.	.	.	.	.	9	3	6	9
	8	.	.	.	T	.	.	.	.	.	14	17	13	14
2	15	.	.	.	T	.	.	.	.	.			2	2
	17	.	.	.	T	.	.	.	.	.			2	2
	30	.	.	.	T	.	.	.	.	.	3		1	4
	44	.	.	.	T	.	.	.	.	.			2	2
3	6	G	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	9	G	.	.	T	.	.	.	.	.	2	2	20	11
4	53	G	.	.	T	.	.	.	.	.	1			1
	78	G	.	.	T	.	.	.	.	.			1	1
	10	G	.	.	.	.	.	.	.	.	7	4	6	10
5	23	G	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
	27	G	.	.	.	.	.	.	.	.	1			1
6	14	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1	1
8	24	G	.	.	T	.	.	.	.	.		1	1	2
14	54	.	A	T	.	A	G	A	T	G	1			1
	55	.	A	T	.	A	G	A	T	G	2			1
301	301	.	T	T	.	A	.	.	A	.			1	1

*Nucleotide allele number, **SW=Surface water, DM=Domesticated Mammals, P=Poultry.

ISSN: 1471-2180