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Table 1 Distribution of C. jejuni gyrA alleles by source and conserved nucleotide

From: Investigating the host specificity of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli by sequencing gyrase subunit A

Peptide group

Allele no.*

Nucleotide position

Distribution by source**

No. of ST

64

111

210

257

276

324

408

438

486

SW

DM

P

 

1

A

G

C

C

G

A

G

C

A

26

27

22

26

 

4

.

.

.

.

.

.

.

.

.

2

14

6

6

 

5

.

.

.

.

.

.

.

.

.

3

12

10

11

 

7

.

.

.

.

.

.

.

.

.

45

8

16

11

 

11

.

.

.

.

.

.

A

.

.

26

10

 

22

 

12

.

.

.

.

.

.

.

.

.

  

1

1

 

13

.

.

.

.

.

.

.

.

.

3

 

4

5

 

16

.

.

.

.

.

.

.

.

.

  

4

2

 

18

.

.

.

.

.

.

.

.

.

  

1

1

 

19

.

.

.

.

.

.

.

.

.

6

  

1

 

31

.

.

.

.

.

.

.

.

.

22

1

 

11

1

36

.

.

.

.

.

.

.

.

.

5

  

5

 

39

.

.

.

.

.

.

A

.

.

1

  

1

 

40

.

.

.

.

.

.

A

.

.

13

  

8

 

41

.

.

.

.

.

.

A

.

.

3

  

3

 

56

.

.

.

.

.

.

A

.

.

3

  

2

 

66

.

.

.

.

.

.

A

.

.

1

  

1

 

73

.

.

.

.

.

.

.

.

.

1

  

1

 

74

.

.

.

.

.

.

.

.

.

1

  

1

 

75

.

.

T

.

.

.

.

.

.

1

  

1

 

76

.

.

.

.

.

.

.

.

.

2

  

1

 

79

.

.

.

.

.

.

A

.

.

1

  

1

 

80

.

.

.

.

.

.

.

.

.

1

  

1

 

2

.

.

.

T

.

.

.

.

.

  

3

3

 

3

.

.

.

T

.

.

.

.

.

9

3

6

9

 

8

.

.

.

T

.

.

.

.

.

14

17

13

14

2

15

.

.

.

T

.

.

.

.

.

  

2

2

 

17

.

.

.

T

.

.

.

.

.

  

2

2

 

30

.

.

.

T

.

.

.

.

.

3

 

1

4

 

44

.

.

.

T

.

.

.

.

.

  

2

2

3

6

G

.

.

.

.

.

.

.

.

  

1

1

 

9

G

.

.

T

.

.

.

.

.

2

2

20

11

4

53

G

.

.

T

.

.

.

.

.

1

  

1

 

78

G

.

.

T

.

.

.

.

.

  

1

1

 

10

G

.

.

.

.

.

.

.

.

7

4

6

10

5

23

G

.

.

.

.

.

.

.

.

  

1

1

 

27

G

.

.

.

.

.

.

.

.

1

  

1

6

14

.

.

.

.

.

.

.

.

.

  

1

1

8

24

G

.

.

T

.

.

.

.

.

 

1

1

2

14

54

.

A

T

.

A

G

A

T

G

1

  

1

 

55

.

A

T

.

A

G

A

T

G

2

  

1

301

301

.

T

T

.

A

.

.

A

.

  

1

1

  1. *Nucleotide allele number, **SW=Surface water, DM=Domesticated Mammals, P=Poultry.