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Table 1 Distribution of C. jejuni gyrA alleles by source and conserved nucleotide

From: Investigating the host specificity of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli by sequencing gyrase subunit A

Peptide group Allele no.* Nucleotide position Distribution by source** No. of ST
64 111 210 257 276 324 408 438 486 SW DM P
  1 A G C C G A G C A 26 27 22 26
  4 . . . . . . . . . 2 14 6 6
  5 . . . . . . . . . 3 12 10 11
  7 . . . . . . . . . 45 8 16 11
  11 . . . . . . A . . 26 10   22
  12 . . . . . . . . .    1 1
  13 . . . . . . . . . 3   4 5
  16 . . . . . . . . .    4 2
  18 . . . . . . . . .    1 1
  19 . . . . . . . . . 6    1
  31 . . . . . . . . . 22 1   11
1 36 . . . . . . . . . 5    5
  39 . . . . . . A . . 1    1
  40 . . . . . . A . . 13    8
  41 . . . . . . A . . 3    3
  56 . . . . . . A . . 3    2
  66 . . . . . . A . . 1    1
  73 . . . . . . . . . 1    1
  74 . . . . . . . . . 1    1
  75 . . T . . . . . . 1    1
  76 . . . . . . . . . 2    1
  79 . . . . . . A . . 1    1
  80 . . . . . . . . . 1    1
  2 . . . T . . . . .    3 3
  3 . . . T . . . . . 9 3 6 9
  8 . . . T . . . . . 14 17 13 14
2 15 . . . T . . . . .    2 2
  17 . . . T . . . . .    2 2
  30 . . . T . . . . . 3   1 4
  44 . . . T . . . . .    2 2
3 6 G . . . . . . . .    1 1
  9 G . . T . . . . . 2 2 20 11
4 53 G . . T . . . . . 1    1
  78 G . . T . . . . .    1 1
  10 G . . . . . . . . 7 4 6 10
5 23 G . . . . . . . .    1 1
  27 G . . . . . . . . 1    1
6 14 . . . . . . . . .    1 1
8 24 G . . T . . . . .   1 1 2
14 54 . A T . A G A T G 1    1
  55 . A T . A G A T G 2    1
301 301 . T T . A . . A .    1 1
  1. *Nucleotide allele number, **SW=Surface water, DM=Domesticated Mammals, P=Poultry.
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