Table 1 Samples and isolates used in this study
Milk sample | Staphylococcal concentration (log10 cfu mL-1 ± SD; n = 3) | Identified species (number of isolates) | Number of PFGE profiles (S. epidermidis) | Characterized S. epidermidis strains |
|---|---|---|---|---|
A. Women with mastitis | ||||
1 | 5.28 ± 0.05 | S. epidermidis (5) S. aureus (5) | 1 | C213 |
2 | 4.78 ± 0.32 | S. epidermidis (10) | 3 | CJBP1 CJBP2 CJBP3 |
3 | Nd | - | - | - |
4 | Nd | - | - | - |
5 | 4.91 ± 0.29 | S. epidermidis (8) S. aureus (1) S. pasteuri (1) | 1 | B |
6 | 4.41 ± 0.17 | S. epidermidis (7) S. hominis (3) | 1 | K |
7 | 4.04 ± 0.09 | S. epidermidis (7) S. aureus (3) | 2 | CJ9 CJ11 |
8 | 4.91 ± 0.50 | S. epidermidis (10) | 3 | S1LDC12 S1LDC13 S1LDC18 |
9 | 4.72 ± 0.44 | S. epidermidis (2) S. pasteuri (4) S. hominis (4) | 1 | F12 |
10 | 4.23 ± 0.47 | S. epidermidis (10) | 1 | DC2Lae |
11 | 4.38 ± 0.22 | S. epidermidis (6) S. aureus (4) | 1 | B1CD2 |
12 | 4.08 ± 0.51 | S. epidermidis (10) | 1 | DD2Laa |
13 | Nd | - | - | - |
14 | 4.25 ± 0.08 | S. epidermidis (5) S. aureus (5) | 1 | PLD21 |
15 | 4.41 ± 0.15 | S. epidermidis (10) | 1 | P2LD1 |
16 | 4.51 ± 0.12 | S. epidermidis (6) S. warneri (4) | 1 | M121 |
17 | 4.52 ± 0.04 | S. epidermidis (7) S. pasteuri (3) | 1 | DF2Lab |
18 | 4.80 ± 0.53 | S. epidermidis (8) S. warneri (2) | 1 | V1LD1 |
19 | 5.68 ± 0.22 | S. epidermidis (8) S. pasteuri (2) | 1 | DH3LIk |
20 | 4.48 ± 0.33 | S. epidermidis (9) S. hominis (1) | 2 | DG2ñ DG2s |
21 | 4.04 ± 0.12 | S. epidermidis (5) S. warneri (5) | 1 | YGLI4 |
22 | 4.17 ± 0.06 | S. epidermidis (7) S. aureus (3) | 1 | ASLI3 |
23 | 5.44 ± 0.09 | S. epidermidis (10) | 3 | ASLD1 ASLD2 ASLD3 |
24 | 4.15 ± 0.45 | S. epidermidis (7) S. pasteuri (3) | 1 | ARLI1 |
25 | 4.64 ± 0.14 | S. epidermidis (10) | 4 | Z2LDC11 Z2LDC12 Z2LDC14 Z2LDC17 |
26 | 4.02 ± 0.22 | S. epidermidis (10) | 1 | AQLI2 |
27 | 4.05 ± 0.07 | S. epidermidis (6) S. aureus (4) | 1 | AQLD3 |
28 | 4.04 ± 0.03 | S. aureus (10) | - | - |
29 | 4.09 ± 0.09 | S. epidermidis (7) S. pasteuri (3) | 1 | AEA1 |
30 | 4.05 ± 0.24 | S. epidermidis (10) | 4 | YLIC13 YLIC14 YLIC16 YLIC17 |
B. Healthy women | ||||
1 | 2.91 ± 0.27 | S. epidermidis (5) S. aureus (4) S. lugdunensis (1) | 5 | LC016 LC017 LC019 LC044 LC047 |
2 | 2.41 ± 0.09 | S. epidermidis (10) | 3 | LE010 LE011 LE035 |
3 | 2.04 ± 0.11 | S. epidermidis (10) | 5 | LG005 LG006 LG5021 LG5022 LG5023 |
4 | 1.91 ± 0.12 | S. epidermidis (10) | 2 | LP22 LP223 |
5 | 2.02 ± 0.29 | S. epidermidis (8) S. hominis (2) | 3 | LV221 LV222 LV521 |
6 | 2.93 ± 0.21 | S. epidermidis (10) | 3 | LX5RB3 LX5RB4 LX5081 |
7 | 2.38 ± 0.14 | S. epidermidis (4) S. aureus (4) S. hominis (2) | 3 | LO5081 LO5082 LO5RB1 |
8 | 2.58 ± 0.31 | S. epidermidis (10) | 3 | LCC5081 LCC5082 LCC0592 |
9 | 2.48 ± 0.07 | S. epidermidis (8) S. aureus (2) | 4 | LI5081 LI5094 LIRB1 LIRB2 |
10 | 2.25 ± 0.10 | S. epidermidis (10) | 2 | LV5081 LV5RB3 |
11 | 2.41 ± 0.12 | S. epidermidis (10) | 2 | LG5082a LGRB1 |
12 | 2.51 ± 0.22 | S. epidermidis (10) | 1 | 24C13 |