TY - JOUR AU - Bruhn, J. B. AU - Nielsen, K. F. AU - Hjelm, M. AU - Hansen, M. AU - Bresciani, J. AU - Schulz, S. AU - Gram, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Ecology, inhibitory activity, and morphogenesis of a marine antagonistic bacterium belonging to the Roseobacter clade JO - Appl Environ Microbiol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.11.7263-7270.2005 DO - 10.1128/AEM.71.11.7263-7270.2005 ID - Bruhn2005 ER - TY - JOUR AU - Wagner-Döbler, I. AU - Biebl, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Environmental biology of the marine Roseobacter lineage JO - Annu Rev Microbiol VL - 60 ID - Wagner-Döbler2006 ER - TY - JOUR AU - Brinkhoff, T. AU - Bach, G. AU - Heidorn, T. AU - Liang, L. AU - Schlingloff, A. AU - Simon, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Antibiotic production by a Roseobacter clade-affiliated species from the German Wadden Sea and its antagonistic effects on indigenous isolates JO - Appl Environ Microbiol VL - 70 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.70.4.2560-2565.2003 DO - 10.1128/AEM.70.4.2560-2565.2003 ID - Brinkhoff2004 ER - TY - JOUR AU - Brinkhoff, T. AU - Giebel, H. A. AU - Simon, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Diversity, ecology, and genomics of the Roseobacter clade: a short overview JO - Arch Microbiol VL - 189 UR - https://doi.org/10.1007/s00203-008-0353-y DO - 10.1007/s00203-008-0353-y ID - Brinkhoff2008 ER - TY - JOUR AU - Wagner-Döbler, I. AU - Thiel, V. AU - Eberl, L. AU - Allgaier, M. AU - Bodor, A. AU - Meyer, S. AU - Ebner, S. AU - Hennig, A. AU - Pukall, R. AU - Schulz, S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Discovery of complex mixtures of novel longchain quorum sensing signals in free-living and host-associated marine Alphaproteobacteria JO - ChemBioChem VL - 6 UR - https://doi.org/10.1002/cbic.200500189 DO - 10.1002/cbic.200500189 ID - Wagner-Döbler2005 ER - TY - JOUR AU - Buchan, A. AU - Gonzalez, J. M. AU - Moran, M. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Overview of the marine Roseobacter lineage JO - Appl Environ Microbiol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.10.5665-5677.2005 DO - 10.1128/AEM.71.10.5665-5677.2005 ID - Buchan2005 ER - TY - JOUR AU - Bruhn, J. B. AU - Haagensen, J. A. AU - Bagge-Ravn, D. AU - Gram, L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Culture conditions of Roseobacter strain 27-4 affect its attachment and biofilm formation as quantified by real-time PCR JO - Appl Environ Microbiol VL - 72 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.72.4.3011-3015.2006 DO - 10.1128/AEM.72.4.3011-3015.2006 ID - Bruhn2006 ER - TY - JOUR AU - Planas, M. AU - Pérez-Lorenzo, M. AU - Hjelm, M. AU - Gram, L. AU - Fiksdal, I. U. AU - Bergh, O. AU - Pintado, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Probiotic effect in vivo of Roseobacter strain 27-4 against Vibrio (Listonella) anguillarum infections in turbot (Scophthalmus maximus L.) larvae JO - Aquaculture VL - 255 UR - https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2005.11.039 DO - 10.1016/j.aquaculture.2005.11.039 ID - Planas2006 ER - TY - JOUR AU - Shiba, T. PY - 1991 DA - 1991// TI - Roseobacter litoralis gen-nov, sp-nov, and Roseobacter denitrificans sp-nov, aerobic pink-pigmented bacteria which contain bacteriochlorophyll-a JO - System Appl Microbiol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/S0723-2020(11)80292-4 DO - 10.1016/S0723-2020(11)80292-4 ID - Shiba1991 ER - TY - JOUR AU - Moran, M. A. AU - Buchan, A. AU - González, J. M. AU - Heidelberg, J. F. AU - Whitman, W. B. AU - Kiene, R. P. AU - Henriksen, J. R. AU - King, G. M. AU - Belas, R. AU - Fuqua, C. AU - Brinkac, L. AU - Lewis, M. AU - Johri, S. AU - Weaver, B. AU - Pai, G. AU - Eisen, J. A. AU - Rahe, E. AU - Sheldon, W. M. AU - Ye, W. AU - Miller, T. R. AU - Carlton, J. AU - Rasko, D. A. AU - Paulsen, I. T. AU - Ren, Q. AU - Daugherty, S. C. AU - Deboy, R. T. AU - Dodson, R. J. AU - Durkin, A. S. AU - Madupu, R. AU - Nelson, W. C. AU - Sullivan, S. A. AU - Rosovitz, M. J. AU - Haft, D. H. AU - Selengut, J. AU - Ward, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genome sequence of Silicibacter pomeroyi reveals adaptations to the marine environment JO - Nature VL - 432 UR - https://doi.org/10.1038/nature03170 DO - 10.1038/nature03170 ID - Moran2004 ER - TY - JOUR AU - Swingley, W. D. AU - Sadekar, S. AU - Mastrian, S. D. AU - Matthies, H. J. AU - Hao, J. AU - Ramos, H. AU - Acharya, C. R. AU - Conrad, A. L. AU - Taylor, H. L. AU - Dejesa, L. C. AU - Shah, M. K. AU - O'Huallachain, M. E. AU - Lince, M. T. AU - Blankenship, R. E. AU - Beatty, J. T. AU - Touchman, J. W. PY - 2007 DA - 2007// TI - The complete genome sequence of Roseobacter denitrificans reveals a mixotrophic rather than photosynthetic metabolism JO - J Bacteriol VL - 189 UR - https://doi.org/10.1128/JB.01390-06 DO - 10.1128/JB.01390-06 ID - Swingley2007 ER - TY - JOUR AU - Pommerenke, C. AU - Gabriel, I. AU - Bunk, B. AU - Münch, R. AU - Haddad, I. AU - Tielen, P. AU - Wagner-Döbler, I. AU - Jahn, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - ROSY - a flexible and universal database and bioinformatics tool platform for Roseobacter related species JO - In Silico Biol VL - 8 ID - Pommerenke2008 ER - TY - JOUR AU - Moran, M. A. AU - Belas, R. AU - Schell, M. A. AU - González, J. M. AU - Sun, F. AU - Sun, S. AU - Binder, B. J. AU - Edmonds, J. AU - Ye, W. AU - Orcutt, B. AU - Howard, E. C. AU - Meile, C. AU - Palefsky, W. AU - Goesmann, A. AU - Ren, Q. AU - Paulsen, I. AU - Ulrich, L. E. AU - Thompson, L. S. AU - Saunders, E. AU - Buchan, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Ecological genomics of marine Roseobacters JO - Appl Environ Microbiol VL - 73 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02580-06 DO - 10.1128/AEM.02580-06 ID - Moran2007 ER - TY - JOUR AU - Pradella, S. AU - Allgaier, M. AU - Hoch, C. AU - Päuker, O. AU - Stackebrandt, E. AU - Wagner-Döbler, I. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genome organization and localization of the pufLM genes of the photosynthesis reaction center in phylogenetically diverse marine Alphaproteobacteria JO - Appl Environ Microbiol VL - 70 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.70.6.3360-3369.2004 DO - 10.1128/AEM.70.6.3360-3369.2004 ID - Pradella2004 ER - TY - JOUR AU - Novick, R. P. PY - 1987 DA - 1987// TI - Plasmid incompatibility JO - Microbiol Rev VL - 51 ID - Novick1987 ER - TY - JOUR AU - Fornari, C. S. AU - Kaplan, S. PY - 1982 DA - 1982// TI - Genetic transformation of Rhodopseudomonas sphaeroides by plasmid-DNA JO - J Bacteriol VL - 152 ID - Fornari1982 ER - TY - JOUR AU - Kurien, B. T. AU - Scofield, R. H. PY - 1995 DA - 1995// TI - Polyethylene glycol-mediated bacterial colony transformation JO - Biotechniques VL - 18 ID - Kurien1995 ER - TY - JOUR AU - Pemberton, J. M. AU - Cooke, S. AU - Bowen, A. R. PY - 1983 DA - 1983// TI - Gene transfer mechanisms among members of the genus Rhodopseudomonas JO - Ann Microbiol (Paris) VL - 134B ID - Pemberton1983 ER - TY - JOUR AU - Geng, H. AU - Bruhn, J. B. AU - Nielsen, K. F. AU - Gram, L. AU - Belas, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genetic dissection of tropodithietic acid biosynthesis by marine Roseobacters JO - Appl Environ Microbiol VL - 74 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.02339-07 DO - 10.1128/AEM.02339-07 ID - Geng2008 ER - TY - JOUR AU - Miller, T. R. AU - Belas, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Motility is involved in Silicibacter sp. TM1040 interaction with dinoflagellates JO - Environ Microbiol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2006.01071.x DO - 10.1111/j.1462-2920.2006.01071.x ID - Miller2006 ER - TY - JOUR AU - Howard, E. C. AU - Henriksen, J. R. AU - Buchan, A. AU - Reisch, C. R. AU - Bürgmann, H. AU - Welsh, R. AU - Ye, W. AU - González, J. M. AU - Mace, K. AU - Joye, S. B. AU - Kiene, R. P. AU - Whitman, W. B. AU - Moran, M. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Bacterial taxa that limit sulfur flux from the ocean JO - Science VL - 314 UR - https://doi.org/10.1126/science.1130657 DO - 10.1126/science.1130657 ID - Howard2006 ER - TY - JOUR AU - Sebastian, M. AU - Ammerman, J. W. PY - 2009 DA - 2009// TI - The alkaline phosphatase PhoX is more widely distributed in marine bacteria than the classical PhoA JO - ISME J VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/ismej.2009.10 DO - 10.1038/ismej.2009.10 ID - Sebastian2009 ER - TY - JOUR AU - Curson, A. R. AU - Rogers, R. AU - Todd, J. D. AU - Brearley, C. A. AU - Johnston, A. W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Molecular genetic analysis of a dimethylsulfoniopropionate lyase that liberates the climate-changing gas dimethylsulfide in several marine alpha-proteobacteria and Rhodobacter sphaeroides JO - Environ Microbiol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2007.01499.x DO - 10.1111/j.1462-2920.2007.01499.x ID - Curson2008 ER - TY - JOUR AU - Martens, T. AU - Heidorn, T. AU - Pukall, R. AU - Simon, M. AU - Tindall, B. AU - Brinkhoff, T. PY - 2006 DA - 2006// TI - Reclassification of Roseobacter gallaeciensis Ruiz-Ponte et al 1998 as Phaeobacter gallaeciensis gen nov, com nov, and description of Phaeobacter inhibens sp nov, antibiotic-producing members of the Roseobacter clade JO - J System Evol Microbiol VL - 56 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.63724-0 DO - 10.1099/ijs.0.63724-0 ID - Martens2006 ER - TY - JOUR AU - Biebl, H. AU - Allgaier, M. AU - Tindall, B. J. AU - Koblizek, M. AU - Lünsdorf, H. AU - Pukall, R. AU - Wagner-Döbler, I. PY - 2005 DA - 2005// TI - Dinoroseobacter shibae gen. nov., sp nov., a new aerobic phototrophic bacterium isolated from dinoflagellates JO - Internat J System Evol Microbiol VL - 55 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.63511-0 DO - 10.1099/ijs.0.63511-0 ID - Biebl2005 ER - TY - JOUR AU - Thoma, S. AU - Schobert, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - An improved Escherichia coli donor strain for diparental mating JO - FEMS Microbiol Lett VL - 294 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2009.01556.x DO - 10.1111/j.1574-6968.2009.01556.x ID - Thoma2009 ER - TY - JOUR AU - Lambs, L. AU - Venturini, M. AU - Decock-Le Révérend, B. AU - Kozlowski, H. AU - Berthon, G. PY - 1988 DA - 1988// TI - Metal iontetracycline interactions in biological fluids. Part 8. Potentiometric and spectroscopic studies on the formation of Ca(II) and Mg(II) complexes with 4-dedimethylaminotetracycline and 6-desoxy-6-demethyl-tetracycline JO - J Inorg Biochem VL - 33 UR - https://doi.org/10.1016/0162-0134(88)80049-7 DO - 10.1016/0162-0134(88)80049-7 ID - Lambs1988 ER - TY - JOUR AU - Balenci, D. AU - Bernardi, F. AU - Cellai, L. AU - D'Amelio, N. AU - Gaggelli, E. AU - Gaggelli, N. AU - Molteni, E. AU - Valensin, G. PY - 2008 DA - 2008// TI - Effect of Cu(II) on the complex between kanamycin A and the bacterial ribosomal A site JO - Chembiochem VL - 9 UR - https://doi.org/10.1002/cbic.200700387 DO - 10.1002/cbic.200700387 ID - Balenci2008 ER - TY - JOUR AU - Lambrou, D. B. AU - Tahos, B. S. AU - Lambrou, K. D. PY - 1977 DA - 1977// TI - In vitro studies of the phenomenon of tetracycline incorporation into enamel JO - J Dent Res VL - 56 UR - https://doi.org/10.1177/00220345770560122201 DO - 10.1177/00220345770560122201 ID - Lambrou1977 ER - TY - JOUR AU - Loftin, K. A. AU - Adams, C. D. AU - Meyer, M. T. AU - Surampalli, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Effects of ionic strength, temperature, and pH on degradation of selected antibiotics JO - J Environ Qual VL - 37 UR - https://doi.org/10.2134/jeq2007.0230 DO - 10.2134/jeq2007.0230 ID - Loftin2008 ER - TY - JOUR AU - Poiger, H. AU - Schlatter, C. PY - 1979 DA - 1979// TI - Interaction of cations and chelators with the intestinal absorption of tetracycline JO - Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol VL - 306 UR - https://doi.org/10.1007/BF00515599 DO - 10.1007/BF00515599 ID - Poiger1979 ER - TY - JOUR AU - Kim, T. E. AU - Jeong, Y. W. AU - Cho, S. H. AU - Kim, S. J. AU - Kwon, H. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Chronological study of antibiotic resistances and their relevant genes in Korean avian pathogenic Escherichia coli isolates JO - J Clin Microbiol VL - 45 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.01922-06 DO - 10.1128/JCM.01922-06 ID - Kim2007 ER - TY - JOUR AU - Henwood, C. J. AU - Livermore, D. M. AU - James, D. AU - Warner, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Antimicrobial susceptibility of Pseudomonas aeruginosa: results of a UK survey and evaluation of the British Society for Antimicrobial Chemotherapy disc susceptibility test JO - J Antimicrob Chemother VL - 47 UR - https://doi.org/10.1093/jac/47.6.789 DO - 10.1093/jac/47.6.789 ID - Henwood2001 ER - TY - JOUR AU - Jones, R. N. PY - 2001 DA - 2001// TI - Resistance patterns among nosocomial pathogens: trends over the past few years JO - Chest VL - 119 UR - https://doi.org/10.1378/chest.119.2_suppl.397S DO - 10.1378/chest.119.2_suppl.397S ID - Jones2001 ER - TY - JOUR AU - Markowitz, V. M. AU - Szeto, E. AU - Palaniappan, K. AU - Grechkin, Y. AU - Chu, K. AU - Chen, I. M. A. AU - Dubchak, I. AU - Anderson, I. AU - Lykidis, A. AU - Mavromatis, K. AU - Ivanova, N. N. AU - Kyrpides, N. C. PY - 2007 DA - 2007// TI - The integrated microbial genomes (IMG) system in: data content and analysis tool extensions JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm846 DO - 10.1093/nar/gkm846 ID - Markowitz2007 ER - TY - JOUR AU - Hashemi, F. B. AU - Schutze, G. E. AU - Mason, E. O. PY - 1996 DA - 1996// TI - Discrepancies between results by E-test and standard microbroth dilution testing of Streptococcus pneumoniae for susceptibility to vancomycin JO - J Clin Microbiol VL - 34 ID - Hashemi1996 ER - TY - JOUR AU - Sepandj, F. AU - Ceri, H. AU - Gibb, A. AU - Read, R. AU - Olson, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Minimum inhibitory concentration versus minimum biofilm eliminating concentration in evaluation of antibiotic sensitivity of enterococci causing peritonitis JO - Perit Dial Int VL - 24 ID - Sepandj2004 ER - TY - CHAP AU - Sambrook, J. AU - Fritsch, E. F. AU - Maniatis, T. PY - 1989 DA - 1989// TI - Molecular Cloning BT - A Laboratory Manual PB - Cold Spring Harbor Laboratory Press CY - Cold Spring Harbor, N.Y ID - Sambrook1989 ER - TY - JOUR AU - Hilton, J. C. AU - Temple, C. A. AU - Rajagopalan, K. V. PY - 1999 DA - 1999// TI - Re-design of Rhodobacter sphaeroides dimethyl sulfoxide reductase. Enhancement of adenosine N1-oxide reductase activity JO - J Biol Chem VL - 274 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.274.13.8428 DO - 10.1074/jbc.274.13.8428 ID - Hilton1999 ER - TY - JOUR AU - Choi, K. H. AU - Kumar, A. AU - Schweizer, H. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - A 10-min method for preparation of highly electrocompetent Pseudomonas aeruginosa cells: application for DNA fragment transfer between chromosomes and plasmid transformation JO - J Microbiol Methods VL - 64 UR - https://doi.org/10.1016/j.mimet.2005.06.001 DO - 10.1016/j.mimet.2005.06.001 ID - Choi2006 ER - TY - JOUR AU - Espinosa-Urgel, M. AU - Ramos, J. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Cell density-dependent gene contributes to efficient seed colonization by Pseudomonas putida KT2240 JO - Appl Environ Microbiol VL - 70 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.70.9.5190-5198.2004 DO - 10.1128/AEM.70.9.5190-5198.2004 ID - Espinosa-Urgel2004 ER - TY - JOUR AU - Jin, D. J. AU - Gross, C. A. PY - 1989 DA - 1989// TI - Characterization of the pleiotropic phenotypes of rifampin-resistant rpoB mutants of Escherichia coli JO - J Bacteriol VL - 171 ID - Jin1989 ER - TY - JOUR AU - Reid, P. PY - 1971 DA - 1971// TI - Isolation of cold sensitive-rifampicin resistant RNA polymerase mutants of Escherichia coli JO - Biochem Biophys Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1016/S0006-291X(71)80145-6 DO - 10.1016/S0006-291X(71)80145-6 ID - Reid1971 ER - TY - JOUR AU - Keen, N. T. AU - Tamaki, S. AU - Kobayashi, D. AU - Trollinger, D. PY - 1988 DA - 1988// TI - Improved broad-host-range plasmids for DNA cloning in Gram-negative bacteria JO - Gene VL - 70 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(88)90117-5 DO - 10.1016/0378-1119(88)90117-5 ID - Keen1988 ER - TY - JOUR AU - Schneider, K. H. AU - Giffhorn, F. PY - 1994 DA - 1994// TI - Overproduction of mannitol dehydrogenase in Rhodobacter sphaeroides JO - Appl Microbiol Biotechnol VL - 41 UR - https://doi.org/10.1007/BF00178493 DO - 10.1007/BF00178493 ID - Schneider1994 ER - TY - JOUR AU - Kovach, M. E. AU - Phillips, P. H. AU - Elzer, P. H. AU - Roop, R. M. AU - Peterson, K. M. PY - 1994 DA - 1994// TI - pBBR1MCS: A Broad-Host-Range Cloning Vector JO - BioTechniques VL - 16 ID - Kovach1994 ER - TY - JOUR AU - Kovach, M. E. AU - Elzer, P. H. AU - Hill, D. S. AU - Robertson, G. T. AU - Farris, M. A. AU - Roop, R. M. AU - Peterson, K. M. PY - 1995 DA - 1995// TI - Four new derivates of the broad-host-range cloning vector pBBR1MCS, carrying different antibiotic-resistance cassettes JO - Gene VL - 166 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(95)00584-1 DO - 10.1016/0378-1119(95)00584-1 ID - Kovach1995 ER - TY - JOUR AU - Hoang, T. T. AU - Karkhoff-Schweizer, R. R. AU - Kutchma, A. J. AU - Schweizer, H. P. PY - 1998 DA - 1998// TI - A broad-host-range Flp-FRT recombination system for site-specific excision of chromosomally-located DNA sequences: application for isolation of unmarked Pseudomonas aeruginosa mutants JO - Gene VL - 212 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-1119(98)00130-9 DO - 10.1016/S0378-1119(98)00130-9 ID - Hoang1998 ER - TY - CHAP AU - Schweizer, H. P. AU - Klassen, T. R. AU - Hoang, T. ED - Nakazawa, T. ED - Furukawa, K. ED - Haas, D. ED - Silver, S. PY - 1996 DA - 1996// TI - Improved methods for gene analysis in Pseudomonas BT - Molecular Biology of Pseudomonads; Washington DC ID - Schweizer1996 ER - TY - JOUR AU - Staskawicz, B. AU - Dahlbeck, D. AU - Keen, N. AU - Napoli, C. PY - 1987 DA - 1987// TI - Molecular characterization of cloned avirulence genes from race 0 and race 1 of Pseudomonas syringae pv. glycinea JO - J Bacteriol VL - 169 ID - Staskawicz1987 ER - TY - JOUR AU - Wagner-Döbler, I. AU - Ballhausen, B. AU - Baumgart, M. AU - Brinkhoff, T. AU - Buchholz, I. AU - Bunk, B. AU - Cypionka, H. AU - Daniel, R. AU - Drepper, T. AU - Gerdts, G. AU - Hahnke, S. AU - Han, C. AU - Jahn, D. AU - Kalhoefer, D. AU - Kiss, H. AU - Klenk, H. P. AU - Kyrpides, N. AU - Liebl, W. AU - Liesegang, H. AU - Meincke, L. AU - Pati, A. AU - Petersen, J. AU - Piekarski, T. AU - Pommerenke, C. AU - Pradella, S. AU - Pukall, R. AU - Rabus, R. AU - Stackebrandt, E. AU - Thole, S. AU - Thompson, L. AU - Tielen, P. AU - Tomasch, J. AU - von Jan, M. AU - Wanphrut, N. AU - Wichels, A. AU - Zech, H. AU - Simon, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - The complete genome sequence of the algal symbiont Dinoroseobacter shibae - a hitchhiker's guide to life in the sea JO - ISME J VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/ismej.2009.94 DO - 10.1038/ismej.2009.94 ID - Wagner-Döbler2010 ER - TY - JOUR AU - Kamada, K. AU - Hanaoka, F. AU - Burley, S. K. PY - 2003 DA - 2003// TI - Crystal structure of the MazE/MazF complex: molecular bases of antidote-toxin recognition JO - Mol Cell VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S1097-2765(03)00097-2 DO - 10.1016/S1097-2765(03)00097-2 ID - Kamada2003 ER - TY - JOUR AU - Cooper, T. F. AU - Heinemann, J. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Postsegregational killing does not increase plasmid stability but acts to mediate the exclusion of competing plasmids JO - Proc Natl Acad Sci VL - 97 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.220077897 DO - 10.1073/pnas.220077897 ID - Cooper2000 ER - TY - JOUR AU - Katzke, N. AU - Arvani, A. S. AU - Bergmann, R. AU - Circolone, F. O. AU - Markert, A. AU - Svensson, V. AU - Jaeger, K. E. AU - Heck, A. AU - Drepper, T. PY - 2009 DA - 2009// TI - A novel T7 RNA polymerase dependent expression system for high-level protein production in the phototrophic bacterium Rhodobacter capsulatus JO - Protein Expr Purif VL - 69 UR - https://doi.org/10.1016/j.pep.2009.08.008 DO - 10.1016/j.pep.2009.08.008 ID - Katzke2009 ER - TY - JOUR AU - Drepper, T. AU - Eggert, T. AU - Circolone, F. AU - Heck, A. AU - Krauss, U. AU - Guterl, J. K. AU - Wendorff, M. AU - Losi, A. AU - Gärtner, W. AU - Jaeger, K. E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Reporter proteins for in vivo fluorescence without oxygen JO - Nat Biotechnol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/nbt1293 DO - 10.1038/nbt1293 ID - Drepper2007 ER - TY - JOUR AU - Arai, H. AU - Igarashi, Y. AU - Kodama, T. PY - 1995 DA - 1995// TI - Expression of the nir and nor genes for denitrification of Pseudomonas aeruginosa requires a novel CRP/FNR-related transcriptional regulator, DNR, in addition to ANR JO - FEBS Lett VL - 371 UR - https://doi.org/10.1016/0014-5793(95)00885-D DO - 10.1016/0014-5793(95)00885-D ID - Arai1995 ER - TY - JOUR AU - Schreiber, K. AU - Krieger, R. AU - Benkert, B. AU - Eschbach, M. AU - Arai, H. AU - Schobert, M. AU - Jahn, D. PY - 2007 DA - 2007// TI - The anaerobic regulatory network required for Pseudomonas aeruginosa nitrate respiration JO - J Bacteriol VL - 189 UR - https://doi.org/10.1128/JB.00240-07 DO - 10.1128/JB.00240-07 ID - Schreiber2007 ER - TY - JOUR AU - Vollack, K. U. AU - Härtig, E. AU - Körner, H. AU - Zumft, W. G. PY - 1999 DA - 1999// TI - Multiple transcription factors of the FNR family in denitrifying Pseudomonas stutzeri: characterization of four fnr-like genes, regulatory responses and cognate metabolic processes JO - Mol Microbiol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1999.01302.x DO - 10.1046/j.1365-2958.1999.01302.x ID - Vollack1999 ER - TY - JOUR AU - Finn, R. D. AU - Tate, J. AU - Mistry, J. AU - Coggill, P. C. AU - Sammut, S. J. AU - Hotz, H. R. AU - Ceric, G. AU - Forslund, K. AU - Eddy, S. R. AU - Sonnhammer, E. L. AU - Bateman, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - The Pfam protein families database JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm960 DO - 10.1093/nar/gkm960 ID - Finn2007 ER - TY - JOUR AU - Selengut, J. D. AU - Haft, D. H. AU - Davidsen, T. AU - Ganapathy, A. AU - Gwinn-Giglio, M. AU - Nelson, W. C. AU - Richter, A. R. AU - White, O. PY - 2007 DA - 2007// TI - TIGRFAMs and Genome Properties: tools for the assignment of molecular function and biological process in prokaryotic genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkl1043 DO - 10.1093/nar/gkl1043 ID - Selengut2007 ER - TY - JOUR AU - Tatusov, R. L. AU - Natale, D. A. AU - Garkavtsev, I. V. AU - Tatusova, T. A. AU - Shankavaram, U. T. AU - Rao, B. S. AU - Kiryutin, B. AU - Galperin, M. Y. AU - Fedorova, N. D. AU - Koonin, E. V. PY - 2001 DA - 2001// TI - The COG database: new developments in phylogenetic classification of proteins from complete genomes JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.1.22 DO - 10.1093/nar/29.1.22 ID - Tatusov2001 ER - TY - JOUR AU - Hanahan, D. PY - 1983 DA - 1983// TI - Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids JO - J Mol Biol VL - 166 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(83)80284-8 DO - 10.1016/S0022-2836(83)80284-8 ID - Hanahan1983 ER - TY - JOUR AU - Ruiz-Ponte, C. AU - Cilia, V. AU - Lambert, C. AU - Nicolas, J. L. PY - 1998 DA - 1998// TI - Roseobacter gallaeciensis sp. nov., a new marine bacterium isolated from rearings and collectors of the scallop Pecten maximus JO - Int J Syst Bacteriol VL - 48 UR - https://doi.org/10.1099/00207713-48-2-537 DO - 10.1099/00207713-48-2-537 ID - Ruiz-Ponte1998 ER - TY - JOUR AU - Wagner-Döbler, I. AU - Rheims, H. AU - Felske, A. AU - El-Ghezal, A. AU - Laatsch, H. AU - Lang, S. AU - Pukall, P. AU - Tindall, B. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Oceanibulbus indolifex, gen. nov., sp. nov., a North Sea Alphaproteobacterium producing bioactive metabolites JO - Int J System Evol Microbiol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.02850-0 DO - 10.1099/ijs.0.02850-0 ID - Wagner-Döbler2004 ER - TY - JOUR AU - Allgaier, M. AU - Uphoff, H. AU - Wagner-Döbler, I. PY - 2003 DA - 2003// TI - Aerobic anoxygenic photosynthesis in Roseobacter clade bacteria from diverse marine habitats JO - Appl Environ Microbiol VL - 69 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.69.9.5051-5059.2003 DO - 10.1128/AEM.69.9.5051-5059.2003 ID - Allgaier2003 ER - TY - JOUR AU - Scholz, P. AU - Haring, V. AU - Wittmann-Liebold, B. AU - Ashman, K. AU - Bagdasarian, M. AU - Scherzinger, E. PY - 1989 DA - 1989// TI - Complete nucleotide sequence and gene organization of the broad-host-range plasmid RSF1010 JO - Gene VL - 75 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(89)90273-4 DO - 10.1016/0378-1119(89)90273-4 ID - Scholz1989 ER - TY - JOUR AU - Fürste, J. P. AU - Pansegrau, W. AU - Frank, R. AU - Blöcker, H. AU - Scholz, P. AU - Bagdasarian, M. AU - Lanka, E. PY - 1986 DA - 1986// TI - Molecular cloning of the plasmid RP4 primase region in a multi-host-range tacP expression vector JO - Gene VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/0378-1119(86)90358-6 DO - 10.1016/0378-1119(86)90358-6 ID - Fürste1986 ER -