Lxc-IS | IS length (bp) | Tpase length (aa)a | IRs | DR (host sequence) | Minimal no of copies | IS familyb | Most related Lxx-IS |
---|---|---|---|---|---|---|---|
IS1237 | 899/798 | 218 | 5' GAGGTGGTTTCAGTAGTCG 3' GAGATGGTTTCAGTAGTCGc | TTA (TAA) | 26 | IS5 | ISLxx6 |
ISLxc1 | 2631 | 262 (istB) | 5' TGTCTGTGTCACTGTTAGCGGGCTCCG GGTTGTCGGAGTTGTCTGGCCCCGGCG 3' TGACTATGTCAAGGCTGGCGGGGACCG GGTTGTCGAAGTTAGTTGGCCCCAGCG | fATCGCC | 2 | IS21 | ISLxx3 |
ISLxc2 | 1105 | 332 | 5' TGTGTTTCTCAGGGACGTTGGT 3' TGTGCTGCTCAGGGACGTTGGT | NCTAGN | 16 | IS481 | ISLxx4 |
ISLxc3 | 1511 | 351 | 5' CTTGGGTTCTAACGGTCGTTGCAACA 3' GGCGGATTCTAGTGGTCGTTGCAACA | - | 8 | IS30 | ISLxx5 |
ISLxc4 | 1311/896 | 380 | 5' GGGTGGGTTCTAACAGTGGTCGCAACAC 3' GGGTGGGTTCTAACAGTGGTCGCAACAC | - | 5 | IS30 | ISLxx5 |