TY - JOUR AU - Peters, R. P. AU - van Agtmael, M. A. AU - Danner, S. A. AU - Savelkoul, P. H. AU - Vandenbroucke-Grauls, C. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - New developments in the diagnosis of bloodstream infections JO - Lancet Infect Dis VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(04)01205-8 DO - 10.1016/S1473-3099(04)01205-8 ID - Peters2004 ER - TY - JOUR AU - Fluit, A. C. AU - Schmitz, F. J. AU - Verhoef, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Frequency of isolation of pathogens from bloodstream, nosocomial pneumonia, skin and soft tissue, and urinary tract infections occurring in European patients JO - Eur J Clin Microbiol Infect Dis VL - 20 ID - Fluit2001 ER - TY - JOUR AU - Kempf, V. A. AU - Trebesius, K. AU - Autenrieth, I. B. PY - 2000 DA - 2000// TI - Fluorescent In situ hybridisation allows rapid identification of microorganisms in blood cultures JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Kempf2000 ER - TY - JOUR AU - Meremikwu, M. M. AU - Nwachukwu, C. E. AU - Asuquo, A. E. AU - Okebe, J. U. AU - Utsalo, S. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Bacterial isolates from blood cultures of children with suspected septicaemia in Calabar, Nigeria JO - BMC Infect Dis VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2334-5-110 DO - 10.1186/1471-2334-5-110 ID - Meremikwu2005 ER - TY - JOUR AU - Shigei, J. T. AU - Shimabukuro, J. A. AU - Pezzlo, M. T. AU - de la Maza, L. M. AU - Peterson, E. M. PY - 1995 DA - 1995// TI - Value of terminal subcultures for blood cultures monitored by BACTEC 9240 JO - J Clin Microbiol VL - 33 ID - Shigei1995 ER - TY - JOUR AU - Vincent, J. L. AU - Sakr, Y. AU - Sprung, C. L. AU - Ranieri, V. M. AU - Reinhart, K. AU - Gerlach, H. AU - Moreno, R. AU - Carlet, J. AU - Le Gall, J. R. AU - Payen, D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sepsis in European intensive care units: results of the SOAP study JO - Crit Care Med VL - 34 UR - https://doi.org/10.1097/01.CCM.0000194725.48928.3A DO - 10.1097/01.CCM.0000194725.48928.3A ID - Vincent2006 ER - TY - JOUR AU - Kocoglu, M. E. AU - Bayram, A. AU - Balci, I. PY - 2005 DA - 2005// TI - Evaluation of negative results of BacT/Alert 3D automated blood culture system JO - J Microbiol VL - 43 ID - Kocoglu2005 ER - TY - JOUR AU - Karahan, Z. C. AU - Mumcuoglu, I. AU - Guriz, H. AU - Tamer, D. AU - Balaban, N. AU - Aysev, D. AU - Akar, N. PY - 2006 DA - 2006// TI - PCR evaluation of false-positive signals from two automated blood-culture systems JO - J Med Microbiol VL - 55 UR - https://doi.org/10.1099/jmm.0.46196-0 DO - 10.1099/jmm.0.46196-0 ID - Karahan2006 ER - TY - JOUR AU - Henry, N. K. AU - McLimans, C. A. AU - Wright, A. J. AU - Thompson, R. L. AU - Wilson, W. R. AU - Washington, J. A. PY - 1983 DA - 1983// TI - Microbiological and clinical evaluation of the isolator lysis-centrifugation blood culture tube JO - J Clin Microbiol VL - 17 ID - Henry1983 ER - TY - JOUR AU - Marlowe, E. M. AU - Gibson, L. AU - Hogan, J. AU - Kaplan, S. AU - Bruckner, D. A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Conventional and molecular methods for verification of results obtained with BacT/Alert Nonvent blood culture bottles JO - J Clin Microbiol VL - 41 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.41.3.1266-1269.2003 DO - 10.1128/JCM.41.3.1266-1269.2003 ID - Marlowe2003 ER - TY - JOUR AU - Reimer, L. G. AU - Wilson, M. L. AU - Weinstein, M. P. PY - 1997 DA - 1997// TI - Update on detection of bacteremia and fungemia JO - Clin Microbiol Rev VL - 10 ID - Reimer1997 ER - TY - JOUR AU - Belgrader, P. AU - Benett, W. AU - Hadley, D. AU - Richards, J. AU - Stratton, P. AU - Mariella, R. AU - Milanovich, F. PY - 1999 DA - 1999// TI - PCR detection of bacteria in seven minutes JO - Science VL - 284 UR - https://doi.org/10.1126/science.284.5413.449 DO - 10.1126/science.284.5413.449 ID - Belgrader1999 ER - TY - JOUR AU - Vincent, J. L. AU - Abraham, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - The last 100 years of sepsis JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 173 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.200510-1604OE DO - 10.1164/rccm.200510-1604OE ID - Vincent2006 ER - TY - JOUR AU - Rivers, E. P. AU - McIntyre, L. AU - Morro, D. C. AU - Rivers, K. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Early and innovative interventions for severe sepsis and septic shock: taking advantage of a window of opportunity JO - CMAJ VL - 173 UR - https://doi.org/10.1503/cmaj.050632 DO - 10.1503/cmaj.050632 ID - Rivers2005 ER - TY - JOUR AU - Yadav, A. K. AU - Wilson, C. G. AU - Prasad, P. L. AU - Menon, P. K. PY - 2005 DA - 2005// TI - Polymerase chain reaction in rapid diagnosis of neonatal sepsis JO - Indian Pediatr VL - 42 ID - Yadav2005 ER - TY - JOUR AU - Turenne, C. Y. AU - Witwicki, E. AU - Hoban, D. J. AU - Karlowsky, J. A. AU - Kabani, A. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Rapid identification of bacteria from positive blood cultures by fluorescence-based PCR-single-strand conformation polymorphism analysis of the 16S rRNA gene JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Turenne2000 ER - TY - JOUR AU - Shang, S. AU - Chen, G. AU - Wu, Y. AU - DU, L. AU - Zhao, Z. PY - 2005 DA - 2005// TI - Rapid diagnosis of bacterial sepsis with PCR amplification and microarray hybridisation in 16S rRNA gene JO - Pediatr Res VL - 58 UR - https://doi.org/10.1203/01.PDR.0000169580.64191.8B DO - 10.1203/01.PDR.0000169580.64191.8B ID - Shang2005 ER - TY - JOUR AU - Peters, R. P. AU - Savelkoul, P. H. AU - Simoons-Smit, A. M. AU - Danner, S. A. AU - Vandenbroucke-Grauls, C. M. AU - van Agtmael, M. A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Faster identification of pathogens in positive blood cultures by fluorescence in situ hybridisation in routine practice JO - J Clin Microbiol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.44.1.119-123.2006 DO - 10.1128/JCM.44.1.119-123.2006 ID - Peters2006 ER - TY - JOUR AU - Mothershed, E. A. AU - Whitney, A. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Nucleic acid-based methods for the detection of bacterial pathogens: present and future considerations for the clinical laboratory JO - Clin Chim Acta VL - 363 UR - https://doi.org/10.1016/j.cccn.2005.05.050 DO - 10.1016/j.cccn.2005.05.050 ID - Mothershed2006 ER - TY - JOUR AU - Martineau, F. AU - Picard, F. J. AU - Ke, D. AU - Paradis, S. AU - Roy, P. H. AU - Ouellette, M. AU - Bergeron, M. G. PY - 2001 DA - 2001// TI - Development of a PCR assay for identification of staphylococci at genus and species levels JO - J Clin Microbiol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.39.7.2541-2547.2001 DO - 10.1128/JCM.39.7.2541-2547.2001 ID - Martineau2001 ER - TY - JOUR AU - Lehner, A. AU - Loy, A. AU - Behr, T. AU - Gaenge, H. AU - Ludwig, W. AU - Wagner, M. AU - Schleifer, K. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Oligonucleotide microarray for identification of Enterococcus species JO - FEMS Microbiol Lett VL - 246 UR - https://doi.org/10.1016/j.femsle.2005.04.002 DO - 10.1016/j.femsle.2005.04.002 ID - Lehner2005 ER - TY - JOUR AU - Aoki, S. AU - Hirakata, Y. AU - Miyazaki, Y. AU - Izumikawa, K. AU - Yanagihara, K. AU - Tomono, K. AU - Yamada, Y. AU - Tashiro, T. AU - Kohno, S. AU - Kamihira, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Detection of Legionella DNA by PCR of whole-blood samples in a mouse model JO - J Med Microbiol VL - 52 UR - https://doi.org/10.1099/jmm.0.04999-0 DO - 10.1099/jmm.0.04999-0 ID - Aoki2003 ER - TY - JOUR AU - Rantakokko-Jalava, K. AU - Nikkari, S. AU - Jalava, J. AU - Eerola, E. AU - Skurnik, M. AU - Meurman, O. AU - Ruuskanen, O. AU - Alanen, A. AU - Kotilainen, E. AU - Toivanen, P. AU - Kotilainen, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Direct amplification of rRNA genes in diagnosis of bacterial infections JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Rantakokko-Jalava2000 ER - TY - JOUR AU - Hackett, S. J. AU - Guiver, M. AU - Marsh, J. AU - Sills, J. A. AU - Thomson, A. P. AU - Kaczmarski, E. B. AU - Hart, C. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Meningococcal bacterial DNA load at presentation correlates with disease severity JO - Arch Dis Child VL - 86 UR - https://doi.org/10.1136/adc.86.1.44 DO - 10.1136/adc.86.1.44 ID - Hackett2002 ER - TY - JOUR AU - Massi, M. N. AU - Shirakawa, T. AU - Gotoh, A. AU - Bishnu, A. AU - Hatta, M. AU - Kawabata, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Quantitative detection of Salmonella enterica serovar Typhi from blood of suspected typhoid fever patients by real-time PCR JO - Int J Med Microbiol VL - 295 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2005.01.003 DO - 10.1016/j.ijmm.2005.01.003 ID - Massi2005 ER - TY - JOUR AU - van Haeften, R. AU - Palladino, S. AU - Kay, I. AU - Keil, T. AU - Heath, C. AU - Waterer, G. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - A quantitative LightCycler PCR to detect Streptococcus pneumoniae in blood and CSF JO - Diagn Microbiol Infect Dis VL - 47 UR - https://doi.org/10.1016/S0732-8893(03)00129-9 DO - 10.1016/S0732-8893(03)00129-9 ID - van Haeften2003 ER - TY - JOUR AU - Heininger, A. AU - Binder, M. AU - Schmidt, S. AU - Unertl, K. AU - Botzenhart, K. AU - Doring, G. PY - 1999 DA - 1999// TI - PCR and blood culture for detection of Escherichia coli bacteremia in rats JO - J Clin Microbiol VL - 37 ID - Heininger1999 ER - TY - JOUR AU - Bryant, P. A. AU - Venter, D. AU - Robins-Browne, R. AU - Curtis, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Chips with everything: DNA microarrays in infectious diseases JO - Lancet Infect Dis VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(04)00930-2 DO - 10.1016/S1473-3099(04)00930-2 ID - Bryant2004 ER - TY - JOUR AU - Kato-Maeda, M. AU - Gao, Q. AU - Small, P. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Microarray analysis of pathogens and their interaction with hosts JO - Cell Microbiol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1046/j.1462-5822.2001.00152.x DO - 10.1046/j.1462-5822.2001.00152.x ID - Kato-Maeda2001 ER - TY - JOUR AU - Roth, S. B. AU - Jalava, J. AU - Ruuskanen, O. AU - Ruohola, A. AU - Nikkari, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Use of an oligonucleotide array for laboratory diagnosis of bacteria responsible for acute upper respiratory infections JO - J Clin Microbiol VL - 42 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.42.9.4268-4274.2004 DO - 10.1128/JCM.42.9.4268-4274.2004 ID - Roth2004 ER - TY - JOUR AU - Wang, R. F. AU - Beggs, M. L. AU - Erickson, B. D. AU - Cerniglia, C. E. PY - 2004 DA - 2004// TI - DNA microarray analysis of predominant human intestinal bacteria in fecal samples JO - Mol Cell Probes VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.mcp.2004.03.002 DO - 10.1016/j.mcp.2004.03.002 ID - Wang2004 ER - TY - JOUR AU - Yu, S. L. AU - Chen, H. W. AU - Yang, P. C. AU - Peck, K. AU - Tsai, M. H. AU - Chen, J. J. AU - Lin, F. Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Differential gene expression in gram-negative and gram-positive sepsis JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 169 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.200211-1278OC DO - 10.1164/rccm.200211-1278OC ID - Yu2004 ER - TY - JOUR AU - Loy, A. AU - Horn, M. AU - Wagner, M. PY - 2003 DA - 2003// TI - probeBase: an online resource for rRNA-targeted oligonucleotide probes JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg016 DO - 10.1093/nar/gkg016 ID - Loy2003 ER - TY - JOUR AU - Heininger, A. AU - Binder, M. AU - Ellinger, A. AU - Pfisterer, J. AU - Botzenhart, K. AU - Unertl, K. AU - Doering, G. PY - 2004 DA - 2004// TI - Effect of comprehensive validation of the template isolation procedure on the reliability of bacteraemia detection by a 16S rRNA gene PCR JO - Clin Microbiol Infect VL - 10 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2004.00877.x DO - 10.1111/j.1469-0691.2004.00877.x ID - Heininger2004 ER - TY - JOUR AU - Bolstad, B. M. AU - Irizarry, R. A. AU - Astrand, M. AU - Speed, T. P. PY - 2003 DA - 2003// TI - A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/19.2.185 DO - 10.1093/bioinformatics/19.2.185 ID - Bolstad2003 ER - TY - JOUR AU - Bilban, M. AU - Buehler, L. K. AU - Head, S. AU - Desoye, G. AU - Quaranta, V. PY - 2002 DA - 2002// TI - Defining signal thresholds in DNA microarrays: exemplary application for invasive cancer JO - BMC Genomics VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-3-19 DO - 10.1186/1471-2164-3-19 ID - Bilban2002 ER - TY - JOUR AU - Francois, P. AU - Charbonnier, Y. AU - Jacquet, J. AU - Utinger, D. AU - Bento, M. AU - Lew, D. AU - Kresbach, G. M. AU - Ehrat, M. AU - Schlegel, W. AU - Schrenzel, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Rapid bacterial identification using evanescent-waveguide oligonucleotide microarray classification JO - J Microbiol Meth VL - 65 UR - https://doi.org/10.1016/j.mimet.2005.08.012 DO - 10.1016/j.mimet.2005.08.012 ID - Francois2006 ER - TY - JOUR AU - Clarridge, J. E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Impact of 16S rRNA gene sequence analysis for identification of bacteria on clinical microbiology and infectious diseases JO - Clin Microbiol Rev VL - 17 UR - https://doi.org/10.1128/CMR.17.4.840-862.2004 DO - 10.1128/CMR.17.4.840-862.2004 ID - Clarridge2004 ER - TY - JOUR AU - Jordan, J. A. AU - Durso, M. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Real-time polymerase chain reaction for detecting bacterial DNA directly from blood of neonates being evaluated for sepsis JO - J Mol Diagn VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S1525-1578(10)60590-9 DO - 10.1016/S1525-1578(10)60590-9 ID - Jordan2005 ER - TY - JOUR AU - Jordan, J. A. AU - Butchko, A. R. AU - Durso, M. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Use of pyrosequencing of 16S rRNA fragments to differentiate between bacteria responsible for neonatal sepsis JO - J Mol Diagn VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S1525-1578(10)60015-3 DO - 10.1016/S1525-1578(10)60015-3 ID - Jordan2005 ER - TY - JOUR AU - Jansen, G. J. AU - Mooibroek, M. AU - Idema, J. AU - Harmsen, H. J. AU - Welling, G. W. AU - Degener, J. E. PY - 2000 DA - 2000// TI - Rapid identification of bacteria in blood cultures by using fluorescently labeled oligonucleotide probes JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Jansen2000 ER - TY - JOUR AU - Keum, K. C. AU - Yoo, S. M. AU - Lee, S. Y. AU - Chang, K. H. AU - Yoo, N. C. AU - Yoo, W. M. AU - Kim, J. M. AU - Choi, J. Y. AU - Kim, J. S. AU - Lee, G. PY - 2006 DA - 2006// TI - DNA microarray-based detection of nosocomial pathogenic Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii JO - Mol Cell Probes VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/j.mcp.2005.09.001 DO - 10.1016/j.mcp.2005.09.001 ID - Keum2006 ER - TY - JOUR AU - Cleven, B. E. AU - Palka-Santini, M. AU - Gielen, J. AU - Meembor, S. AU - Kronke, M. AU - Krut, O. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identification and characterisation of bacterial pathogens causing bloodstream infections by DNA microarray JO - J Clin Microbiol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.02291-05 DO - 10.1128/JCM.02291-05 ID - Cleven2006 ER - TY - JOUR AU - Paule, S. M. AU - Pasquariello, A. C. AU - Thomson, R. B. AU - Kaul, K. L. AU - Peterson, L. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Real-time PCR can rapidly detect methicillin-susceptible and methicillin-resistant Staphylococcus aureus directly from positive blood culture bottles JO - Am J Clin Pathol VL - 124 UR - https://doi.org/10.1309/6EA3U9V8NCLLGKQN DO - 10.1309/6EA3U9V8NCLLGKQN ID - Paule2005 ER - TY - JOUR AU - Anthony, R. M. AU - Brown, T. J. AU - French, G. L. PY - 2000 DA - 2000// TI - Rapid diagnosis of bacteremia by universal amplification of 23S ribosomal DNA followed by hybridisation to an oligonucleotide array JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Anthony2000 ER - TY - JOUR AU - Al Soud, W. A. AU - Jonsson, L. J. AU - Radstrom, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Identification and characterisation of immunoglobulin G in blood as a major inhibitor of diagnostic PCR JO - J Clin Microbiol VL - 38 ID - Al Soud2000 ER - TY - JOUR AU - Al Soud, W. A. AU - Radstrom, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Purification and characterisation of PCR-inhibitory components in blood cells JO - J Clin Microbiol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.39.2.485-493.2001 DO - 10.1128/JCM.39.2.485-493.2001 ID - Al Soud2001 ER - TY - JOUR AU - Francois, P. AU - Bento, M. AU - Vaudaux, P. AU - Schrenzel, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Comparison of fluorescence and resonance light scattering for highly sensitive microarray detection of bacterial pathogens JO - J Microbiol Methods VL - 55 UR - https://doi.org/10.1016/j.mimet.2003.08.008 DO - 10.1016/j.mimet.2003.08.008 ID - Francois2003 ER - TY - JOUR AU - Liu, W. T. AU - Mirzabekov, A. D. AU - Stahl, D. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Optimisation of an oligonucleotide microchip for microbial identification studies: a non-equilibrium dissociation approach JO - Environ Microbiol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1046/j.1462-2920.2001.00233.x DO - 10.1046/j.1462-2920.2001.00233.x ID - Liu2001 ER - TY - JOUR AU - Peplies, J. AU - Glockner, F. O. AU - Amann, R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Optimisation strategies for DNA microarray-based detection of bacteria with 16S rRNA-targeting oligonucleotide probes JO - Appl Environ Microbiol VL - 69 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.69.3.1397-1407.2003 DO - 10.1128/AEM.69.3.1397-1407.2003 ID - Peplies2003 ER - TY - JOUR AU - Vanderhoeven, J. AU - Pappaert, K. AU - Dutta, B. AU - Van Hummelen, P. AU - Desmet, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - DNA microarray enhancement using a continuously and discontinuously rotating microchamber JO - Anal Chem VL - 77 UR - https://doi.org/10.1021/ac0502091 DO - 10.1021/ac0502091 ID - Vanderhoeven2005 ER - TY - JOUR AU - Brown, T. J. AU - Anthony, R. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - The addition of low numbers of 3' thymine bases can be used to improve the hybridisation signal of oligonucleotides for use within arrays on nylon supports JO - J Microbiol Methods VL - 42 UR - https://doi.org/10.1016/S0167-7012(00)00175-5 DO - 10.1016/S0167-7012(00)00175-5 ID - Brown2000 ER - TY - JOUR AU - Anthony, R. M. AU - Schuitema, A. R. AU - Oskam, L. AU - Klatser, P. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Direct detection of Staphylococcus aureus mRNA using a flow through microarray JO - J Microbiol Methods VL - 60 UR - https://doi.org/10.1016/j.mimet.2004.08.009 DO - 10.1016/j.mimet.2004.08.009 ID - Anthony2005 ER - TY - JOUR AU - Wilson, K. H. AU - Wilson, W. J. AU - Radosevich, J. L. AU - DeSantis, T. Z. AU - Viswanathan, V. S. AU - Kuczmarski, T. A. AU - Andersen, G. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - High-density microarray of small-subunit ribosomal DNA probes JO - Appl Environ Microbiol VL - 68 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.68.5.2535-2541.2002 DO - 10.1128/AEM.68.5.2535-2541.2002 ID - Wilson2002 ER - TY - JOUR AU - McLaughlin, R. W. AU - Vali, H. AU - Lau, P. C. AU - Palfree, R. G. AU - De Ciccio, A. AU - Sirois, M. AU - Ahmad, D. AU - Villemur, R. AU - Desrosiers, M. AU - Chan, E. C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Are there naturally occurring pleomorphic bacteria in the blood of healthy humans? JO - J Clin Microbiol VL - 40 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.40.12.4771-4775.2002 DO - 10.1128/JCM.40.12.4771-4775.2002 ID - McLaughlin2002 ER - TY - JOUR AU - Nikkari, S. AU - McLaughlin, I. J. AU - Bi, W. AU - Dodge, D. E. AU - Relman, D. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Does blood of healthy subjects contain bacterial ribosomal DNA? JO - J Clin Microbiol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.39.5.1956-1959.2001 DO - 10.1128/JCM.39.5.1956-1959.2001 ID - Nikkari2001 ER - TY - JOUR AU - Yu, X. AU - Susa, M. AU - Knabbe, C. AU - Schmid, R. D. AU - Bachmann, T. T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Development and validation of a diagnostic DNA microarray to detect quinolone-resistant Escherichia coli among clinical isolates JO - J Clin Microbiol VL - 42 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.42.9.4083-4091.2004 DO - 10.1128/JCM.42.9.4083-4091.2004 ID - Yu2004 ER - TY - JOUR AU - Grimm, V. AU - Ezaki, S. AU - Susa, M. AU - Knabbe, C. AU - Schmid, R. D. AU - Bachmann, T. T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Use of DNA microarrays for rapid genotyping of TEM beta-lactamases that confer resistance JO - J Clin Microbiol VL - 42 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.42.8.3766-3774.2004 DO - 10.1128/JCM.42.8.3766-3774.2004 ID - Grimm2004 ER - TY - JOUR AU - Ludwig, W. AU - Strunk, O. AU - Westram, R. AU - Richter, L. AU - Meier, H. AU - Yadhukumar AU - Buchner, A. AU - Lai, T. AU - Steppi, S. AU - Jobb, G. AU - Forster, W. AU - Brettske, I. AU - Gerber, S. AU - Ginhart, A. W. AU - Gross, O. AU - Grumann, S. AU - Hermann, S. AU - Jost, R. AU - Konig, A. AU - Liss, T. AU - Lussmann, R. AU - May, M. AU - Nonhoff, B. AU - Reichel, B. AU - Strehlow, R. AU - Stamatakis, A. AU - Stuckmann, N. AU - Vilbig, A. AU - Lenke, M. AU - Ludwig, T. AU - Bode, A. AU - Schleifer, K. H. PY - 2004 DA - 2004// TI - ARB: a software environment for sequence data JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh293 DO - 10.1093/nar/gkh293 ID - Ludwig2004 ER - TY - STD TI - Software CalcOligo. [http://www.calcoligo.org] UR - http://www.calcoligo.org ID - ref60 ER - TY - JOUR AU - Gutenberger, S. K. AU - Giovannoni, S. J. AU - Field, K. G. AU - Fryer, J. L. AU - Rohovec, J. S. PY - 1991 DA - 1991// TI - A phylogenetic comparison of the 16S rRNA sequence of the fish pathogen, Renibacterium salmoninarum, to gram-positive bacteria JO - FEMS Microbiol Lett VL - 61 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1991.tb04339.x DO - 10.1111/j.1574-6968.1991.tb04339.x ID - Gutenberger1991 ER - TY - JOUR AU - Bodrossy, L. AU - Stralis-Pavese, N. AU - Murrell, J. C. AU - Radajewski, S. AU - Weilharter, A. AU - Sessitsch, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Development and validation of a diagnostic microbial microarray for methanotrophs JO - Environ Microbiol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1046/j.1462-2920.2003.00450.x DO - 10.1046/j.1462-2920.2003.00450.x ID - Bodrossy2003 ER - TY - CHAP AU - White, T. J. AU - Bruns, T. AU - Lee, S. AU - Taylor, J. ED - Innis, M. A. ED - Gelfand, D. H. ED - Shinsky, J. J. ED - White, T. J. PY - 1990 DA - 1990// TI - Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics BT - PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications PB - Academic Press CY - San Diego ID - White1990 ER - TY - STD TI - Statistical Software R. [http://www.r-project.org] UR - http://www.r-project.org ID - ref64 ER -