Forward primer (position 70–85) | 5' |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3' |  |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
L. iners | Â | G | T | C | T | G | C | C | T | T | G | A | A | G | A | T | C | G | G | Â | Â |
L. crispatus | Â | A | C | . | . | . | . | . | C | C | A | T | . | . | T | C | T | . | . | Â | Â |
L. gasseri | Â | A | C | . | . | . | . | . | C | A | A | G | . | . | Â | C | T | . | . | Â | Â |
L. jensenii | Â | A | C | . | . | . | . | . | C | . | T | . | . | . | T | C | T | . | . | Â | Â |
L. vaginalis | Â | A | C | . | . | . | . | . | C | . | . | . | . | . | C | G | G | . | . | Â | Â |
Reverse primer (position 228–210) | 5' |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3' |
L. iners | Â | A | C | A | G | T | T | G | A | T | A | G | G | C | A | T | C | A | T | C | Â |
L. crispatus | Â | . | . | . | C | . | . | A | G | C | . | C | T | . | . | . | . | G | . | T | Â |
L. gasseri | Â | . | . | . | C | . | . | A | G | C | . | C | T | . | . | . | . | G | . | T | Â |
L. jensenii | Â | . | . | . | C | . | . | A | G | C | . | C | T | . | . | . | . | G | . | T | Â |
L. vaginalis | Â | . | . | . | C | C | . | A | G | C | . | C | T | . | . | . | . | G | . | T | Â |