TY - JOUR AU - Bush, L. M. AU - Abrams, B. H. AU - Beall, A. AU - Johnson, C. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Index case of fatal inhalational anthrax due to bioterrorism in the United States JO - N Engl J Med VL - 345 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa012948 DO - 10.1056/NEJMoa012948 ID - Bush2001 ER - TY - JOUR AU - Turnbull, P. C. PY - 1999 DA - 1999// TI - Definitive identification of Bacillus anthracis – a review JO - J Appl Microbiol VL - 87 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1999.00876.x DO - 10.1046/j.1365-2672.1999.00876.x ID - Turnbull1999 ER - TY - JOUR AU - Price, L. B. AU - Hugh-Jones, M. AU - Jackson, P. J. AU - Keim, P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Genetic diversity in the protective antigen gene of Bacillus anthracis JO - J Bacteriol VL - 181 ID - Price1999 ER - TY - JOUR AU - Jackson, P. J. AU - Hill, K. K. AU - Laker, M. T. AU - Ticknor, L. O. AU - Keim, P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Genetic comparison of Bacillus anthracis and its close relatives using amplified fragment length polymorphism and polymerase chain reaction analysis JO - J Appl Microbiol VL - 87 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1999.00884.x DO - 10.1046/j.1365-2672.1999.00884.x ID - Jackson1999 ER - TY - JOUR AU - Meselson, M. AU - Guillemin, J. AU - Hugh-Jones, M. AU - Langmuir, A. AU - Popova, I. AU - Shelokov, A. AU - Yampolskaya, O. PY - 1994 DA - 1994// TI - The Sverdlovsk anthrax outbreak of 1979 JO - Science VL - 266 UR - https://doi.org/10.1126/science.7973702 DO - 10.1126/science.7973702 ID - Meselson1994 ER - TY - JOUR AU - Takahashi, H. AU - Keim, P. AU - Kaufmann, A. F. AU - Keys, C. AU - Smith, K. L. AU - Taniguchi, K. AU - Inouye, S. AU - Kurata, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Bacillus anthracis incident, Kameido, Tokyo, 1993 JO - Emerg Infect Dis VL - 10 UR - https://doi.org/10.3201/eid1001.030238 DO - 10.3201/eid1001.030238 ID - Takahashi2004 ER - TY - JOUR AU - Keim, P. AU - Kalif, A. AU - Schupp, J. AU - Hill, K. AU - Travis, S. E. AU - Richmond, K. AU - Adair, D. M. AU - Hugh-Jones, M. AU - Kuske, C. R. AU - Jackson, P. PY - 1997 DA - 1997// TI - Molecular evolution and diversity in Bacillus anthracis as detected by amplified fragment length polymorphism markers JO - J Bacteriol VL - 179 ID - Keim1997 ER - TY - JOUR AU - Vergnaud, G. AU - Denoeud, F. PY - 2000 DA - 2000// TI - Minisatellites: Mutability and Genome Architecture JO - Genome Res VL - 10 UR - https://doi.org/10.1101/gr.10.7.899 DO - 10.1101/gr.10.7.899 ID - Vergnaud2000 ER - TY - JOUR AU - Vergnaud, G. AU - Mariat, D. AU - Apiou, F. AU - Aurias, A. AU - Lathrop, M. AU - Lauthier, V. PY - 1991 DA - 1991// TI - The use of synthetic tandem repeats to isolate new VNTR loci: cloning of a human hypermutable sequence JO - Genomics VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/0888-7543(91)90110-Z DO - 10.1016/0888-7543(91)90110-Z ID - Vergnaud1991 ER - TY - JOUR AU - Moxon, E. R. AU - Rainey, P. B. AU - Nowak, M. A. AU - Lenski, R. E. PY - 1994 DA - 1994// TI - Adaptive evolution of highly mutable loci in pathogenic bacteria JO - Curr Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/S0960-9822(00)00005-1 DO - 10.1016/S0960-9822(00)00005-1 ID - Moxon1994 ER - TY - JOUR AU - Keim, P. AU - Van Ert, M. N. AU - Pearson, T. AU - Vogler, A. J. AU - Huynh, L. Y. AU - Wagner, D. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Anthrax molecular epidemiology and forensics: using the appropriate marker for different evolutionary scales JO - Infect Genet Evol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/j.meegid.2004.02.005 DO - 10.1016/j.meegid.2004.02.005 ID - Keim2004 ER - TY - JOUR AU - Le Flèche, P. AU - Hauck, Y. AU - Onteniente, L. AU - Prieur, A. AU - Denoeud, F. AU - Ramisse, V. AU - Sylvestre, P. AU - Benson, G. AU - Ramisse, F. AU - Vergnaud, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - A tandem repeats database for bacterial genomes: application to the genotyping of Yersinia pestis and Bacillus anthracis JO - BMC Microbiol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-1-2 DO - 10.1186/1471-2180-1-2 ID - Le Flèche2001 ER - TY - JOUR AU - Denoeud, F. AU - Vergnaud, G. PY - 2004 DA - 2004// TI - Identification of polymorphic tandem repeats by direct comparison of genome sequence from different bacterial strains: a Web-based ressource JO - BMC Bioinformatics VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-4 DO - 10.1186/1471-2105-5-4 ID - Denoeud2004 ER - TY - JOUR AU - Keim, P. AU - Price, L. B. AU - Klevytska, A. M. AU - Smith, K. L. AU - Schupp, J. M. AU - Okinaka, R. AU - Jackson, P. J. AU - Hugh-Jones, M. E. PY - 2000 DA - 2000// TI - Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat Analysis Reveals Genetic Relationships within Bacillus anthracis JO - J Bacteriol VL - 182 UR - https://doi.org/10.1128/JB.182.10.2928-2936.2000 DO - 10.1128/JB.182.10.2928-2936.2000 ID - Keim2000 ER - TY - JOUR AU - Le Flèche, P. AU - Fabre, M. AU - Denoeud, F. AU - Koeck, J. L. AU - Vergnaud, G. PY - 2002 DA - 2002// TI - High resolution, on-line identification of strains from the Mycobacterium tuberculosis complex based on tandem repeat typing JO - BMC Microbiol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-2-37 DO - 10.1186/1471-2180-2-37 ID - Le Flèche2002 ER - TY - JOUR AU - Pourcel, C. AU - Andre-Mazeaud, F. AU - Neubauer, H. AU - Ramisse, F. AU - Vergnaud, G. PY - 2004 DA - 2004// TI - Tandem repeats analysis for the high resolution phylogenetic analysis of Yersinia pestis JO - BMC Microbiol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-4-22 DO - 10.1186/1471-2180-4-22 ID - Pourcel2004 ER - TY - JOUR AU - Le Fleche, P. AU - Jacques, I. AU - Grayon, M. AU - Al Dahouk, S. AU - Bouchon, P. AU - Denoeud, F. AU - Nockler, K. AU - Neubauer, H. AU - Guilloteau, L. A. AU - Vergnaud, G. PY - 2006 DA - 2006// TI - Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay JO - BMC Microbiol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-6-9 DO - 10.1186/1471-2180-6-9 ID - Le Fleche2006 ER - TY - JOUR AU - Lindstedt, B. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Multiple-locus variable number tandem repeats analysis for genetic fingerprinting of pathogenic bacteria JO - Electrophoresis VL - 26 UR - https://doi.org/10.1002/elps.200500096 DO - 10.1002/elps.200500096 ID - Lindstedt2005 ER - TY - CHAP AU - Vergnaud, G. AU - Pourcel, C. ED - Stackebrandt, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Multiple Locus VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) Analysis (MLVA) BT - Molecular Identification, Systematics and Population Structure of Prokaryotes UR - https://doi.org/10.1007/978-3-540-31292-5_4 DO - 10.1007/978-3-540-31292-5_4 ID - Vergnaud2006 ER - TY - JOUR AU - Pearson, T. AU - Busch, J. D. AU - Ravel, J. AU - Read, T. D. AU - Rhoton, S. D. AU - U'Ren, J. M. AU - Simonson, T. S. AU - Kachur, S. M. AU - Leadem, R. R. AU - Cardon, M. L. AU - Van Ert, M. N. AU - Huynh, L. Y. AU - Fraser, C. M. AU - Keim, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - Phylogenetic discovery bias in Bacillus anthracis using single-nucleotide polymorphisms from whole-genome sequencing JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0403844101 DO - 10.1073/pnas.0403844101 ID - Pearson2004 ER - TY - JOUR AU - Hoffmaster, A. R. AU - Fitzgerald, C. C. AU - Ribot, E. AU - Mayer, L. W. AU - Popovic, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular subtyping of Bacillus anthracis and the 2001 bioterrorism-associated anthrax outbreak, United States JO - Emerg Infect Dis VL - 8 UR - https://doi.org/10.3201/eid0810.020394 DO - 10.3201/eid0810.020394 ID - Hoffmaster2002 ER - TY - JOUR AU - Fouet, A. AU - Smith, K. L. AU - Keys, C. AU - Vaissaire, J. AU - Le Doujet, C. AU - Levy, M. AU - Mock, M. AU - Keim, P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Diversity among French Bacillus anthracis isolates JO - J Clin Microbiol VL - 40 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.40.12.4732-4734.2002 DO - 10.1128/JCM.40.12.4732-4734.2002 ID - Fouet2002 ER - TY - JOUR AU - Gierczynski, R. AU - Kaluzewski, S. AU - Rakin, A. AU - Jagielski, M. AU - Zasada, A. AU - Jakubczak, A. AU - Borkowska-Opacka, B. AU - Rastawicki, W. PY - 2004 DA - 2004// TI - Intriguing diversity of Bacillus anthracis in eastern Poland – the molecular echoes of the past outbreaks JO - FEMS Microbiol Lett VL - 239 UR - https://doi.org/10.1016/j.femsle.2004.08.038 DO - 10.1016/j.femsle.2004.08.038 ID - Gierczynski2004 ER - TY - JOUR AU - Cheung, D. T. AU - Kam, K. M. AU - Hau, K. L. AU - Au, T. K. AU - Marston, C. K. AU - Gee, J. E. AU - Popovic, T. AU - Van Ert, M. N. AU - Kenefic, L. AU - Keim, P. AU - Hoffmaster, A. R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Characterization of a Bacillus anthracis isolate causing a rare case of fatal anthrax in a 2-year-old boy from Hong Kong JO - J Clin Microbiol VL - 43 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.43.4.1992-1994.2005 DO - 10.1128/JCM.43.4.1992-1994.2005 ID - Cheung2005 ER - TY - JOUR AU - Ryu, C. AU - Lee, K. AU - Hawng, H. J. AU - Yoo, C. K. AU - Seong, W. K. AU - Oh, H. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular characterization of Korean Bacillus anthracis isolates by amplified fragment length polymorphism analysis and multilocus variable-number tandem repeat analysis JO - Appl Environ Microbiol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.8.4664-4671.2005 DO - 10.1128/AEM.71.8.4664-4671.2005 ID - Ryu2005 ER - TY - JOUR AU - Fasanella, A. AU - Van Ert, M. AU - Altamura, S. A. AU - Garofolo, G. AU - Buonavoglia, C. AU - Leori, G. AU - Huynh, L. AU - Zanecki, S. AU - Keim, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular diversity of Bacillus anthracis in Italy JO - J Clin Microbiol VL - 43 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.43.7.3398-3401.2005 DO - 10.1128/JCM.43.7.3398-3401.2005 ID - Fasanella2005 ER - TY - STD TI - The Institute for Genomic Research.http://www.tigr.org/ UR - http://www.tigr.org/ ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - Vergnaud, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - Yersinia pestis genotyping JO - Emerg Infect Dis VL - 11 UR - https://doi.org/10.3201/eid1108.050630 DO - 10.3201/eid1108.050630 ID - Vergnaud2005 ER - TY - JOUR AU - Hoffmaster, A. R. AU - Ravel, J. AU - Rasko, D. A. AU - Chapman, G. D. AU - Chute, M. D. AU - Marston, C. K. AU - De, B. K. AU - Sacchi, C. T. AU - Fitzgerald, C. AU - Mayer, L. W. AU - Maiden, M. C. AU - Priest, F. G. AU - Barker, M. AU - Jiang, L. AU - Cer, R. Z. AU - Rilstone, J. AU - Peterson, S. N. AU - Weyant, R. S. AU - Galloway, D. R. AU - Read, T. D. AU - Popovic, T. AU - Fraser, C. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Identification of anthrax toxin genes in a Bacillus cereus associated with an illness resembling inhalation anthrax JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0402414101 DO - 10.1073/pnas.0402414101 ID - Hoffmaster2004 ER - TY - JOUR AU - Valjevac, S. AU - Hilaire, V. AU - Lisanti, O. AU - Ramisse, F. AU - Hernandez, E. AU - Cavallo, J. D. AU - Pourcel, C. AU - Vergnaud, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - Comparison of minisatellite polymorphisms in the Bacillus cereus complex: a simple assay for large-scale screening and identification of strains most closely related to Bacillus anthracis JO - Appl Environ Microbiol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.11.6613-6623.2005 DO - 10.1128/AEM.71.11.6613-6623.2005 ID - Valjevac2005 ER - TY - JOUR AU - Todd, S. J. AU - Moir, A. J. AU - Johnson, M. J. AU - Moir, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Genes of Bacillus cereus and Bacillus anthracis encoding proteins of the exosporium JO - J Bacteriol VL - 185 UR - https://doi.org/10.1128/JB.185.11.3373-3378.2003 DO - 10.1128/JB.185.11.3373-3378.2003 ID - Todd2003 ER - TY - JOUR AU - Sylvestre, P. AU - Couture-Tosi, E. AU - Mock, M. PY - 2003 DA - 2003// TI - Polymorphism in the collagen-like region of the Bacillus anthracis BclA protein leads to variation in exosporium filament length JO - J Bacteriol VL - 185 UR - https://doi.org/10.1128/JB.185.5.1555-1563.2003 DO - 10.1128/JB.185.5.1555-1563.2003 ID - Sylvestre2003 ER - TY - STD TI - MLVA web-service. ID - ref33 ER - TY - STD TI - GPMS, Genomes, Polymorphism and Minisatellites.http://minisatellites.u-psud.fr/ UR - http://minisatellites.u-psud.fr/ ID - ref34 ER - TY - STD TI - The National Center for Biotechnology Information.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ UR - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ID - ref35 ER - TY - JOUR AU - Hunter, P. R. AU - Gaston, M. A. PY - 1988 DA - 1988// TI - Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity JO - J Clin Microbiol VL - 26 ID - Hunter1988 ER -