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Table 6 A. niger secondary metabolite biosynthetic gene clusters determined by SMURF, antiSMASH and by manual annotation or experimental characterization

From: Comprehensive annotation of secondary metabolite biosynthetic genes and gene clusters of Aspergillus nidulans, A. fumigatus, A. niger and A. oryzae

A. nigercluster summary
  Backbone enzyme SMURF antiSMASH Manual Boundary 1 Boundary 2
An01g01130 cluster An01g01130 An01g01080 - An01g01150 An01g01050 - An01g01220 An01g01110 - An01g01230 FA ECS
An01g06930/ An01g06950 cluster An01g06930 An01g06730 - An01g06950 An01g06770 - An01g07020 An01g06810 - An01g06970 ECS ECS. FA
An01g11770 cluster An01g11770 An01g11740 - An01g11900 An01g11690 - An01g11880 An01g11760 - An01g11830 IGD, ECS ECS, IGD
An02g00210 cluster An02g00210 An02g00150 - An02g00290 An02g00140 - An02g00320 An02g00210 - An02g00260 ECS ECS
An02g00450 cluster An02g00450 An02g00430 - An02g00580 An02g00340 - An02g00540 - n/a n/a
An02g00840 cluster An02g00840 An02g00710 - An02g00860 An02g00740 - An02g00950 An02g00700 - An02g00840 ECS, IGD ECS. FA
An02g05070 cluster An02g05070 An02g05050 - An02g05190 An02g04970 - An02g05170 An02g05050 - An02g05170 ECS ECS
An02g08290 cluster An02g08290 An02g08130 - An02g08370 An02g08210 - An02g08380 An02g08290 - An02g08310 ECS ECS
An02g09430 cluster An02g09430 An02g09420 - An02g09450 An02g09310 - An02g09530 An02g09390 - An02g09430 ECS ECS
An02g10140 cluster An02g10140 An02g10110 - An02g10170 An02g10080 - An02g10200 An02g10140 - An02g10200 ECS FA
An02g14220 cluster An02g14220 An02g14190 - An02g14240 - An02g14170 - An02g14240 ECS ECS
An03g00650 cluster An03g00650 An03g00580 - An03g00790 An03g00530 - An03g00760 - n/a n/a
An03g01820 cluster An03g01820 An03g01750 - An03g01850 An03g01730 - An03g01930 An03g01790 - An03g01820 ECS ECS
An03g03520 cluster An03g03520 An03g03380 - An03g03620 An03g03450 - An03g03600 An03g03490 - An03g03620 ECS ECS, IGD
An03g05140 cluster An03g05140 An03g05050 - An03g05270 An03g05040 - An03g05230 An03g05140 - An03g05170 ECS ECS
An03g05440 cluster An03g05440 An03g05300 - An03g05500 An03g05330 - An03g05540 An03g05430 - An03g05500 ECS ECS
An03g05680 cluster An03g05680 An03g05660 - An03g05800 An03g05600 - An03g05760 An03g05660 - An03g05710 ECS ECS
An03g06010 cluster An03g06010 An03g05810 - An03g06020 An03g05910 - An03g06100 An03g05880 - An03g06020 ECS ECS, IGD
An03g06380 cluster An03g06380 An03g06370 - An03g06520 An03g06310 - An03g06470 An03g06310 - An03g06440 ECS, IGD ECS
An04g01150 cluster An04g01150 An04g01120 - An04g01170 An04g01070 - An04g01230 An04g01080 - An04g01180 ECS ECS
An04g04340 cluster An04g04340 An04g04220 - An04g04520 An04g04280 - An04g04500 An04g04330 - An04g04400 ECS ECS
An04g04380 cluster An04g04380 An04g04340 - An04g04520 - An04g06240 - An04g06320 ECS ECS
An04g06260 cluster An04g06260 An04g06230 - An04g06290 An04g06180 - An04g06370 An04g06240 - An04g06320 ECS ECS
An04g09530 cluster An04g09530 An04g09500 - An04g09650 An04g09420 - An04g09600 An04g09510 - An04g09570 ECS ECS
An04g10030 cluster An04g10030 An04g09890 - An04g10090 An04g09900 - An04g10100 - n/a n/a
An05g01060 cluster An05g01060 An05g01020 - An05g01120 An05g00930 - An05g01140 An05g01060 - An05g01120 ECS ECS
An06g01300 cluster An06g01300 An06g01290 - An06g01410 An06g01200 - An06g01390 An06g01290 - An06g01320 ECS ECS
An07g01030 cluster An07g01030 An07g00900 - An07g01100 An07g00900 - An07g01130 - n/a n/a
An07g02560 cluster An07g02560 An07g02540 - An07g02650 An07g02520 - An07g02620 An07g02510 - An07g02560 ECS ECS
An08g02310 cluster An08g02310 An08g02180 - An08g02330 An08g02210 - An08g02360 An08g02170 - An08g02310 ECS ECS
An08g03790 cluster An08g03790 An08g03610 - An08g03870 An08g03700 - An08g03880 An08g03730 - An08g03790 ECS ECS
An08g04820 cluster An08g04820 An08g04710 - An08g04940 An08g04710 - An08g04900 An08g04790 - An08g04830 ECS ECS
An08g09220 cluster An08g09220 An08g09150 - An08g09400 An08g09140 - An08g09360 - n/a n/a
An08g10930 cluster An08g10930 An08g10880 - An08g11000 - An08g10860 - An08g10930 ECS ECS
An09g00450 cluster An09g00450 An09g00400 - An09g00610 An09g00350 - An09g00610 An09g00390 - An09g00450 ECS ECS
An09g00520 cluster An09g00520 An09g00390 - An09g00620 - An09g00520 - An09g00620 ECS ECS
An09g01290 cluster An09g01290 An09g01140 - An09g01460 An09g01200 - An09g01390 An09g01260 - An09g01340 ECS ECS
An09g01690 cluster An09g01690 An09g01650 - An09g01860 An09g01560 - An09g01800 An09g01630 - An09g01860 ECS ECS
An09g01860/An09g01930 cluster An09g01860 An09g01690 - An09g02020 An09g01740 - An09g02020 An09g01790 - An09g01950 ECS, FA ECS, FA
An09g02100 cluster An09g02100 An09g01980 - An09g02230 An09g01980 - An09g02220 - n/a n/a
An09g05110 cluster An09g05110 An09g04960 - An09g05130 An09g05010 - An09g05180 An09g05060 - An09g05150 ECS ECS
An09g05340 cluster An09g05340 An09g05310 - An09g05360 An09g05270 - An09g05400 An09g05300 - An09g05350 ECS ECS
An09g05730 cluster An09g05730 An09g05710 - An09g05750 An09g05655 - An09g05810 An09g05625 - An09g05730 ECS ECS
An10g00140 cluster An10g00140 An10g00010 - An10g00230 An10g00050 - An10g00240 An10g00100 - An10g00210 ECS ECS
An10g00630 cluster An10g00630 An10g00540 - An10g00700 - An10g00620 - An10g00700 ECS ECS
An11g00050 cluster An11g00050 An11g00030 - An11g00080 An11g00010 - An11g00100 An11g00040 - An11g00080 ECS ECS
An11g00250 cluster An11g00250 An11g00130 - An11g00380 An11g00170 - An11g00350 An11g00250 - An11g00300 ECS ECS
An11g03920 cluster An11g03920 An11g03750 - An11g04040 An11g03820 - An11g04010 An11g03870 - An11g03940 ECS ECS
An11g04280 cluster An11g04280 An11g04140 - An11g04310 An11g04180 - An11g04350 An11g04250 - An11g04320 ECS ECS
An11g05500 cluster An11g05500 An11g05470 - An11g05570 An11g05420 - An11g05560 An11g05480 - An11g05530 ECS ECS, IGD
An11g05570 cluster An11g05570 An11g05440 - An11g05590 An11g05510 - An11g05660 - n/a n/a
An11g05940 cluster An11g05940 An11g05820 - An11g05960 An11g05860 - An11g06060 An11g05940 - An11g05960 ECS ECS
An11g05960 cluster An11g05960 An11g05790 - An11g05980 An11g05860 - An11g06060 An11g05940 - An11g05960 ECS ECS
An11g06460 cluster An11g06460 An11g06420 - An11g06490 An11g06350 - An11g06570 An11g06420 - An11g06490 ECS ECS
An11g07310 cluster An11g07310 An11g07280 - An11g07350 An11g07210 - An11g07460 An11g07270 - An11g07350 ECS ECS
An11g09720 cluster An11g09720 An11g09700 - An11g09740 An11g09620 - An11g09790 - n/a n/a
An12g02670 cluster An12g02670 An12g02650 - An12g02830 An12g02560 - An12g02920 An12g02620 - An12g02750 ECS ECS
An12g02730 cluster An12g02730 An12g02670 - An12g02900 - - n/a n/a
An12g02840 cluster An12g02840 An12g02680 - An12g02880 - - n/a n/a
An12g07070 cluster An12g07070 An12g07050 - An12g07110 An12g06930 - An12g07140 An12g07060 - An12g07110 ECS ECS
An12g07230 cluster An12g07230 An12g07120 - An12g07250 An12g07150 - An12g07330 An12g07220 - An12g07280 ECS ECS
An12g10090 cluster An12g10090 An12g09930 - An12g10220 An12g09980 - An12g10190 An12g10000 - An12g10160 ECS ECS
An12g10860 cluster An12g10860 An12g10840 - An12g10870 An12g10770 - An12g10960 An12g10790 - An12g10860 ECS ECS
An13g01840 cluster An13g01840 An13g01820 - An13g01860 An13g01790 - An13g01880 An13g01810 - An13g01860 ECS ECS
An13g02430 cluster An13g02430 An13g02290 - An13g02540 An13g02350 - An13g02600 An13g02390 - An13g02470 ECS ECS
An13g02460 cluster An13g02460 An13g02400 - An13g02540 - An13g02390 - An13g02480 ECS ECS
An13g02960 cluster An13g02960 An13g02940 - An13g03090 An13g02830 - An13g03120 - n/a n/a
An13g03040 cluster An13g03040 An13g02940 - An13g03110 An13g02830 - An13g03120 - n/a n/a
An14g01910 cluster An14g01910 An14g01850 - An14g01970 An14g01820 - An14g02010 An14g01910 - An14g01960 ECS ECS
An14g04850 cluster An14g04850 An14g04830 - An14g04870 An14g04750 - An14g04940 An14g04830 - An14g04890 ECS ECS
An15g02130 cluster An15g02130 An15g02070 - An15g02190 An15g02040 - An15g02230 An15g02130 - An15g02200 ECS ECS
An15g04140 cluster An15g04140 An15g04120 - An15g04220 An15g04050 - An15g04250 An15g04130 - An15g04150 ECS ECS
An15g05090 cluster An15g05090 An15g05030 - An15g05150 An15g05000 - An15g05180 An15g05090 - An15g05150 ECS ECS
An15g07530 cluster An15g07530 An15g07510 - An15g07600 An15g07400 - An15g07640 An15g07530 - An15g07480 ECS ECS
An15g07910 cluster An15g07910 An15g07830 - An15g07930 An15g07810 - An15g07930 An15g07890 - An15g07920 ECS ECS
An15g07920 cluster An15g07920 An15g07830 - An15g07930 - - n/a n/a
An16g00600 cluster An16g00600 An16g00520 - An16g00740 An16g00460 - An16g00730 An16g00520 - An16g00600 ECS ECS
An16g06720 cluster An16g06720 An16g06570 - An16g06780 An16g06650 - An16g06790 An16g06720 - An16g06750 ECS ECS
An18g00520 cluster An18g00520 An18g00350 - An18g00550 An18g00440 - An18g05820 An18g00460 - An18g00530 ECS ECS
  1. * Experimentally characterized; Abbreviations: ECS, End of cluster synteny; IGD, Increase in intergenic distance; FA, Change in functional annotation; ED, Experimentally determined.
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BMC Microbiology

ISSN: 1471-2180

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