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Table 4 A. nidulans secondary metabolite biosynthetic gene clusters determined by SMURF, antiSMASH and by manual annotation or experimental characterization

From: Comprehensive annotation of secondary metabolite biosynthetic genes and gene clusters of Aspergillus nidulans, A. fumigatus, A. niger and A. oryzae

A. nidulansCluster Summary
  Backbone enzyme SMURF antiSMASH Manual/experimental Boundary 1 Boundary 2 Reference
Asperfuranone (afo) cluster AN1036 AN1029 - AN11288 AN1026 - AN1040 AN1029 - AN1036 ED ED [40]
Asperthecin (apt) cluster AN6000 AN5989 - AN6007 AN5991 - AN6009 AN6000 - AN6002* ED, EP ED, EP [30]
Aspyridone (asp) cluster AN8412 AN8398 - AN8415 AN8404 - AN11609 AN8408 - AN8415* ED ED [41]
Austinol (aus) cluster 1 AN9244 AN9243 - AN9251 AN11817 - AN9254 AN9244 - AN9253 ED, FA ED [31]
Austinol (aus) cluster 2 AN8383 AN8382 - AN8395 AN8377 - AN8390 AN8379 - AN8384* ED, ECS ED, ECS [31]
Derivative of Benzaldehyde1 (dba) and F9775 hybrid cluster 1 AN7909 - AN7895 - AN7919 AN7896 - AN7903* ED ED, EP [34, 42]
Derivative of Benzaldehyde1 (dba) and F9775 hybrid cluster 2   AN7905 - AN7923 AN7895 - AN7919 AN7907 - AN7916* ED ED [34, 42]
Emericellamide (eas) cluster AN2547 AN2544 - AN2553 AN2538 - AN10326 AN2545 - AN2549* ED ED [22]
inp cluster AN3496 AN3491 - AN3506 AN3485 - AN3503 AN3490 - AN3496 EP EP [43]
ivo cluster AN10576 AN10576 - AN4649 AN4637 - AN4649 AN10573 - AN10576 EP EP This study
Microperfuranone (mic) cluster AN3396 AN3391 - AN3408 AN3391 - AN3404 AN3394 - AN3396 EP EP [16]
Monodictyphenone (mdp) cluster AN0150 AN0146 - AN0158 AN11846 - AN0156 AN10021 - AN10023* ED, EP ED, EP [16, 44]
Penicillin cluster AN2621 AN2619 - AN2625 AN2616 - AN10329 AN2621 - AN2623* ED, EP ED, EP [16, 45]
Nidulanin A (nptA) cluster AN11080 - AN8481 - AN8484 AN11082 - AN11080 IGD, FA ECS This study
pkb cluster AN6448 AN6436 - AN6462 AN6438 - AN6455 AN6444 - AN6451 EP EP [16]
pkdA cluster AN0523 AN0520 - AN0533 AN10104 - AN0534 AN0523 - AN0533 ECS ECS This study
pkf cluster AN3230 AN3217 - AN3237 AN3222 - AN3238 AN3225 -AN3230 EP ECS, EP This study
pkg cluster AN7071 AN7061 - AN7075 AN7064 - AN7078 AN10889 - AN7075 EP ECS, EP This study
pkh cluster AN2035 AN2032 - AN2043 AN2029 - AN2042 AN2030 - AN2038 ECS, IGD EP [16]
pki cluster AN3386 AN3380 - AN3386 AN3380 - AN3392 AN3379 - AN3386 ECS ECS This study
Sterigmatocystin (stc) cluster AN7815 AN7806 - AN7824 AN7815 - AN7832 AN7804 - AN7824* ED ED [46]
Terriquinone (tdi) cluster AN8514 AN8506 - AN8516 AN8508 - AN8522 AN8513 - AN8520* ED ED [47]
xptA-containing cluster AN6784 AN6770 - AN6791 AN6780 - AN6786 AN6784 - AN6791 FA, EP FA, EP FA, [16]
xptB-containing cluster AN12402 - AN7996 - AN12431 AN7999 - AN12431 ECS IGD This study
AN0016 cluster AN0016 AN0015 - AN0029 AN10009 - AN0025 AN0015 - AN0029 ECS, IGD FA This study
AN0607 (sidC) cluster AN0607 AN0592 - AN0607 AN0599 - AN0617 AN0607 - AN0609 ECS ECS, IGD This study
AN10289 cluster AN10289 AN10294 - AN2349 AN10294 - AN2347 AN10289 - AN2347 IGD FA, IGD This study
AN10297 cluster AN10297 AN2392 - AN10301 AN2395 - AN10298 AN2396 - AN11337 FA FA This study
AN10396 cluster AN10396 - AN3372 - AN3379 AN3375 - AN10401 ECS ECS, IGD This study
AN10430 cluster AN10430 AN3608 - AN3612 AN10429 - AN10448 AN3609 - AN3612 FA FA This study
AN10486 cluster AN10486 AN3911 - AN3917 AN10485 - AN3917 AN3911 - AN10486 ECS ECS This study
AN11065 cluster AN11065 - AN12204 - AN8263 - n/a n/a n/a
AN11191 cluster AN11191 AN9210 - AN11192 AN9212 - AN12146 AN11191 - AN9220 ECS, EP EP [16]
AN11194 cluster AN11194 AN9223 - AN9236 AN9220 - AN9236 AN8223 - AN9235 EP EP [16]
AN12331 cluster AN12331 AN7836 - AN7837 AN7831 - AN7842 AN7836 - AN7839 FA ECS This study
AN1242 cluster AN1242 AN1242 - AN1243 AN1236 - AN1250 AN1242 - AN1247 ECS, IGD ECS This study
AN1594 cluster AN1594 - - AN1592 - AN1599 EP EP [16]
AN1680 cluster AN1680 AN1677 - AN1691 AN1674 - AN1687 AN1678 - AN1681 ECS ECS This study
AN1784 cluster AN1784 AN1778 - AN1787 AN1776 - AN1790 AN1784 - AN1787 EP EP [16]
AN1793 cluster AN1793 - AN1790 - AN1802 AN1792 - AN1796 FA ECS ECS
AN2064 cluster AN2064 AN2061 - AN2064 AN2057 - AN2068 - n/a n/a n/a
AN2924 cluster AN2924 AN2921 - AN2925 AN2917 - AN2928 AN2921 - AN2924 EP EP [16]
AN3252 cluster AN3252 - - AN3252 - AN3257 EP EP [16]
AN3273 cluster AN3273   AN3267 - AN3285 AN10388 - AN3287 IGD IGD This study
AN3612 cluster AN3612 AN3608 - AN3612 AN10429 - AN10448 AN3605 - AN3612 FA ECS, FA This study
AN4827 cluster AN4827 AN4823 - AN4837 AN11232 - AN4836 AN10600 - AN11232 EP EP [16]
AN5318 cluster AN5318 AN5317 - AN5329 AN5312 - AN5325 AN5314 - AN5318 ECS ECS This study
AN5475 cluster AN5475 - - - n/a n/a n/a
AN5610 cluster AN5610 - AN5607 - AN5616 AN9473 - AN5610 ECS, IGD FA This study
AN6236 cluster AN6236 AN6236 - AN6238 AN6230 - AN11851 AN6234 - AN6236 ECS, EP ECS, EP ECS, [16]
AN6431 cluster AN6431 AN6429 - AN6434 AN10818 - AN6437 AN6431 - AN6437 ECS, EP EP [16]
AN6791 cluster AN6791 - AN11527 - AN10846 AN6787 - AN6791 IGD FA This study
AN7084 cluster AN7084 AN7081 - AN7089 AN7077 - AN7089 AN7080 - AN7086 EP EP [16]
AN7489 (mirC) cluster AN7489 AN7485 - AN7493 - AN7485 - AN7493 ECS ECS This study
AN7838 (AN12331) cluster AN7838 AN7836 - AN7839 - AN11024 - AN7839 FA FA This study
AN7884 cluster AN7884 AN7873 - AN7884 AN7879 - AN7892 AN7872 - AN7884 ECS, EP ECS, EP ECS, [16]
AN8105 cluster AN8105 AN8103 - AN8113 AN8098 - AN8113 AN8105 - AN8112 ECS, EP EP [16]
AN8142 cluster AN8142 - AN8133 - AN8147 AN12440 - AN8144 FA ECS This study
AN8209 (wA) cluster AN8209 - AN8202 - AN8214 AN12404 - AN8209 EP ECS, EP ECS, [16]
AN8249 cluster AN8249 - AN11063 - AN11069 - n/a n/a n/a
AN8504 cluster AN8504 - AN8495 - AN8508 AN8495 - AN8504 ECS FA This study
AN8910 cluster AN8910 AN8901 - AN8910 AN8903 - AN8915 AN8905 - AN8910 ECS ECS This study
AN9005 cluster AN9005 AN9002 - AN9013 AN9000 - AN9013 AN9002 - AN9007 EP EP [16]
AN9129 cluster AN9129 - - AN9129 - AN9130 ECS, EP ECS This study
AN9226 cluster AN9226 AN9223 - AN9236 AN9220 - AN9236 AN9223 - AN9234 EP EP [16]
AN9291 (AN11820) cluster AN11820 AN9280 - AN9307 - AN11820 - AN9294 EP ECS This study
AN9314 cluster AN9314 - - AN9313 - AN9314 EP EP [16]
No PKS/NRPS backbone 1 n/a - AN9184 - AN9194 AN9179 - AN9185 ECS ECS This study
No PKS/NRPS backbone 2 n/a - AN10325 - AN11348 - n/a n/a n/a
No PKS/NRPS backbone 3 n/a - AN0650 - AN0659 AN0653 - AN0660 ECS ECS This study
No PKS/NRPS backbone 4 n/a - AN0039 - AN10006 AN0042 - AN0044 EP EP [16]
  1. * Experimentally characterized, Abbreviations: ECS, End of cluster synteny; IGD, Increase in intergenic distance; FA, Change in functional annotation; ED, Experimentally determined; EP, Expression Pattern.
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BMC Microbiology

ISSN: 1471-2180

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