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Table 4 A. nidulans secondary metabolite biosynthetic gene clusters determined by SMURF, antiSMASH and by manual annotation or experimental characterization

From: Comprehensive annotation of secondary metabolite biosynthetic genes and gene clusters of Aspergillus nidulans, A. fumigatus, A. niger and A. oryzae

A. nidulansCluster Summary

 

Backbone enzyme

SMURF

antiSMASH

Manual/experimental

Boundary 1

Boundary 2

Reference

Asperfuranone (afo) cluster

AN1036

AN1029 - AN11288

AN1026 - AN1040

AN1029 - AN1036

ED

ED

[40]

Asperthecin (apt) cluster

AN6000

AN5989 - AN6007

AN5991 - AN6009

AN6000 - AN6002*

ED, EP

ED, EP

[30]

Aspyridone (asp) cluster

AN8412

AN8398 - AN8415

AN8404 - AN11609

AN8408 - AN8415*

ED

ED

[41]

Austinol (aus) cluster 1

AN9244

AN9243 - AN9251

AN11817 - AN9254

AN9244 - AN9253

ED, FA

ED

[31]

Austinol (aus) cluster 2

AN8383

AN8382 - AN8395

AN8377 - AN8390

AN8379 - AN8384*

ED, ECS

ED, ECS

[31]

Derivative of Benzaldehyde1 (dba) and F9775 hybrid cluster 1

AN7909

-

AN7895 - AN7919

AN7896 - AN7903*

ED

ED, EP

[34, 42]

Derivative of Benzaldehyde1 (dba) and F9775 hybrid cluster 2

 

AN7905 - AN7923

AN7895 - AN7919

AN7907 - AN7916*

ED

ED

[34, 42]

Emericellamide (eas) cluster

AN2547

AN2544 - AN2553

AN2538 - AN10326

AN2545 - AN2549*

ED

ED

[22]

inp cluster

AN3496

AN3491 - AN3506

AN3485 - AN3503

AN3490 - AN3496

EP

EP

[43]

ivo cluster

AN10576

AN10576 - AN4649

AN4637 - AN4649

AN10573 - AN10576

EP

EP

This study

Microperfuranone (mic) cluster

AN3396

AN3391 - AN3408

AN3391 - AN3404

AN3394 - AN3396

EP

EP

[16]

Monodictyphenone (mdp) cluster

AN0150

AN0146 - AN0158

AN11846 - AN0156

AN10021 - AN10023*

ED, EP

ED, EP

[16, 44]

Penicillin cluster

AN2621

AN2619 - AN2625

AN2616 - AN10329

AN2621 - AN2623*

ED, EP

ED, EP

[16, 45]

Nidulanin A (nptA) cluster

AN11080

-

AN8481 - AN8484

AN11082 - AN11080

IGD, FA

ECS

This study

pkb cluster

AN6448

AN6436 - AN6462

AN6438 - AN6455

AN6444 - AN6451

EP

EP

[16]

pkdA cluster

AN0523

AN0520 - AN0533

AN10104 - AN0534

AN0523 - AN0533

ECS

ECS

This study

pkf cluster

AN3230

AN3217 - AN3237

AN3222 - AN3238

AN3225 -AN3230

EP

ECS, EP

This study

pkg cluster

AN7071

AN7061 - AN7075

AN7064 - AN7078

AN10889 - AN7075

EP

ECS, EP

This study

pkh cluster

AN2035

AN2032 - AN2043

AN2029 - AN2042

AN2030 - AN2038

ECS, IGD

EP

[16]

pki cluster

AN3386

AN3380 - AN3386

AN3380 - AN3392

AN3379 - AN3386

ECS

ECS

This study

Sterigmatocystin (stc) cluster

AN7815

AN7806 - AN7824

AN7815 - AN7832

AN7804 - AN7824*

ED

ED

[46]

Terriquinone (tdi) cluster

AN8514

AN8506 - AN8516

AN8508 - AN8522

AN8513 - AN8520*

ED

ED

[47]

xptA-containing cluster

AN6784

AN6770 - AN6791

AN6780 - AN6786

AN6784 - AN6791

FA, EP

FA, EP

FA, [16]

xptB-containing cluster

AN12402

-

AN7996 - AN12431

AN7999 - AN12431

ECS

IGD

This study

AN0016 cluster

AN0016

AN0015 - AN0029

AN10009 - AN0025

AN0015 - AN0029

ECS, IGD

FA

This study

AN0607 (sidC) cluster

AN0607

AN0592 - AN0607

AN0599 - AN0617

AN0607 - AN0609

ECS

ECS, IGD

This study

AN10289 cluster

AN10289

AN10294 - AN2349

AN10294 - AN2347

AN10289 - AN2347

IGD

FA, IGD

This study

AN10297 cluster

AN10297

AN2392 - AN10301

AN2395 - AN10298

AN2396 - AN11337

FA

FA

This study

AN10396 cluster

AN10396

-

AN3372 - AN3379

AN3375 - AN10401

ECS

ECS, IGD

This study

AN10430 cluster

AN10430

AN3608 - AN3612

AN10429 - AN10448

AN3609 - AN3612

FA

FA

This study

AN10486 cluster

AN10486

AN3911 - AN3917

AN10485 - AN3917

AN3911 - AN10486

ECS

ECS

This study

AN11065 cluster

AN11065

-

AN12204 - AN8263

-

n/a

n/a

n/a

AN11191 cluster

AN11191

AN9210 - AN11192

AN9212 - AN12146

AN11191 - AN9220

ECS, EP

EP

[16]

AN11194 cluster

AN11194

AN9223 - AN9236

AN9220 - AN9236

AN8223 - AN9235

EP

EP

[16]

AN12331 cluster

AN12331

AN7836 - AN7837

AN7831 - AN7842

AN7836 - AN7839

FA

ECS

This study

AN1242 cluster

AN1242

AN1242 - AN1243

AN1236 - AN1250

AN1242 - AN1247

ECS, IGD

ECS

This study

AN1594 cluster

AN1594

-

-

AN1592 - AN1599

EP

EP

[16]

AN1680 cluster

AN1680

AN1677 - AN1691

AN1674 - AN1687

AN1678 - AN1681

ECS

ECS

This study

AN1784 cluster

AN1784

AN1778 - AN1787

AN1776 - AN1790

AN1784 - AN1787

EP

EP

[16]

AN1793 cluster

AN1793

-

AN1790 - AN1802

AN1792 - AN1796

FA

ECS

ECS

AN2064 cluster

AN2064

AN2061 - AN2064

AN2057 - AN2068

-

n/a

n/a

n/a

AN2924 cluster

AN2924

AN2921 - AN2925

AN2917 - AN2928

AN2921 - AN2924

EP

EP

[16]

AN3252 cluster

AN3252

-

-

AN3252 - AN3257

EP

EP

[16]

AN3273 cluster

AN3273

 

AN3267 - AN3285

AN10388 - AN3287

IGD

IGD

This study

AN3612 cluster

AN3612

AN3608 - AN3612

AN10429 - AN10448

AN3605 - AN3612

FA

ECS, FA

This study

AN4827 cluster

AN4827

AN4823 - AN4837

AN11232 - AN4836

AN10600 - AN11232

EP

EP

[16]

AN5318 cluster

AN5318

AN5317 - AN5329

AN5312 - AN5325

AN5314 - AN5318

ECS

ECS

This study

AN5475 cluster

AN5475

-

-

-

n/a

n/a

n/a

AN5610 cluster

AN5610

-

AN5607 - AN5616

AN9473 - AN5610

ECS, IGD

FA

This study

AN6236 cluster

AN6236

AN6236 - AN6238

AN6230 - AN11851

AN6234 - AN6236

ECS, EP

ECS, EP

ECS, [16]

AN6431 cluster

AN6431

AN6429 - AN6434

AN10818 - AN6437

AN6431 - AN6437

ECS, EP

EP

[16]

AN6791 cluster

AN6791

-

AN11527 - AN10846

AN6787 - AN6791

IGD

FA

This study

AN7084 cluster

AN7084

AN7081 - AN7089

AN7077 - AN7089

AN7080 - AN7086

EP

EP

[16]

AN7489 (mirC) cluster

AN7489

AN7485 - AN7493

-

AN7485 - AN7493

ECS

ECS

This study

AN7838 (AN12331) cluster

AN7838

AN7836 - AN7839

-

AN11024 - AN7839

FA

FA

This study

AN7884 cluster

AN7884

AN7873 - AN7884

AN7879 - AN7892

AN7872 - AN7884

ECS, EP

ECS, EP

ECS, [16]

AN8105 cluster

AN8105

AN8103 - AN8113

AN8098 - AN8113

AN8105 - AN8112

ECS, EP

EP

[16]

AN8142 cluster

AN8142

-

AN8133 - AN8147

AN12440 - AN8144

FA

ECS

This study

AN8209 (wA) cluster

AN8209

-

AN8202 - AN8214

AN12404 - AN8209

EP

ECS, EP

ECS, [16]

AN8249 cluster

AN8249

-

AN11063 - AN11069

-

n/a

n/a

n/a

AN8504 cluster

AN8504

-

AN8495 - AN8508

AN8495 - AN8504

ECS

FA

This study

AN8910 cluster

AN8910

AN8901 - AN8910

AN8903 - AN8915

AN8905 - AN8910

ECS

ECS

This study

AN9005 cluster

AN9005

AN9002 - AN9013

AN9000 - AN9013

AN9002 - AN9007

EP

EP

[16]

AN9129 cluster

AN9129

-

-

AN9129 - AN9130

ECS, EP

ECS

This study

AN9226 cluster

AN9226

AN9223 - AN9236

AN9220 - AN9236

AN9223 - AN9234

EP

EP

[16]

AN9291 (AN11820) cluster

AN11820

AN9280 - AN9307

-

AN11820 - AN9294

EP

ECS

This study

AN9314 cluster

AN9314

-

-

AN9313 - AN9314

EP

EP

[16]

No PKS/NRPS backbone 1

n/a

-

AN9184 - AN9194

AN9179 - AN9185

ECS

ECS

This study

No PKS/NRPS backbone 2

n/a

-

AN10325 - AN11348

-

n/a

n/a

n/a

No PKS/NRPS backbone 3

n/a

-

AN0650 - AN0659

AN0653 - AN0660

ECS

ECS

This study

No PKS/NRPS backbone 4

n/a

-

AN0039 - AN10006

AN0042 - AN0044

EP

EP

[16]

  1. * Experimentally characterized, Abbreviations: ECS, End of cluster synteny; IGD, Increase in intergenic distance; FA, Change in functional annotation; ED, Experimentally determined; EP, Expression Pattern.