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Table 2 Comparison between Brucella product sizes estimated by LabChip GX software (Observed size) and actual sizes obtained by direct sequencing of the PCR product or data available in Genbank (Expected size).

From: High throughput MLVA-16 typing for Brucella based on the microfluidics technology

PCR Locus (UL bps)a Allele Expected size Observed size x ± sb
Singleplex 1 Bruce08 (18) 2 312   
   3 330 346-359 352,63 ± 5,37
   4 348 369-383 376 ± 4,62
   5 366 385-410 399,09 ± 6,58
   6 384 411-434 419,29 ± 6,71
Singleplex 2 Bruce43 (12) 1 170 179-188 183,17 ± 2
   2 182 191-200 196,07 ± 2,32
   3 194   
Singleplex 3 Bruce12 (15) 7 302   
   8 317   
   9 332   
   10 347 359-369 362,8 ± 3,7
   11 362 379-388 384,13 ± 3,64
   12 377 390-400 395,16 ± 3,05
   13 '392 409-420 413 ± 2,55
   14 407 424-433 428,82 ± 3,05
   15 422 434-440 438,25 ± 2,87
   17 452   
Singleplex 4 Bruce18 (8) 3 130 143  
   4 138 150-157 153,57 ± 2,64
   5 146 159-162 160,33 ± 1,37
   6 154 164-176 171,62 ± 2,95
   7 162 178-184 181,65 ± 1,53
   8 170 187-194 191 ± 2,24
   9 178   
Singleplex 5 Bruce11 (63) 2 257 266-270 268 ± 2,82
   3 320 321-344 337,82 ± 4,31
   4 383 407-422 410,52 ± 3,56
   6 509 504-536 515,8 ± 12,52
   8 635 623-649 639,6 ± 8,71
   9 698 680-724 696,67 ± 15,6
   12 887   
   15 1076   
Singleplex 6 Bruce21 (8) 5 140   
   6 148 162  
   7 156 178-179 178,5 ± 0,71
   8 164 180-186 182,55 ± 1,19
   9 172 192-199 194,05 ± 1,94
Singleplex 7 Bruce06 (134) 1 140 151  
   2 274 282-294 285,9 ± 3,33
   3 408 429-454 439,89 ± 6,04
   4 542 518-624 575,4 ± 24,92
Singleplex 8 Bruce42 (125) 1 164 172-198 175,1 ± 3,13
   2 289 279-298 288,88 ± 2,14
   3 414 420-442 428,27 ± 6,18
   4 539 504-569 529,31 ± 14,1
   5 664 642-647 644 ± 2,64
   6 789 695-763 726,4 ± 22,02
   7 914   
Singleplex 9 Bruce45 (18) 2 133   
   3 151 156-169 162.01 ± 1,93
   4 169   
   5 187 196-206 198,95 ± 2,63
Singleplex 10 Bruce55 (40) 1 193 204-209 207,05 ± 1,67
   2 233 243-259 248,36 ± 4,09
   3 273 275-308 282,85 ± 2,5
   4 313 327  
   5 353   
   6 393 418-422 420,25 ± 1,7
   7 433   
Singleplex 11 Bruce30 (8) 2 119 130  
   3 127 132-144 139,29 ± 2,11
   4 135 146-152 148,87 ± 1,7
   5 143 155-160 157,77 ± 1,78
   6 151 165-169 167 ± 2
   7 159 174  
   8 167   
   9 175   
   10 183 205-206 202,25 ± 0,5
   11 191   
   12 199   
Singleplex 12 Bruce04 (8) 2 152 161-164 162.5 ± 2.1
   3 160 169-175 171.6 ± 2
   4 168 177-182 179.1 ± 1.3
   5 176 185-191 187.3 ± 1.8
   6 184 194-198 195.7 ± 1.3
   7 192 201-207 203.4 ± 2.2
   8 200 213-214 213.7 ± 0.6
   9 208 219-222 220.5 ± 2.1
   10 216 241  
   11 224 248-254 250.2 ± 2.4
   12 232   
   13 240   
   14 248   
   15 256   
   17 272   
   18 280   
   19 288   
   20 296   
   22 312   
Singleplex 13 Bruce07 (8) 2 134   
   3 142   
   4 150 150-154 151.9 ± 1.5
   5 158 157-162 159.8 ± 1.4
   6 166 166-171 168.1 ± 1.4
   7 174 175-178 176.8 ± 1
   8 182 183-186 184.4 ± 1.1
   9 190 192-195 195 ± 1.5
   10 198 200  
   11 206   
   12 214   
   13 222   
   14 230   
Singleplex 14 Bruce 09 (8) 3 124 131-140 135,52 ± 2,6
   4 132 147  
   5 140 155-158 156,33 ± 1,52
   6 148 162-167 165,4 ± 1,89
   7 156 172-177 174,42 ± 1,19
   8 164 182-187 184,42 ± 1,61
   9 172 191-198 193,75 ± 2,5
   10 180 201-203 202,12 ± 0,83
   11 188 209-212 210,75 ± 1,25
   12 196 220  
   13 204 228-230 228,66 ± 1,15
   14 212   
   15 220   
   16 228 249-255 252,66 ± 3,21
   17 236   
   18 244 266-271 268,85 ± 1,86
   19 252   
   20 260   
   22 276   
   23 284   
   24 292   
Singleplex 15 Bruce 16 (8) 2 144 153-157 154,9 ± 1,59
   3 152 158-166 163,04 ± 2,38
   4 160 167-172 168,53 ± 1,66
   5 168 177-185 181,52 ± 2
   6 176 186-194 189,83 ± 2,55
   7 184 199-203 200,8 ± 1,4
   8 192 207-209 207,66 ± 1,15
   9 200 216-219 217,37 ± 1,18
   10 208 224-227 224,75 ± 1,5
   11 216 231  
   12 224 242-248 244,75 ± 2,5
   14 240   
   15 248   
Singleplex 16 Bruce 19 (6) 4 79   
   5 85   
   6 91   
   15 145   
   16 151   
   18 163 173-177 175 ± 1,4
   19 169 180-183 182,5 ± 0,5
   20 175 184-188 186 ± 1,8
   21 181 189-193 190,6 ± 1,2
   22 187 194-201 197,9 ± 1,1
   23 193 202  
   25 205   
  1. a Unit Length size
  2. b Arithmetic average (x) ± standard deviation (σ) of the observed sizes